数据集概述
本数据集包含研究“环境异质性对范围扩张种群遗传学影响”的代码与实验数据,涵盖模拟分析、表型观测、突变率统计等内容,支持相关研究的复现与扩展分析。
文件详解
- 分析文件 (Analysis/ 目录):
- 包含多个Notebook文件(.nb格式),如plottingSetup.nb、colonyRoughness.nb、fitnessMeasurement.nb等,用于实验数据的可视化与统计分析。
- 代码文件 (Code/ 目录):
- heterogeneousEden-with-mutants.cpp、heterogeneousEden-frontProperties.cpp:C++代码文件,用于种群扩张模拟。
- 数据文件 (Data/ 目录):
- 模拟数据 (Data/Simulations/): 包含data-tree.zip、fMT-simulation.zip、sectordynamics.zip等压缩包,存储模拟实验结果。
- 表型数据 (Data/Fitness/、Data/Roughness/、Data/Data/Sectoring/edited/): 以.jpg格式为主,记录不同处理条件下的表型观测图像,如F dox=0,7-10(1)_c1+2.jpg、S dox=0,05 smooth -09(1)_c1.jpg等。
- 统计数据 (Data/Mutation rate/、Data/Substrate roughness/): CSV格式文件,记录突变率与环境参数统计数据,如colony counter dox=0.csv、run2-2.csv等,字段包含white colonies(白色菌落数)、all colonies(总菌落数)等。
适用场景
- 种群遗传学研究:分析环境异质性对种群扩张过程中遗传结构的影响
- 实验生物学:验证环境参数与表型特征的关联
- 计算生物学:复现或扩展种群扩张模拟实验
- 生态建模:探究环境因子对物种分布范围扩展的调控机制