数据集概述
本数据集包含四种不同抗性水平番茄品种(RooiKhaki、Moneymaker、NIL396、ESTY)感染番茄曲叶病毒(ToCSV)后,防御相关基因SnRK1和WRKY3的qPCR表达数据,涵盖感染后八、十五、三十天的管家基因Actin循环阈值(Ct)及目标基因表达水平,用于分析病毒感染下关键信号基因的转录响应。
文件详解
数据集包含一个目录下的十二个.pcrd格式文件,具体说明如下:
- 目录名称: qPCR data on defence-related genes, SnRK1 and WRKY/
- 文件类型: 所有文件均为.pcrd格式
- 主要文件类别:
- 基因表达数据文件: 如Actin gene expression_CFX0.pcrd、SnRK1 Res ESTY 8 - 35 dpi.pcrd、WRKY3 Res ESTY 8 - 35 dpi.pcrd,记录不同品种在特定时间点的基因表达数据
- 标准曲线文件: 如Actin Res and Sus (RK) standard curves_CFX0.pcrd、WRKY3 standard curves_CFX0.pcrd、Actin Tol (396) and Sus (MM) standard curves_CFX0.pcrd,提供实验校准用的标准曲线数据
适用场景
- 植物病毒学研究: 分析番茄曲叶病毒感染对防御基因表达的影响机制
- 植物抗病性研究: 比较不同抗性番茄品种的抗病毒防御转录响应差异
- 分子生物学实验: 基于qPCR原始数据和标准曲线进行基因表达定量分析复现
- 作物育种应用: 筛选与番茄抗病毒相关的关键基因标记,辅助抗病品种选育