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远洋海鸟近期辐射演化的序列捕获与RAD测序整合补充信息数据集
2025年12月8日 30 21 14
数据集概述 本数据集为远洋海鸟近期辐射演化研究的补充信息，包含序列捕获（UCEs）与双酶切RAD测序（PE-ddRAD）整合分析的相关文件，涉及基因树、系统发育树、样本信息、参数控制文件等，支持解析快速物种形成事件中的系统发育冲突。 文件详解 文档文件： Supplementary_Information.pdf：PDF格式，研究补充说明文档...
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臭虫科系统发育数据集
2025年12月8日 30 139 29
数据集概述 该数据集围绕臭虫科（Cimicidae）的系统发育研究展开，包含基因序列比对文件、单个基因树的贝叶斯分析文档及不同系统发育假设下的时间树图表，为臭虫科的进化关系研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：Data Roth_et_al_Alignment_file.txt，文件格式：TXT...
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PoMo物种树估计算法补充材料数据集
2025年12月8日 30 129 6
数据集概述 本数据集为PoMo（基于等位基因频率的物种树估计算法）相关研究的补充材料，涵盖算法原理、模拟测试结果及与现有方法的性能对比，聚焦解决不完全谱系分选导致的物种树与基因树冲突问题。 文件详解 文件名称: DeMaio_Kosiol_SysBio_2014_online_Supplement.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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有鳞目爬行动物高级系统发育的一致性与冲突数据集_扩展的系统基因组学视角
2025年12月8日 30 204 71
数据集概述 本数据集围绕有鳞目爬行动物（蜥蜴、蛇和蚓螈）的高级系统发育展开，通过基因组规模数据探究系统发育关系中的一致性与冲突问题，分析基因树冲突的来源，并解决17个争议节点中的9个，为进化历史重建提供支持。 文件详解 文件名称: alignments.zip：压缩文件，可能包含用于系统发育分析的序列比对数据。 文件名称:...
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BEAST计算性能与统计准确性及方法比较数据集
2025年12月6日 30 164 16
数据集概述 本数据集围绕多物种溯祖模型下*BEAST方法的计算性能与统计准确性展开，通过模拟研究分析其与其他系统发育方法（如超级矩阵拼接法）的差异，探究基因座数量、分支长度等参数对结果的影响，为贝叶斯物种树估计的实践应用提供数据支持。 文件详解 New Supplementary...
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贝叶斯超级树模型基因组物种树重建数据集
2025年12月6日 30 129 3
数据集概述 该数据集围绕贝叶斯超级树模型展开，用于从全基因组数据中重建物种树，可处理基因树与物种树不一致的多源问题，无需识别直系同源基因或单物种个体，包含模拟数据、果蝇数据及补充图表。 文件详解 文件名称：drosophila.txz，文件格式：.txz，为果蝇相关数据压缩包，包含用于物种树重建的果蝇基因组数据...
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幽灵蛛科系统发育研究补充材料4
2025年12月6日 30 161 38
数据集概述 本数据集为幽灵蛛科系统发育研究的补充材料4，包含基于RAxML方法构建的最大似然树（4+基因树），用于展示排除基因数量不足四的类群后的系统发育关系，支持值说明与图S1一致。 文件详解 文件名称: oo_234252.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 包含图S4（Maximum-likelihood...
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TreeFix基因树错误校正方法数据集
2025年12月5日 30 132 49
数据集概述 本数据集围绕TreeFix方法展开，该方法结合序列数据与物种树信息，用于改进基因树重建。通过最小化基于物种树的代价函数，TreeFix可找到与输入基因树“统计等效”的校正基因树，提升重建准确性。 文件详解 文件名称: supp.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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欧洲鳞翅目DNA条形码基因树物种水平并系与多系性数据集
2025年12月4日 30 139 93
数据集概述 本数据集聚焦欧洲鳞翅目COI条形码序列数据，通过"Monophylizer"工具检测4977个物种、41583个标本的基因树非单系性，分析建树方法、采样等因素的影响，为DNA条形码物种界定研究提供数据支持。 文件详解 ML trees.zip：压缩文件，可能包含使用最大似然法构建的基因树数据文件...
