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标签: 无参考基因组

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  • aTRAM_Based_基因组装方法测试数据

    2026年2月1日 30 168 109

    数据集概述 本数据集为aTRAM（自动化目标限制性组装方法）软件的测试数据，包含两个压缩文件。aTRAM用于从下一代测序数据中快速组装不同分类群的基因位点，适用于无近缘参考基因组的分类群，可提升基因组装效率，支持系统基因组学等研究。 文件详解 文件名称：DRYAD_AllTaxon_Alignments.zip 文件格式：ZIP...
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  • GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据

    2026年1月31日 30 127 112

    数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序（GBS）策略优化研究的数据，包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果，涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化，以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试，为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称：9pt-...
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  • Atlantic_silversides_Based_非模式物种群体进化基因组学低覆盖度测序数据

    2026年1月8日 30 185 53

    数据集概述 本数据集提供非模式物种群体基因组学研究的替代策略数据，包含876个大西洋银汉鱼个体条形码样本的低覆盖度全基因组测序方案及分析结果。通过高效文库构建（单样本成本约6.5美元）和无参考基因组的转录组映射方法，获取250万余个SNP的群体等位基因频率、个体基因型可能性等数据，支持群体遗传结构与进化分析。 文件详解...
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  • Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据

    2025年12月28日 30 8 3

    数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...
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