数据集概述
该数据集是“PLAE web app enables powerful searching and multiple visualizations across one million unified single-cell ocular transcriptomes”的补充数据，包含单眼转录组相关的基因表达、差异分析等数据文件及脚本，支持转录组数据的搜索与可视化研究。
文件详解
- 压缩数据文件（.gz格式）：
- pseudoBulk_cone_region_table.csv.gz：可能包含锥状细胞区域伪批量分析数据
- differential_expression_table.csv.gz：差异表达分析结果表
- consistently_differentially_expressed_genes.csv.gz：持续差异表达基因列表
- consistently_differentially_expressed_diff_table.csv.gz：持续差异表达详细分析表
- R语言数据文件（.Rdata格式）：
- pseudoBulk_cone_region_files.Rdata：锥状细胞区域伪批量分析R数据文件
- scEiaD_fovea_vs_peripheral_cone.seuratV3.Rdata：中央凹与周边锥状细胞Seurat分析数据
- CSV文件：
- differential_expression_table.csv：差异表达分析表，字段含CellType、物种基因数等（如Homo sapiens、Mus musculus）
- samples_hand_removed.csv：手动移除样本列表，字段含sample_accession、organism、Tissue等
- 其他文件：
- pseudobulk_cone_region.Rmd：R Markdown分析脚本
- pseudobulk_cone_region04.html：分析结果HTML报告
- supplemental_scripts_and_data_resubmission.zip：补充脚本与数据压缩包
适用场景
- 单眼转录组数据分析：研究眼部细胞基因表达特征
- 差异表达基因研究：分析不同细胞类型或区域的基因表达差异
- 生物信息学方法应用：验证或复现单细胞转录组分析流程
- 眼科生物学研究：探索眼部细胞功能及分子机制
