找到23个数据集

标签: 生物大分子

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  • 结冷胶聚集两步机制分子起源原始数据

    2026年2月15日 30 102 30

    数据集概述 本数据集为论文《Molecular origin of the two-step mechanism of gellan aggregation》配套的原始数据,聚焦结冷胶聚集两步机制的分子起源研究。数据集仅包含一个压缩文件,未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分,可用于结冷胶聚集过程的分子机制分析。 文件详解...
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  • PDE6_v1_0_Based_生物大分子结构建模数据

    2026年1月31日 30 33 28

    数据集概述 本数据集包含用于演示使用IMP、MODELLER和Chimera工具进行磷酸二酯酶(PDE6)建模的脚本。数据以压缩包形式提供,可支持生物大分子结构建模流程的复现,核心内容为PDE6蛋白质结构建模相关的计算脚本资源。 文件详解 文件名称:pde6-v1.0.zip 文件格式:ZIP...
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  • NSF_SNARE_Based单分子FRET研究原始数据

    2026年1月30日 30 17 8

    数据集概述 本数据集是NC手稿的原始数据,包含5个文件,用于支持单分子双色及三色FRET研究揭示NSF介导SNARE解聚过程中隐藏过渡态的相关分析。数据涵盖不同SNARE组分的FRET实验痕迹及源数据,可用于验证和分析该生物过程的分子机制。 文件详解 归档文件(.rar格式,共4个) 文件名称:SKC_NC_StxSNARE-Three colour...
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  • EMDB_Selected_EMDB冷冻电镜地图随机采样数据

    2026年1月29日 30 202 68

    数据集概述 本数据集是从EMDB数据库中随机选取的110张冷冻电镜(cryo-EM)地图,ID范围为20000至50000。地图通过torch-fourier-rescale方法下采样至约10埃分辨率,所有地图均为正方形盒子(x==y==z),但尺寸不完全一致。数据集以压缩包形式提供。 文件详解 文件名称:emdb.zip 文件格式:ZIP...
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  • Nature_血红素蛋白改造金属催化H原子转移研究数据2025

    2026年1月28日 30 167 77

    数据集概述 本数据集为2025年发表于Nature期刊的论文“Repurposing hemoproteins for asymmetric metal-catalyzed H atom transfer”的图表基础数据,包含7个Excel文件,对应论文中的扩展数据图和主图的源数据,用于支撑研究结果的可重复性验证与深入分析。 文件详解 文件列表:...
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  • Nup84_Based_酿酒酵母核孔复合物亚复合物定位密度数据

    2026年1月28日 30 141 138

    数据集概述 本数据集包含酿酒酵母核孔复合物Nup84亚复合物模型的定位密度数据。原始建模生成的定位密度未与模型对齐,此数据集是从完整集合中重新生成的、与模型正确对齐的定位密度数据,仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:nup84_localization.zip 文件格式:ZIP...
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  • Martini_Based_核酸珠子形状因子SAXS精修输入文件

    2026年1月28日 30 36 34

    数据集概述 本数据集为论文“Martini bead form factors for nucleic-acids and their application in the refinement of protein/nucleic-acid complexes against SAXS...
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  • REST2_CMD_Based分子动力学模拟输入参数及初始构象数据

    2026年1月27日 30 128 27

    数据集概述 本数据集包含REST2和CMD两种模拟所需的输入文件、参数文件及初始构象数据,共6个文件,均为zip格式,涉及单体、五聚体、十聚体及其带CA修饰的构象,可用于分子动力学模拟相关研究。 文件详解 单体构象文件:Monomer.zip,格式为zip,包含单体模拟的输入、参数及初始构象数据...
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  • SEA_Based_TORC1通路调节剂复合物建模脚本数据_v1_0

    2026年1月25日 30 97 40

    数据集概述 本数据集包含用于建模TORC1通路调节剂SEA复合物的脚本文件。脚本展示了如何使用IMP、MODELLER和PMI工具,结合188个DSS化学交联数据与23个亲和纯化复合物数据进行建模。数据集以压缩包形式提供,包含完整的建模流程相关文件。 文件详解 文件名称:integrativemodeling/sea-v1.0.zip 文件格式:ZIP...
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  • AR_Decon_Based流感血凝素三聚体各向异性分辨率校正教程数据

    2026年1月23日 30 193 86

    数据集概述 本数据集为AR-Decon教程专用数据,包含学习和实践各向异性分辨率校正所需的全部文件,核心内容是来源于EMDB条目8731和21954的流感血凝素(HA)三聚体数据,涵盖原始数据和预处理数据两类,支持完整的AR-Decon工作流程练习。 文件详解 文件名称:AR-Decon_Tutorial.zip 文件格式:ZIP...
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  • EPR_Spectroscopy_RAC_核糖体相互作用分子机制研究数据

    2026年1月22日 30 88 28

    数据集概述 本数据集包含论文“Deciphering molecular details of the RAC-ribosome interaction by EPR spectroscopy”的原始数据、分析数据及图表数据,涉及连续波EPR、DEER距离测量、分子动力学模拟和MMM聚类分析等内容,共包含六个文件。 文件详解 原始数据文件...
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  • Aggrecan_NMR_Based_水在蛋白聚糖溶液中的核磁共振研究数据

    2026年1月21日 30 42 40

    数据集概述 本数据集基于蛋白聚糖(Aggrecan)溶液中水的核磁共振研究,测定了9.4 T和0.5 T两种场强下不同温度、不同蛋白聚糖浓度(0–5.3% w/w)的纵向、横向弛豫率及水分子扩散系数,分析了相关过程的活化能及浓度依赖性。 文件详解 文件名称:GAG data.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • AFMAssembly_Based_凝血因子Va液体原子力显微镜原始与校正图像数据_2011

    2026年1月17日 30 209 204

    数据集概述 本数据集包含凝血因子Va(FVa)在液体环境中的原始与校正原子力显微镜(AFM)图像,是用于构建FVa的A三聚体和两个C结构域的实验数据,采用多模式V显微镜的峰值力轻敲模式采集,图像尺寸为1×1 µm²,分辨率1024×1024像素。 文件详解...
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  • 基于钻石的SARS_CoV_2主蛋白酶与Z1348371854复合物的原始衍射数据存档

    2026年1月14日 30 141 133

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物Z1348371854形成复合物的原始衍射数据,对应PDB ID 5RF6。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线通过XChem结晶片段筛选实验收集,原始数据可供重新分析使用,涉及生物大分子结构研究。 文件详解 文件名称:mpro-x1077.zip...
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  • PCCP_Lindeboom_et_al_Based_水与弹性蛋白样多肽液体分相计算数据_2021

    2026年1月7日 30 110 74

    数据集概述 本数据集包含期刊PCCP 2021年论文《On the liquid demixing of water + elastin-like polypeptide mixtures: bimodal re-entrant phase...
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  • ChemistryOpen_Dataset_氮酶样暗操作原叶绿素氧化还原酶实验数据_酶_底物复合物形成与电子传递

    2025年12月27日 30 56 4

    数据集概述 本数据集包含氮酶样暗操作原叶绿素氧化还原酶的酶-底物复合物形成与电子传递相关实验数据,对应论文DOI为10.1002/open.202500153,发表于ChemistryOpen期刊。数据以压缩文件形式呈现,涵盖实验图谱、活性测定等内容,共十个文件,用于支持相关生物化学机制研究。 文件详解 压缩文件(共10个,均为.zip格式)...
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  • AutoRNA_RNA三级结构预测变分自动编码器数据集

    2025年12月11日 30 164 3

    数据集概述 该数据集是论文《AutoRNA: RNA tertiary structure prediction using variational autoencoder》的配套数据,包含用于RNA三级结构预测的变分自动编码器模型相关的过滤后数据,以压缩包形式提供。 文件详解 文件名称: filtered_data.zip 文件格式:...
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  • Slice_and_Dice方法测量NMR弛豫嵌套实验支持数据集

    2025年12月10日 30 3 1

    数据集概述 本数据集是"Slice and Dice: Nested Spin-lattice Relaxation Measurements"手稿的支持数据,包含NMR原始数据、脉冲程序文件、处理说明文档及相关Python程序,为复现和应用该嵌套实验方法提供完整资源。 文件详解 NMR_data.zip:...
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  • 胶原蛋白结构与动力学全原子力场评估及优化数据集

    2025年12月9日 30 18 7

    数据集概述 本数据集是为发表于《Biophysical Journal》的研究论文“Evaluation and refinement of all-atom force fields for reproducing collagen structure and dynamics”提供的配套数据,聚焦胶原蛋白结构与动力学的全原子力场评估及优化研究。...
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  • 数据5400万年前鱼类脊椎骨胶原蛋白保存的化学证据数据集

    2025年12月7日 30 161 52

    数据集概述 该数据集围绕5400万年前始新世早期鱼类脊椎骨中胶原蛋白的保存证据展开,包含通过在线热解-全二维气相色谱-飞行时间质谱及免疫荧光研究获得的化学分析数据,为胶原蛋白在化石软组织中长期保存的可能性提供支撑。 文件详解 压缩文件: supplementary_information.rar:RAR格式压缩文件,可能包含研究相关的补充数据或材料...
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