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nmpro_x1311_PDB_5RFG_SARS_CoV_2_主蛋白酶与_PCM_0102372_复合物的原始衍射数据
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与小分子PCM-0102372复合物的原始衍射数据，对应ID为mpro-x1311及PDB编号5RFG。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线在XChem晶体学片段筛选实验中采集，原始数据可供重新分析使用。 文件详解 文件名称：mpro-x1311.zip 文件格式：ZIP...
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nmpro_x0967_PDB_5RG1_SARS_CoV_2_主蛋白酶与_NCL_00024905_复合物的原始衍射数据
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物NCL-00024905形成复合物的原始X射线衍射数据，对应ID为mpro-x0967及PDB ID 5RG1。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线采集，属于XChem晶体学片段筛选项目的一部分，可支持对该复合物结构的重新分析。 文件详解...
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A2A腺苷受体ABEL_FRET数据与分析脚本
数据集概述 该数据集包含A2A腺苷受体的ABEL-FRET实验数据及配套分析脚本，用于研究脂质纳米盘中未固定受体的构象动力学，支持相关结构动态测量研究的数据验证与复现。 文件详解 文件名称: ABEL-FRET data for A2A Adenosine Receptor with analysis scripts.zip 文件格式: ZIP压缩包...
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ChemoDOTS网络服务器数据文件
数据集概述 本数据集包含与ChemoDOTS网络服务器相关的文件，涵盖化学功能、化学反应列表及构建模块等内容，为化学信息学研究和药物设计相关工作提供数据支持。 文件详解 文件名称：ChemoDOTS_list_of_chemical_functions.xlsx，格式：xlsx，内容：ChemoDOTS网络服务器识别的化学功能列表及对应的SMILES...
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UBTR012574化学系列扩展数据集II
数据集概述 该数据集围绕UBTR012574化学系列的扩展展开，包含针对USP5锌指泛素结合域（ZnF-UBD）的分子对接模拟数据，用于优先化合物合成的研究。 文件详解 UBTR012574.pdb：PDB格式文件，可能为UBTR012574的分子结构数据...
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RXR_RAR基因调控的分子动力学与随机建模整合数据集
数据集概述 该数据集围绕RXR-RAR核受体系统的基因调控机制展开，整合原子分子动力学（MD）模拟与随机建模方法，探究配体诱导的变构通讯、受体动力学及DNA识别，揭示分子尺度互作与长时程调控动态的关联。 文件详解 文件名称: data_naresh.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明: 压缩包内包含支持RXR-...
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Hsp70肽分子动力学优化数据集
数据集概述 该数据集包含与“Hsp70肽分子动力学优化”相关的压缩文件，核心内容围绕蛋白质伴侣网络多靶点肽调节剂设计展开，为研究Hsp70肽复合物的分子动力学优化提供数据支持。 文件详解 文件名称: MD HSP70.zip 文件格式: .zip（压缩文件） 内容说明:...
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痤疮治疗潜在替代药物研究补充材料2023
数据集概述 该数据集为研究论文《De novo design of pimarane diterpenoid compounds as potential alternatives to sarecycline for acne vulgaris...
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N_杂环卡宾作为198Au_I_放射性标记化合物配体的原始源数据
数据集概述 本数据集为2025年发表于JMC期刊的相关论文配套原始源数据，围绕N-杂环卡宾作为198Au(I)放射性标记化合物配体的研究主题，提供论文研究的基础数据支持。 文件详解 文件名称：Zenodo files.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：包含论文研究相关的原始源数据，具体文件结构及字段需解压后查看，无README或内容预览提供...
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人源细胞周期蛋白依赖性激酶12激酶结构域目标支持包
数据集概述 本数据集为目标支持包（TEP），聚焦人源细胞周期蛋白依赖性激酶12（CDK12）的激酶结构域，包含其与CycK复合物的3种晶体结构、激酶活性测定数据及抑制剂THZ531的相关研究信息。 文件详解 文件名称：CDK12_TEP_v9.pdf 文件格式：PDF 内容说明：包含CDK12/CycK复合物的晶体结构数据（apo、AMP-...
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组蛋白脱乙酰酶6抑制剂结合相关蛋白质结构域运动数据集
数据集概述 该数据集包含组蛋白脱乙酰酶6（HDAC6）作为受体，贝利司他（belinostat）和HPOB作为配体的分子对接研究相关文件，支持DockIT软件的自动化交互对接实验，可复现研究结果。 文件详解 文件名称: Iakovou_et_al_JCAMD_Data.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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超长链脂肪酸延伸蛋白7靶点赋能包
数据集概述 本数据集聚焦超长链脂肪酸延伸蛋白7（ELOVL7），提供其靶点赋能包（TEP）信息。ELOVL家族催化长链脂肪酸延伸的限速步骤，缺陷与遗传疾病相关。该TEP含酶家族首个结构信息，结合突变及生物物理研究，揭示底物与产物在活性位点的结合机制。 文件详解 文件名称: ELOVL7 TEP_v1.pdf 文件格式: PDF（.pdf） 文件内容:...
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褐藻Turbinaria_ornata来源的螺旋内酯A_C理化与药代动力学参数表3
数据集概述 本数据集为褐藻Turbinaria ornata中分离的螺旋内酯A-C（抗高血压螺酮类化合物）的理化与药代动力学参数表（Table 3），包含分子式、分子量、拓扑极性表面积、亲脂性、水溶性、胃肠道吸收等关键指标，用于评估化合物的药物潜力。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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DPAGT1靶标启用包数据集
数据集概述 本数据集围绕内质网整合膜酶DPAGT1展开，包含其结构解析、突变分析、抑制剂研究及活性/热稳定性检测方法等内容，涉及DPAGT1与相关疾病（如CMS、CDG1j、口腔癌）的关联数据。 文件详解 文件名称：DPAGT1_TEP_datasheet_v1.pdf 文件格式：PDF (.pdf)...
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鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制分子动力学模拟数据集
数据集概述 本数据集包含鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制研究的分子动力学模拟快照及力场拓扑文件。核心内容为模拟得到的三种结合模式（ROT1、pre-redox、ROT2）的蛋白质-配体结构，以及GROMACS格式的鱼藤酮及其衍生物的力场参数文件，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 分子模拟快照文件（位于configurations/目录下）:...
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酵母拓扑异构酶1与Rpc82交互作用数据集
数据集概述 该数据集围绕酵母拓扑异构酶1（yTop1）与Rpc82蛋白的交互作用展开，包含分子结构模型、分子对接及模拟相关数据，为研究二者相互作用机制提供支持。 文件详解 README.txt：文本格式，说明数据与软件可用性，介绍各压缩包内的分子结构、模型质量评估等文件内容。...
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人类TMEM16K_ANO10_靶标赋能包数据集
数据集概述 本数据集聚焦哺乳动物TMEM16/Anoctamin家族蛋白中的TMEM16K（ANO10），包含其结构解析（X射线晶体学、冷冻电镜）、功能验证（脂质 scramblase活性、离子通道特性）及细胞定位等研究内容，为该蛋白相关疾病（如SCAR10）的机制研究与药物设计提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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硼酸抑制剂与NDM_1金属β_内酰胺酶平衡几何构型数据集
数据集概述 该数据集包含硼酸抑制剂的二维结构图像，以及NDM-1金属β-内酰胺酶与抑制剂复合物的平衡几何构型计算数据，为研究酶与抑制剂相互作用的分子结构提供支持。 文件详解 文件名称：cpd-table.png 文件格式：PNG 内容说明：展示所研究硼酸抑制剂的二维结构图像 文件名称：NDM-1_cpd_complexes.rar...
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数据5_HT1AR受体与不同拮抗剂结合机制研究数据集
数据集概述 本数据集包含5-HT1AR受体与Lecozotan、NAD299等七种拮抗剂结合的分子动力学（MD）模拟输入文件及参数文件，为研究受体与拮抗剂结合机制提供原始数据支持。 文件详解 文件列表：共7个ZIP格式压缩文件，分别对应不同模拟系统 SDZ216-525.zip：SDZ216-525拮抗剂系统的MD模拟输入及参数文件...
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USP5锌指泛素结合域与化合物UBTR012574a共晶结构数据集
数据集概述 该数据集围绕USP5锌指泛素结合域（ZnF-UBD）与化合物UBTR012574a的共晶结构研究，包含晶体生长、结构解析相关的实验数据、结构文件及分析结果，为探究配体与结合口袋的相互作用及预测结合构象与实验构象的一致性提供数据支持。 文件详解 蛋白质结构文件：...
