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格式: ZIP 标签: 力场文件

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  • CommunChem_Petermeier_Based生物基苯乙烯衍生物化学酶法合成工艺优化数据2024

    2025年12月31日 30 69 25

    数据集概述 本数据集为生物基苯乙烯衍生物化学酶法合成研究的支持数据，聚焦水活度的连续控制对反应效率的影响。包含实验数据、分子动力学模拟配置、力场文件及核磁共振数据，用于分析底物高负载下酶活性维持机制，实现两步级联合成工艺强化，支撑高效、低废的 lignin 衍生原料增值研究。 文件详解 2024_CommunChem_Petermeier_MD-...
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  • 抑制空化_不溶性表面活性剂在疏水缺陷涂层中的作用_模拟输入数据

    2025年12月22日 30 70 11

    数据集概述 本数据集为压力斜坡分子动力学模拟的输入文件集合，围绕脂质双层、脂质涂层表面及含坑状缺陷的脂质涂层表面展开，用于研究不溶性表面活性剂抑制空化的作用机制，支持相关模拟实验的复现与扩展。 文件详解 文件名称: gromacs_input_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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  • 嵌段比例优化阳离子聚丙烯酰胺电场下硝酸盐截留增强分子动力学模拟数据集

    2025年12月21日 30 132 126

    数据集概述 本数据集包含用于研究嵌段比例优化阳离子聚丙烯酰胺在电场下增强硝酸盐截留性能的分子动力学模拟数据及输入文件，涵盖平衡分子动力学（EMD）和非平衡分子动力学（NEMD）模拟的配置、力场和参数文件，支持复现相关研究结果。 文件详解 该数据集为压缩包格式，内部包含两个核心目录： - EMD/ 目录（平衡MD模拟，GROMACS软件）： -...
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  • 蛋白质空腔与水动力学识别表征工具教程文件_CICLOPv2

    2025年12月19日 30 182 3

    数据集概述 本数据集是CICLOP v2.0工具的教程文件，该工具用于识别和表征蛋白质空腔及其中的水。数据集包含工具代码、示例文件、环境配置文件和教程文档，为使用该Python工具分析分子动力学轨迹或PDB文件提供支持。 文件详解 工具代码文件: CICLOPv2.0_waterdynamics.py: Python格式，CICLOP...
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  • GMX_lipid17力场的Gromacs移植数据集

    2025年12月14日 30 196 133

    数据集概述 本数据集是Amber LIPID17力场向Gromacs平台的移植版本，包含力场文件、拓扑文件及自定义PI头基团文件，支持用户通过Charmm-GUI构建脂质 bilayer并转换原子名称，保留了原力场的模块化特性以自定义头基团或酰基链。 文件详解 文件名称: gmx_lipid17.ff.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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  • 基于NMR_NOE对距离测量的全原子核酸力场精准优化数据集

    2025年12月11日 30 175 118

    数据集概述 本数据集提供两种优化后的全原子核酸力场文件，基于核磁共振NOE对距离测量结果进行精准优化，以GROMACS格式存储，支持分子动力学模拟研究。 文件详解 文件名称：OL3_vdW7.ff.zip，文件格式：ZIP压缩包，包含GROMACS格式的OL3-vdW7核酸力场文件...
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  • 反相液相色谱流动相贡献的分子动力学模拟输入文件数据集

    2025年12月6日 30 29 23

    数据集概述 本数据集包含用于两篇反相液相色谱相关研究论文的分子动力学（MD）模拟输入文件，支持复现研究中所有模拟系统，涉及流动相（含甲醇、乙腈）、分析物及色谱柱孔隙的模拟配置。 文件详解 文件名称: input_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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