昆虫物种水平生命树构建及分类分析应用数据集

数据集概述

本数据集围绕昆虫物种水平生命树构建展开,包含49,358个物种、13,865个属、760个科的系统发育数据。通过优化的核转录组、线粒体基因组及物种标记矩阵构建流程,结合分层推断方法生成生命树,为昆虫多样性研究及分类分析提供基础。

文件详解

  • 物种树文件:
  • species_level_tree.processed.nwk:Newick格式,处理后的昆虫物种水平生命树
  • species_level_tree.nwk:Newick格式,原始昆虫物种水平生命树
  • species_level_tree_HR.png:PNG格式,高分辨率物种树可视化图像
  • 矩阵文件:
  • specieslevel_supermatrix.nex.gz:Nexus压缩格式,物种水平超级矩阵
  • transcriptomes_supermatrix.nex.gz:Nexus压缩格式,转录组超级矩阵
  • mitogenome_supermatrix.nex.gz:Nexus压缩格式,线粒体基因组超级矩阵
  • 流程与文档:
  • pipeline_files.tar.gz:压缩包,包含项目分析流程文件
  • Online_Supplemental_Document_PDF.pdf:PDF格式,在线补充文档
  • ITOL1_Development_Commands_and_Notes.txt:TXT格式,ITOL开发命令及项目笔记
  • relational_constraints_tabdelim:无扩展名,关系约束表

适用场景

  • 昆虫系统发育研究:分析昆虫类群间的进化关系和分类系统
  • 生物多样性评估:支持昆虫多样性的宏观分析与比较研究
  • 分类学应用:开发基于生命树的物种分类鉴定工具
  • 进化生物学:探究昆虫类群的分化时间和演化模式
  • 生态研究:辅助昆虫群落结构与功能的系统分析
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 43.22 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。