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布氏蹄蝠线粒体基因组系统发育分析模型类型表
2025年12月7日 30 83 69
数据集概述 本数据集为《布氏蹄蝠(蝙蝠科;翼手目)完整线粒体基因组为伏翼属并系性提供新证据》一文的表1,记录了通过IQtree ModelFinder软件为含3个密码子的系统发育树配置的蛋白编码基因分析模型类型,包含13个线粒体基因及对应模型类型。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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脂质组学LC_MS分析离群值检测支持工具数据集
2025年12月7日 30 160 25
数据集概述 本数据集围绕脂质组学LC-MS分析的离群值检测展开,包含人胰腺癌细胞系(PANC-1)脂质提取样本的原始质谱数据、两种软件(MS DIAL与Lipostar)的处理结果,以及用于离群值检测分析的Python代码笔记本,为解决质谱软件输出不一致问题提供数据支持。 文件详解 原始质谱数据文件:...
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数据20基因组合成模拟群落鸟枪法宏基因组测序数据集
2025年12月7日 30 206 74
数据集概述 本数据集包含20个已知参考细菌基因组的合成模拟群落鸟枪法宏基因组测序数据,分为均匀浓度和梯度浓度两种样本,每种样本包含技术重复,用于微生物群落分析方法的开发与验证。 文件详解 文件名称: Data_note_2022-08-29_final.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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北美小棕蝠亚种进化谱系研究数据集
2025年12月7日 30 15 0
数据集概述 该数据集围绕北美小棕蝠(Myotis lucifugus)亚种的进化关系展开,通过基因流分析验证其是否为独立进化谱系,为蝙蝠分类学和种间基因交流研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Dryad_SuppMaterial.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含研究的补充材料,可能涉及实验方法、数据分析流程、图表及结果解释等详细信息。...
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海洋双鞭毛虫形态鉴定与单细胞基因组学数据集
2025年12月6日 30 59 29
数据集概述 该数据集包含海洋双鞭毛虫的形态鉴定与单细胞基因组学研究数据,涉及东太平洋不同深度分离的十个样本,覆盖其全部多样性范围,含组装序列、蛋白编码基因及非规范内含子分析等内容,为该类浮游生物研究提供基础。 文件详解 文件名称: FigS1.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 可能为研究相关的补充图表,提供形态鉴定或分析结果的可视化支持...
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绵羊免疫相关长链非编码RNA转录组学荟萃分析数据集
2025年12月6日 30 163 12
数据集概述 本数据集为绵羊免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)转录组学荟萃分析研究的补充数据,包含lncRNA注释文件、基因表达量数据及研究相关的补充表格与材料,支持对绵羊免疫应答中lncRNA功能的深入分析。 文件详解 基因注释文件(GTF格式): lncrnas.gtf:所有新发现lncRNA转录本的注释文件...
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MG_PDB和MGBench分子胶水三元结构预测基准数据集
2025年12月6日 30 14 8
数据集概述 该数据集为MG-PDB & MGBench基准,包含分子胶水(MGs)三元复合物结构数据,用于评估AlphaFold 3等共折叠方法在分子胶水三元结构预测中的性能,支持相关计算方法的基准测试研究。 文件详解 数据文件: data.xlsx: Excel格式文件,可能包含分子胶水三元复合物结构的核心数据信息。 压缩文件:...
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基于模型的物种界定数据集_合并物种是否存在生殖隔离
2025年12月6日 30 85 77
数据集概述 该数据集围绕基于多物种合并模型的物种界定方法展开实证检验,以果蝇属为研究对象,对比合并模型推断的物种边界与传统生殖隔离标准的一致性,探究生殖隔离程度对物种界定结果的预测作用。 文件详解 文件名称: python_R_scripts.zip,文件格式: ZIP压缩包,包含用于数据分析的Python和R语言脚本文件 文件名称:...
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大力神甲虫物种与亚种分类定量界定数据集
2025年12月6日 0 186 124
数据集概述 本数据集围绕大力神甲虫(Dynastes属)的物种与亚种分类问题展开,通过整合多类型数据的贝叶斯方法进行定量界定,验证物种与亚种分类的统计差异,分析其在物种形成谱上的位置,为分类学研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: SuplementaryFiles.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明:...
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茄科植物124个基因组NLRome数据集
2025年12月6日 30 95 54
数据集概述 该数据集包含从茄科124个植物基因组蛋白质组中提取的66,665条NLR免疫受体序列,覆盖茄属、酸浆属、辣椒属和烟草属等类群,提供NLR蛋白序列及结构域注释,是OpenPlantNLR计划的开放资源。 文件详解 文件名称:Table_1.xlsx,文件格式:XLSX,可能包含数据集的表格信息(如基因组样本列表、统计汇总等)...
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海洋线虫DNA条形码参考数据集评估补充材料27
2025年12月5日 30 91 17
数据集概述 该数据集为海洋线虫DNA条形码研究的补充材料,包含通过PRANK比对"过滤"数据集得到的最大似然树图片,用于评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用效果。 文件详解 文件名称: oo_85424.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明:...
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小鼠近端与远端小肠簇细胞RNA测序分析代码及结果数据集
2025年12月5日 30 127 78
数据集概述 该数据集包含用于比较小鼠近端与远端小肠分选簇细胞的RNA测序分析R代码及结果,与Billipp等人2024年发表于《Immunity》的研究相关,为研究簇细胞功能提供数据支持。 文件详解 文件名称: _ProxDist.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明: 包含RNA测序分析的R代码及结果,具体字段映射未提供预览信息...
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空间与进化尺度下的生物地理推断数据集
2025年12月5日 30 46 37
数据集概述 本数据集围绕生物地理学领域,以西方栅栏蜥蜴为模型物种,整合景观遗传学与系统地理学方法,研究不同空间尺度下的种群遗传推断及进化尺度上的种群结构,分析两者在遗传变异时空结构研究中的关联与一致性。 文件详解 该数据集包含50个文件,覆盖多种数据类型,具体说明如下: - 文档与说明文件: - README.md:...
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贝叶斯拓扑假设检验与潜水甲虫案例数据集
2025年12月4日 30 142 32
数据集概述 本数据集围绕贝叶斯方法在拓扑假设检验中的应用展开,以潜水甲虫(Coleoptera: Dytiscidae)的Suphrodytes和Hydroporus属是否应合并为案例,通过改进的贝叶斯因子检验支持Suphrodytes嵌套于Hydroporus属的结论。包含补充文档、树文件和数据集文件三类资源。 文件详解 Supplementary...
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昆虫相关真菌群落代谢组学研究补充材料3
2025年12月4日 30 140 43
数据集概述 本数据集为昆虫相关真菌群落代谢组学研究的补充材料3,包含基于LSU D1-D2、SSU、ITS2三基因参考序列比对构建的最大似然树(Figure S3),用于比较ITS和LSU rRNA标记的分析结果。 文件详解 文件名称:oo_655184.pdf 文件格式:PDF 内容说明:该文件包含Figure S3,即通过IQ-...
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两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断数据集
2025年12月4日 30 139 44
数据集概述 该数据集包含用于两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断的模拟与分析脚本,支持基因树生成、DNA序列模拟及五种基于溯祖模型的物种树估计方法的数据分析。 文件详解 文件名称:two-step_msc.zip 文件格式:ZIP压缩包 内容说明:压缩包内包含两类脚本,一是模拟脚本(生成带不完全谱系分选的基因树、基于Jukes-...
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越南中部丰芽_格邦国家公园喀斯特地貌角叶守宫属新种系统发育分析结果表
2025年12月4日 30 59 1
数据集概述 该数据集为越南中部丰芽-格邦国家公园喀斯特地貌发现的角叶守宫属新种的系统发育分析结果表,包含九种不同分析方法的对数似然值、平均边缘对数似然值及支持节点数等核心指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...



