找到6个数据集

格式: ZIP 标签: cgMLST

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  • INNUENDO_Based_小肠结肠炎耶尔森氏菌wgMLST与cgMLST数据_2018

    2026年1月12日 30 144 110

    数据集概述 本数据集包含小肠结肠炎耶尔森氏菌的全基因组多位点序列分型(wgMLST)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)方案及相关数据。数据基于2018年8月检索的252个公开基因组和79个INNUENDO项目新菌株,经INNUca组装、chewBBACA处理后形成,含元数据、基因组组装结果、MLST方案文件及等位基因谱。 文件详解 元数据文件...
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  • Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018

    2026年1月12日 30 188 140

    数据集概述 本数据集为沙门氏菌(Salmonella enterica)的cgMLST方案,2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座,用于微生物基因组分型分析,数据集以压缩包形式提供。 文件详解...
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  • Acinetobacter_baumannii_Genomic_Epidemiology_Dataset

    2025年12月31日 30 26 20

    数据集概述 本数据集包含17,546株鲍曼不动杆菌的基因组流行病学分析结果,涵盖多位点序列分型(MLST)、耐药基因、荚膜类型、CRISPR-Cas系统、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)及高风险国际克隆群等关键信息,为细菌耐药性研究和防控措施制定提供支持,共包含8个文件。 文件详解 说明文档类 文件名称:readme.docx...
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  • chewBBACA_Based_生物信息学分步教程完整数据

    2025年12月18日 30 107 3

    数据集概述 本数据集包含chewBBACA软件分步教程所需的数据集及结果。chewBBACA是一套用于创建和验证全基因组及核心基因组多位点序列分型(wg/cgMLST)方案的综合流程工具,为用户提供软件操作的实践数据支持。 文件详解 文件名称: chewBBACA_tutorial.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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  • 圈养低地貘鸟分枝杆菌亚种人型菌株比较基因组学补充材料数据集

    2025年12月16日 30 58 42

    数据集概述 本数据集为圈养低地貘鸟分枝杆菌亚种人型菌株比较基因组学研究的补充材料,包含基因分析表格、测序质量数据、基因组图谱等文件,支持该研究的基因组特征与进化关系分析。 文件详解 数据表格文件(CSV格式,6个): 00_MAH_from_tapirs_in_Germany_data_overview.CSV:数据概述表...
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  • 肺炎克雷伯菌基因组分型与耐药毒力质粒数据集

    2025年12月12日 30 17 15

    数据集概述 本数据集包含61,857株肺炎克雷伯菌基因组的流行病学分析结果,涵盖多位点序列分型、荚膜及寡糖类型、CRISPR-Cas系统、克隆群、耐药基因、毒力因子及质粒复制子等关键信息,为耐药传播研究提供支持。 文件详解 综合汇总文件:...
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