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副本交换分子动力学模拟输入参数及构象数据集
2025年12月23日 30 130 30
数据集概述 本数据集包含副本交换分子动力学（REMD）模拟的输入文件、参数文件以及310K温度下的初始和最终构象数据，为分子动力学模拟研究提供了基础数据支持。 文件详解 该数据集由41个ZIP格式的压缩文件组成，具体说明如下： - 压缩文件组：共41个，文件格式均为ZIP（.zip），包含模拟相关的输入、参数及构象数据。 -...
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甲烷球菌属苹果酸脱氢酶热适应与潜在变构关联数据集
2025年12月23日 30 175 71
数据集概述 本数据集为研究论文《Unraveling the link between thermal adaptation and latent allostery in malate dehydrogenase from...
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HIV演化模拟输入数据集
2025年12月22日 30 113 40
数据集概述 该数据集包含运行模拟所需的输入数据，用于从HIV和SHIV纵向序列数据中推断单个突变的适应度效应（选择系数）。数据集以压缩包形式提供，支持相关代码的模拟与分析工作。 文件详解 文件名称: HIV.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 包含运行HIV和SHIV演化模拟所需的全部输入数据，具体文件结构需解压后查看。 数据来源...
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大肠杆菌K_12_MG1655的Albacore与Flappie序列召回对比数据集
2025年12月12日 30 29 25
数据集概述 本数据集基于大肠杆菌K-12 MG1655的超长读长测序数据，对比Albacore和Flappie两种工具的序列召回结果，包含原始测序数据处理后的序列文件、比对结果及可视化脚本。 文件详解 文件名称: aligned_all_ddea.fa，文件格式: FA (.fa)，为序列比对结果文件，包含核苷酸序列比对信息 文件名称:...
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ZeroCostDL4Mic无标记预测_fnet_示例训练测试数据集
2025年12月16日 30 148 100
数据集概述 该数据集是ZeroCostDL4Mic平台的无标记预测（fnet）示例数据，包含共聚焦显微镜拍摄的HeLa细胞3D配对图像，涉及荧光与透射光两种成像模式，为相关模型训练与测试提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: Label-free prediction (fnet) v2.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 压缩包内容:...
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Ras_GTPase家族蛋白功能预测生化验证数据集
2025年12月16日 30 13 9
数据集概述 本数据集为Ras GTPase家族蛋白功能预测的生化验证研究配套数据，包含基于ProteinCartography v0.5.0生成的HRas和KRas蛋白结构分析结果，以及蛋白质图谱可视化文件，支持蛋白功能预测的验证分析。 文件详解 文件名称: GTPase_HRas_KRas.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...
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统计物理方法的密码子使用优化辅助代码与数据集
2025年12月12日 30 112 80
数据集概述 该数据集包含用于密码子设计统计物理模型研究的辅助代码与数据，涵盖基因组预处理、过滤代码及处理后的数据集，支撑《A statistical-physics approach for codon usage optimisation》一文的研究内容。 文件详解 readme.txt：TXT格式，提供数据及代码的详细说明...
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蛋白质_配体共折叠深度学习模型预测数据集
2025年12月8日 30 65 8
数据集概述 本数据集包含AlphaFold3、RosettaFold All-Atom、Boltz-1和Chai-1四个模型对蛋白质-配体共折叠的预测结果，用于验证深度学习模型是否学习到相关物理相互作用规律。 文件详解 Cofolding_Adversarial_Challenge_Data.zip：压缩文件，包含共折叠对抗性挑战相关的预测数据...
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蛋白质构象空间探索数据集20240916_v1
2025年12月8日 30 113 66
数据集概述 本数据集围绕基于GoMartini 3描述符的高效TlCA特征集，探索蛋白质构象空间，包含相关文档与代码文件，为蛋白质结构分析提供支持。 文件详解 Supplementary.pdf: PDF格式文档，可能包含研究背景、方法细节或补充分析等内容 CODE.tar.xz: XZ压缩格式的代码包，可能包含用于数据处理或构象空间分析的源代码...
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蛋白质_蛋白质对接用于PROTAC发现数据集
2025年12月6日 30 109 23
数据集概述 该数据集围绕基于结构的PROTAC设计展开，聚焦于评估蛋白质-蛋白质对接工具对E3连接酶与靶蛋白结合界面的预测准确性，涉及BRD4BD1-CRBN、BRD4BD2-VHL等复合物及HADDOCK、Rosetta、ICM三种对接工具。 文件详解 文件名称: Zenodo_Final.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
