Caliicebus基因标记序列比对数据

数据集概述

本数据集包含Caliicebus（柽柳猴属）的基因序列数据，由11个基因标记的13条比对序列组成。标记包括16S、COX1、CytB三个线粒体基因，Alu24、Alu27、Alu39、Alu84四个Alu重复序列，以及ABCA1、DENND5A、FES、RAG1四个核基因。所有序列以NEXUS格式存储在一个数据文件中，适用于系统发育分析和分子进化研究。

文件详解

• 文件名称：carneiro.nex
• 文件格式：NEXUS
• 字段映射介绍：包含13条比对序列，涵盖以下11个基因标记：
• 线粒体基因：16S、COX1、CytB
• Alu重复序列：Alu24、Alu27、Alu39、Alu84
• 核基因：ABCA1、DENND5A、FES、RAG1

适用场景

• 系统发育分析：用于构建Caliicebus属内或与其他灵长类动物的进化关系树
• 分子标记比较研究：比较不同基因标记（线粒体基因、Alu序列、核基因）在进化分析中的效用差异
• 灵长类分子进化：研究柽柳猴属的遗传多样性和分子进化模式
• 生物信息学方法验证：作为多序列比对和系统发育重建算法的测试数据集