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µgreen_db光合微生物23S_rRNA基因参考数据库
数据集概述 该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库(µgreen-db),用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索,包含约两千余条23S rRNA序列,覆盖四百余种属的光合微生物,可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。 文件详解 数据库压缩包文件:...
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海洋线虫宏条形码参考数据集评估补充材料40
数据集概述 本数据集是海洋线虫宏条形码研究的补充材料,包含基于"long"数据集MUSCLE比对构建的最大似然树相关图像,用于评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用。 文件详解 文件名称: oo_85437.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 展示通过MUSCLE比对"long"数据集后推断出的最大似然树的图像文件 数据来源...
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罗马尼亚三个采样点大型无脊椎动物组成概述_2017
数据集概述 该数据集为2017年发表研究的补充材料5,内容是对罗马尼亚三个采样点的淡水大型无脊椎动物组成的概述,为淡水大型无脊椎动物宏条形码研究提供样本站点的生物组成背景数据。 文件详解 文件名称: oo_140193.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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淡水大型无脊椎动物宏条形码补充材料11
数据集概述 本数据集是Vamos E等人2017年关于淡水大型无脊椎动物宏条形码短COI标记研究的补充材料11,内容为DceM样本经fwh1引物组扩增后两个重复样本间的共享读数比例数据,以PDF格式呈现,为该研究提供补充数据支持。 文件详解 文件名称: oo_141128.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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无脊椎动物批量样本湿磨协议补充材料1
数据集概述 本数据集为无脊椎动物批量样本湿磨实验方案的补充材料,包含一份PDF格式的协议文档,用于支持宏条形码和宏基因组学研究中的样本处理流程。 文件详解 文件名称: oo_568785.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 该文档为DIY-DS协议(Protocol...
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海洋线虫宏条形码研究补充材料14
数据集概述 本数据集为海洋线虫宏条形码研究的补充材料,包含基于SILVA比对的完整数据集构建的最大似然树图像文件,用于支持树基分类学分配方法的参考数据集评估研究。 文件详解 文件名称: oo_85407.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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DARN工具COI扩增子数据补充材料3
数据集概述 本数据集为DARN工具研究的补充材料3,包含1张PNG格式的图片文件(Figure S1),用于展示COI扩增子数据相关的可视化内容,为理解该工具处理“已知未知”序列的方法提供辅助说明。 文件详解 文件名称: oo_606567.png 文件格式: PNG(.png) 内容说明: 对应研究中的Figure...
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淡水大型无脊椎动物宏条形码fwh引物梯度PCR优化补充材料
数据集概述 本数据集为淡水大型无脊椎动物宏条形码研究中fwh引物组的梯度PCR优化补充材料,包含相关实验设计与结果文档,支持分子生态学研究中引物验证环节。 文件详解 文件名称:oo_140196.pdf 文件格式:PDF 文件内容:记录fwh引物组的梯度PCR优化实验相关信息,可能包含实验设计、反应条件、结果分析等内容 数据来源 Vamos E,...
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河流大型底栖动物环境压力遗传多样性研究补充材料4
数据集概述 本数据集为河流大型底栖动物对环境压力的种内遗传多样性研究的补充材料,包含一张图表,展示了共享OTU的四个数据集(分为EPT类群和抗污染类群)中每个OTU的平均单倍型数量。 文件详解 文件名称: oo_435378.png 文件格式: PNG (.png) 文件内容: 图表Figure...
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海洋线虫宏条形码参考数据集评估补充材料43
数据集概述 本数据集为海洋线虫宏条形码研究的补充材料,聚焦于树状分类学分配方法中参考数据集的评估,包含基于不同多序列比对的最大似然分析结果,涉及线虫科的分辨率和单系分支的支持度数据。 文件详解 文件名称: oo_96346.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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非破坏性昆虫DNA提取协议评估补充材料4
数据集概述 该数据集为研究论文的补充材料4,聚焦非破坏性昆虫DNA提取协议的评估。核心内容是一个生物信息学流程文档,支持昆虫宏条形码研究中DNA提取方法的优化分析,为相关实验设计与数据处理提供参考。 文件详解 文件名称:oo_702501.pdf 文件格式:PDF(.pdf)...
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三趾鸥与鸬鹚粪便DNA宏条形码饮食分析数据集2023
数据集概述 本数据集包含2023年繁殖季节期间从苏格兰西部收集的三趾鸥和鸬鹚个体粪便样本的DNA宏条形码分析数据,涵盖12S和COI基因标记的原始及过滤后生物信息学结果,以及样本详情和元数据。 文件详解 文件名称: 0_metadata.pdf 文件格式: PDF 内容: 数据集元数据,包含详细描述及使用说明 文件名称: Appendix 2. Raw...
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河流大型底栖动物环境压力响应补充材料2020
数据集概述 本数据集是关于河流大型底栖动物对环境压力响应的补充材料,核心内容为展示样本中水生大型无脊椎动物个体总数与每个OTU平均单倍型数量关系的图表,按季节和河流系统分类呈现。 文件详解 文件名称: oo_435375.png 文件格式: PNG(.png) 内容说明: 图表文件(Figure...
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厄瓜多尔新热带溪流大型无脊椎动物生物评估方法比较补充材料
数据集概述 本数据集为补充材料,支持关于厄瓜多尔新热带溪流大型无脊椎动物形态学与DNA生物评估方法比较的研究。通过单份PDF文件提供研究相关的额外背景信息,为理解不同评估方法的应用提供补充数据支持。 文件详解 文件名称: oo_1262325.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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瑞典Store_Mosse国家公园线虫多样性评估补充材料2
数据集概述 本数据集为瑞典Store Mosse国家公园线虫多样性评估的补充材料,包含一张图片文件,呈现扩增子序列变体(ASVs)的相对丰度信息,支持线虫多样性研究的可视化分析。 文件详解 文件名称: oo_965327.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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海洋线虫宏条形码参考数据集评估补充材料42
数据集概述 该数据集是一篇关于海洋线虫宏条形码研究论文的补充材料,包含通过基于SILVA的比对方法对"长"数据集进行最大似然法构建的系统发育树图像,为评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用提供辅助视觉支持。 文件详解 文件名称: oo_85439.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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河流大型底栖动物单倍型多样性补充材料5
数据集概述 本数据集为河流大型底栖动物相关研究的补充材料,包含一张PNG格式图片,展示了共享OTU的四个数据集按采样点、EPT类群(蜉蝣目、襀翅目、毛翅目)和抗污染类群划分的平均单倍型多样性。 文件详解 文件名称:oo_435379.png 文件格式:PNG(.png)...
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纤毛虫SSU_rDNA参考比对与系统发育树补充材料19
数据集概述 本数据集为纤毛虫SSU-rDNA参考比对与系统发育树研究的补充材料19,包含1份PDF格式的文档,用于支持基于宏条形码数据的系统发育定位分析,提供相关图表等辅助信息。 文件详解 文件名称:oo_583118.pdf 文件格式:PDF 内容说明:该文件为研究的补充材料文档,包含Figure S4等图表内容,用于辅助理解纤毛虫SSU-...
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花粉DNA宏条形码分析辅助材料2
数据集概述 该数据集为花粉DNA宏条形码分析的辅助材料,包含针对不同花粉裂解评估的补充表格(Table S2),以PDF格式呈现,为相关研究提供补充数据支持。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: oo_747764.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容: 包含标题为Table...
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鱼类eDNA宏条形码技术补充材料4
数据集概述 本数据集是一篇关于鱼类eDNA宏条形码技术研究的补充材料,聚焦于野外重复样本对溪流相关脊椎动物物种检测的影响,包含用于辅助理解研究结果的图表文件。 文件详解 文件名称: oo_565970.pdf 文件格式: PDF 文件内容: 研究论文的补充材料4,包含图表S1,用于展示与鱼类eDNA宏条形码技术及溪流脊椎动物物种检测相关的可视化信息。...



