欧洲Plebejus属基因组分类研究数据集

数据集概述

该数据集包含复现Toro-Delgado等人关于欧洲Plebejus属(灰蝶科:眼灰蝶亚科)基因组分类研究结果所需的数据、元数据及部分结果文件,通过11个文件支持研究复现,核心围绕该属的分类学澄清展开。

文件详解

该数据集包含11个文件,具体说明如下: - 文档文件: - README.md: Markdown格式文档,说明数据集整体内容及各文件用途 - 压缩数据文件(.zip格式): - STRUCTURE_input.zip: 用于群体结构分析的输入数据 - PCA_input.zip: 主成分分析的输入数据 - heterozygosity_input.zip: 杂合度分析的输入数据 - Adegenet_Fis_input.zip: 计算Fis系数的输入数据(含Pl. argus和Pl. idas等物种数据) - Phylonetworks_input.zip: 系统发育网络分析的输入数据 - bpp_input.zip: 物种界定分析的输入数据 - Centrifuge_input.zip: 分类学分析工具Centrifuge的输入数据 - 系统发育树文件(.nwk格式): - IQTREE_Plebejus_best_tree_REROOTED_RELABELLED.nwk: Plebejus属最优系统发育树(已重新生根、重命名) - IQTREE_Wolbachia_best_tree.rerooted.nwk: Wolbachia共生菌最优系统发育树(已重新生根)

适用场景

  • 昆虫分类学研究: 用于欧洲Plebejus属灰蝶的物种界定与分类澄清
  • 基因组数据分析: 复现群体结构、系统发育树构建等基因组学分析流程
  • 生物信息学方法验证: 测试STRUCTURE、IQTREE等工具在蝴蝶基因组数据中的应用效果
  • 共生菌研究: 分析Plebejus属与Wolbachia共生菌的系统发育关系
  • 进化生物学研究: 探究Plebejus属的遗传多样性与进化历史
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 19.99 MiB
最后更新 2025年12月4日
创建于 2025年12月4日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。