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Nature_Ecology_Evolution_碳水化合物复杂性对肠道菌群稳定性影响研究数据
数据集概述 本数据集为2022年发表于《Nature Ecology and Evolution》的研究配套数据,围绕碳水化合物复杂性对合成人类肠道菌群生长及扰动敏感性的影响展开。包含基因测序处理代码、分类学文件、数据库文件及图表数据,共13个文件,支持肠道微生物生态系统的相关分析。 文件详解 代码文件(.py格式,共7个)...
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Oregon_Biodiversity_Genome_Project_俄勒冈鱼类有丝分裂基因组参考数据库数据
数据集概述 本数据集为俄勒冈生物多样性基因组项目产出的鱼类有丝分裂基因组参考数据库,包含313个标本的完整有丝分裂基因组序列,覆盖俄勒冈州24科55属129种淡水、溯河洄游及河口鱼类。数据用于评估有丝分裂基因组在物种鉴定中的价值,为eDNA监测提供区域参考,助力生物多样性管理。 文件详解 文档文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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µgreen_db光合微生物23S_rRNA基因参考数据库
数据集概述 该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库(µgreen-db),用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索,包含约两千余条23S rRNA序列,覆盖四百余种属的光合微生物,可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。 文件详解 数据库压缩包文件:...
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中国土壤新种潘氏玛拉克酵母_Mrakia_panshiensis_sp_nov_及北极玛拉克酵母有性阶段描述中的表2数据
数据集概述 本数据集为科学论文中的表2内容,记录了用于分子系统发育分析的序列信息,包含不同玛拉克酵母(Mrakia)物种的菌株编号、ITS序列和D1/D2序列,其中加粗条目为该研究新生成的数据,为酵母分类学研究提供基础序列数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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海洋线虫元条形码参考数据集评估补充材料9_2016
数据集概述 本数据集为海洋线虫元条形码研究的补充材料,包含基于完整数据集Clustal-O比对构建的最大似然树图像文件,用于支持树基分类学分配方法中参考数据集的评估研究。 文件详解 文件名称: oo_85402.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 基于完整数据集Clustal-...
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海洋线虫DNA宏条形码参考数据集评估补充材料24
数据集概述 本数据集是《海洋线虫DNA宏条形码研究》的补充材料,包含基于"过滤"数据集的Clustal-W比对构建的最大似然树图像,用于评估树状分类学分配方法中参考数据集的应用效果。 文件详解 文件名称: oo_85421.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 该文件为一张图片,展示了通过Clustal-...



