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ligands_top500_data_4jq7蛋白候选化合物筛选数据
数据集概述 本数据集包含4jq7蛋白的一千个重组分子对接后的top500候选化合物信息,候选化合物基于kinfraglib九百万分子库筛选得出,可用于药物研发领域中4jq7蛋白相关的分子筛选研究,仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:ligands_top500_data.json 文件格式:JSON...
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D2R_GPCR_Viz_Based_GPCR二聚体界面接触动态数据
数据集概述 本数据集记录了多巴胺受体D2(D2R)同源二聚体不同激活状态(非活性、活性、 arrestin结合态)下的界面接触动态信息,包含氢键、π-阳离子、π-堆积等相互作用类型。通过分子动力学模拟跟踪界面残基接触,可通过指定平台可视化动态变化,支持GPCR二聚体结构机制研究。 文件详解 文件类型:JSON格式文件,共27个...
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MSP7_Plasmodium_蛋白功能分化分子进化分析数据2016
数据集概述 本数据集围绕疟原虫裂殖子表面蛋白7(MSP7)基因家族展开,包含其分子进化与系统发育分析相关数据。通过对12种疟原虫基因组中MSP7家族的研究,揭示基因扩张收缩、选择压力变化及功能分化特征,为理解MSP7在寄生虫入侵中的作用提供支持。 文件详解 文件名称:Garzón-Ospina et al.,- 2016 - BMC...
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DrugCentral_Source_药物作用机制靶点数据库_第一版
数据集概述 本数据集为药物作用机制靶点数据库的首次发布,内容来源于2016年3月版的DrugCentral数据库,核心记录药物与作用靶点的关联机制信息,为生物医药领域研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:drugtarget-v1.0.zip 文件格式:ZIP...
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GSK_TCAMS_TB_抗结核药物发现化合物及靶点预测数据2015
数据集概述 本数据集源自GSK Tres Cantos抗结核化合物库(TCAMS-TB)的二次筛选,包含50种经理化特性与抗结核活性优先排序的药物样化合物,以及通过三种计算生物学算法预测的潜在作用靶点,旨在为开源抗结核药物发现提供新型化合物及靶点假设支持。 文件详解 文件名称:TBset all data - article Rebollo et al...
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ProteinSci_Host_pathogen_结构预测蛋白互作数据
数据集概述 本数据集包含通过结构预测方法获得的宿主(人类)与10种病原体的蛋白互作预测结果,涉及分枝杆菌、顶复门和动质体目等病原体物种。数据集提供原始预测及经过生物和网络水平过滤后的互作信息,支持蛋白互作研究与分析。 文件详解 原始预测文件(.all.zip)...
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AaPilA_Based_口腔致病菌IV型菌毛计算模型结构数据2022
数据集概述 本数据集包含口腔致病菌伴放线聚集杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans)IVa型菌毛蛋白PilA的计算建模结构。通过分子动力学模拟和GalaxyGemini服务器预测了全长单体、N端截短单体及14聚体的三维结构,为理解该菌毛的分子结构提供参考。数据集含2个文件,涵盖建模结果的说明与归档文件。...
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PARK_ET_AL_DATA_吡喹酮作用寄生扁虫离子通道机制研究数据
数据集概述 本数据集为支持论文《Mechanism of praziquantel action at a parasitic flatworm ion channel》的研究数据,包含吡喹酮作用于寄生扁虫离子通道的相关实验数据,共1个文件,用于揭示吡喹酮的药理作用机制。 文件详解 文件名称:PARK ET AL DATA.xlsx 文件格式:XLSX...
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COVID_CDR_Based新冠病毒药物组合重定位与作用机制研究资源
数据集概述 本数据集是COVID-CDR平台的支撑数据资源,聚焦新冠病毒(SARS-CoV-2)感染的组合药物重定位及作用机制研究。通过网络分析方法整合药物、靶点、蛋白互作等多维度信息,为识别有效单药及协同药物组合提供系统性支持,包含药物信息、网络距离、通路富集、临床/细胞实验组合等16份结构化数据文件。 文件详解 药物基础信息类 文件名称:All...
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Lipidome_GN_Based狼疮小鼠LPS加速肾炎脂质干预实验数据
数据集概述 本数据集为狼疮易感NZBWF1小鼠模型中,通过膳食Omega-3多不饱和脂肪酸补充或可溶性环氧化物水解酶抑制调节脂质组,抑制粗糙型LPS加速肾小球肾炎的实验数据。包含血浆脂质组、自身抗体谱及肾脏基因表达谱等核心实验结果,支持脂质干预对自身免疫性肾病影响的研究。 文件详解...
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Dopamine_PLC_多巴胺促进运动皮层可塑性与运动技能学习实验数据
数据集概述 本数据集为多巴胺通过PLC激活促进运动皮层可塑性与运动技能学习的实验数据,包含大鼠初级运动皮层中多巴胺D1、D2受体通过磷脂酶C(PLC)而非蛋白激酶A(PKA)调控运动技能获取及突触可塑性的相关实验结果,共12个文件,支持验证PLC信号通路在运动学习中的核心作用。 文件详解 .xlsx格式文件(7个) 文件名称:Ctrl-PLCinh...
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Botryococcus_Extract_Based抗炎研究补充材料数据
数据集概述 本数据集为论文“Botryococcus terribilis Ethanol Extract Exerts Anti-inflammatory Effects on Murine RAW264 Cells”的补充材料,包含抗炎机制相关的图表及分析文件,用于支撑Botryococcus terribilis乙醇提取物抗炎作用的研究结论。...
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CoronaCentral_Source_生物医学多类型实体术语列表数据
数据集概述 本数据集为CoronaCentral系统使用的术语列表,包含基因、药物、冠状病毒蛋白、症状等多种生物医学实体的名称、同义词及标识符,共7个JSON文件,用于支持生物医学领域的实体识别与关联分析。 文件详解...
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Mass_Spec_Based_恶性疟原虫蛋白质BioID免疫沉淀质谱数据
数据集概述 本数据集为恶性疟原虫蛋白质的质谱数据,以PF3D7_0201600、PF3D7_0500800、PF3D7_0830600和PF3D7_1476200四种蛋白质为诱饵进行BioID免疫沉淀实验,包含实验相关的质谱检测数据,共一个文件。 文件详解 文件名称:Table S3 - Mass Spec Data for...
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ACVR1蛋白纯化及与LDN_193189等化合物共结晶实验数据_2018
数据集概述 本数据集记录了组成型活性ACVR1蛋白的纯化过程,以及其与LDN-193189和另外三种化合物进行共结晶的相关实验信息,为蛋白质结构研究提供基础实验数据支撑。 文件详解 文件名称:Purification of ACVR1 for co_crystallisation with LDN_193189 31_01_2018_1.docx...
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NMDA_GluN1_GluN2A_亚基配体结合域调控受体早期转运研究数据
数据集概述 本数据集为论文“Distinct regulation of early trafficking of the NMDA receptors by the ligand-binding domains of the GluN1 and GluN2A...
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Adv_Sci_Based_Sclareol天然神经保护剂研究数据2022
数据集概述 本数据集为论文“Identification of Sclareol As a Natural Neuroprotective Cav1.3-Antagonist Using Synthetic Parkinson-Mimetic Gene Circuits and Computer-Aided Drug...
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Supplemental_Based_淋巴瘤细胞系缺氧适应多组学补充数据表
数据集概述 本数据集为淋巴瘤细胞系长期缺氧适应分子机制研究的补充数据表,包含代谢组、转录组差异表达、转录组基因集分析、蛋白质组差异表达及细胞系单核苷酸变异(SNV)特征五个表格文件,记录了Ramos和HBL2细胞系在常氧与缺氧适应状态下的多组学数据及变异信息。 文件详解 Supplemental Data Table - Metabolome.xlsx...
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Zenodo_Based蛋白尿慢性肾病小鼠模型肾皮质RNA测序数据2021
数据集概述 本数据集包含蛋白尿慢性肾病(CKD)小鼠模型肾皮质的RNA测序数据,共2个文件,无目录层级。数据记录了模型组(DIM)和对照组(CTL)小鼠的基因表达原始计数及相关信息,可用于分析蛋白尿CKD小鼠肾组织的基因表达特征与分子机制。 文件详解 文件名称:RNAseq_POD_Zenodo2021.xlsx 文件格式:XLSX...
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hPrP106_145_Based_甘氨酸富集区促进β折叠聚集机制研究数据
数据集概述 本数据集为人类朊病毒蛋白片段hPrP106–145聚集机制研究的分子动力学模拟结果,聚焦甘氨酸富集区作为“分子胶水”促进β折叠结构形成的作用,包含单体构象动态、二聚体β折叠增强及构象熵-能量权衡等核心模拟数据。 文件详解 文件1: 文件名称:Pept-1.zip 文件格式:ZIP...



