数据集概述
本数据集为关于缓步动物Hypsibius dujardini基因组水平基因转移（HGT）研究的配套数据，包含基因组组装、注释、RNA测序、系统发育分析及补充文件等，用于验证该物种是否存在大量功能性水平基因转移，修正此前研究结论。
文件详解
- 核心数据文件：
- nHd.2.3.abv500.fna.gz：基因组组装文件（FASTA.gz格式），为Edinburgh版本2.3的基因组组装序列
- maker1.gff3.gz：基因注释文件（GFF3.gz格式），包含23,021个基因预测结果
- Trinity.fasta.c99.gz：转录组组装文件（FASTA.gz格式），RNA测序数据组装结果
- HGT_phylogenetic_files.tgz：系统发育分析文件（TGZ格式），水平基因转移候选基因的系统发育分析相关数据
- 补充文件：
- Supplemental_File_9_Summary_stats_from_blobplot_of_nHd23.txt：基因组污染分析统计文件（TXT格式），BlobPlot分析的汇总统计结果
- Supplemental_File_4_Assignments_of_the_6663_putative_UNC_HGT_loci.txt：HGT候选基因注释文件（TXT格式），6663个潜在HGT位点的分类信息
- Supplemental_File_7_High_resolution_figures.pdf：高分辨率图表文件（PDF格式），研究相关的图表资源
- 说明文档：
- Hypsibius_dujardini_files_README.md：数据集说明文档（MD格式），所有文件的详细描述
适用场景
- 基因组学研究：缓步动物基因组组装与注释质量评估
- 进化生物学分析：水平基因转移事件的检测与验证
- 生物信息学方法开发：微生物污染识别与过滤技术优化
- 比较基因组学研究：不同物种间基因来源与进化关系分析
- 缓步动物适应性进化研究：极端环境耐受机制的分子基础探究
