数据集概述
本数据集记录了特定异生物质激动剂配体(TCPOBOP)激活核受体CAR后,小鼠肝脏增强子景观发生的广泛表观遗传变化,包括染色质可及性改变、组蛋白修饰及转录因子结合变化等,为研究环境化学物质对肝脏表观基因组的影响提供资源。
文件详解
- 表格文件(.xlsx格式,共8个):
- Table_S1_Rampersaud_ToxSci_2019_.xlsx:可能包含TCPOBOP处理相关的基础数据或样本信息
- Table_S2CDE_Rampersaud_ToxSci_2019.xlsx:可能涉及DHS区域变化、组蛋白修饰或基因表达相关数据
- Table_S2FGHI_Rampersaud_ToxSci_2019_.xlsx:可能包含转录因子结合、基因功能注释或代谢通路相关数据
- Table_S3_Rampersaud_ToxSci_2019.xlsx:可能涉及CAR结合位点、基因调控网络或信号通路依赖关系数据
- Table_S4_Rampersaud_ToxSci_2019.xlsx:可能包含RXRA、CEBPA等转录因子结合及相关基因数据
- Table_S5_Rampersaud_ToxSci_2019.xlsx:可能涉及间接调控机制、染色质状态变化或非CAR结合位点数据
- Table_S6_Rampersaud_ToxSci_2019.xlsx:可能包含环境化学物质诱导表观遗传变化的全局图谱或汇总数据
- 补充图表文件:
- Supplemental_Figs_S1_to_S13_Rampersaud_ToxSci_2019.pdf:PDF格式,包含13幅补充图表,可能展示染色质开放/关闭位点分布、转录因子结合富集、基因表达模式等可视化结果
适用场景
- 环境毒理学研究:分析异生物质激动剂对肝脏表观基因组的影响机制
- 核受体信号通路研究:探究CAR激活介导的直接与间接表观遗传调控通路
- 肝脏代谢与肿瘤发生研究:关联染色质状态变化与药物/脂质代谢、肝细胞癌变相关基因表达
- 转录因子协同调控研究:分析RXRA、CEBPA等因子在肝脏特异性转录响应中的作用
- 表观遗传标志物开发:筛选环境化学物质暴露诱导的肝脏表观遗传变化标志物