数据集概述
该数据集支持泛癌药物敏感性评分生存分析工具DrugSurvPlot的运行,包含多种癌症类型的药物敏感性数据与生存分析结果,覆盖药物列表、基因数据表及不同肿瘤的生存指标数据,为研究药物对肿瘤生存预后的影响提供数据基础。
文件详解
- 核心数据文件:
- DrugSurvPlot_data/data/druglist.csv: CSV格式,包含药物名称、对应网站链接、ID及注释等字段,记录药物基本信息。
- DrugSurvPlot_data/data/druglist.Rdata: R语言数据格式,存储药物列表数据。
- DrugSurvPlot_data/data/final_group.Rdata: R语言数据格式,可能包含分组相关数据。
- DrugSurvPlot_data/data/GeneDatatable/drug_groupX.Rdata(X为数字): 位于GeneDatatable目录下的R语言数据文件,可能与药物分组的基因数据相关。
- 肿瘤类型数据文件(按肿瘤类型分类):
- 以肿瘤名称命名的目录(如Adrenocortical Carcinoma (ACC)、Bladder Cancer (BC)等),每个目录下包含不同数据集(如TCGA-ACC、GSE75535等)的文件。
- 字段相关文件示例:OS_drugsensm_IlluminaHiSeq.Rdata(总生存期药物敏感性数据)、PFI_drugsensb_IlluminaHiSeq.Rdata(无进展生存期药物敏感性数据)等,均为R语言数据格式,记录对应肿瘤的生存指标与药物敏感性数据。
适用场景
- 肿瘤学研究: 分析不同药物对多种癌症患者生存预后的影响。
- 药物敏感性研究: 探究特定药物在不同肿瘤类型中的敏感性差异及机制。
- 临床决策辅助: 为临床医生提供药物对肿瘤生存影响的参考数据,辅助治疗方案选择。
- 生物信息学分析: 支持基于药物敏感性评分与生存数据的算法开发和模型构建。