数据集概述
本数据集为题为《蝗虫和蚱蜢的系统发育揭示密度依赖性表型可塑性的复杂进化》的手稿补充数据,包含沙漠蝗(Schistocerca)系统发育分析相关的原始数据、分析结果及可视化文件,支持系统发育树构建、祖先状态重建等研究内容。
文件详解
数据集包含十五个文件,按类型分类如下:
- 系统发育树文件:
- Schistocerca_RAxML.tre:RAxML构建的系统发育树文件
- Schistocerca_Bayes.tre:贝叶斯方法构建的系统发育树文件
- Schistocerca_TimeTree.tre:时间校准的系统发育树文件
- Schistocerca_Divergence_Time.nex:分歧时间分析文件(NEX格式)
- Schistocerca.nex:系统发育分析数据文件(NEX格式)
- Schistocerca.phy:系统发育数据文件(PHY格式)
- Schistocerca_ancentral.phy:祖先状态重建数据文件(PHY格式)
- 分析结果文件:
- PartitionFinder_Result.txt:分区查找分析结果
- BioGeoBear_Result.txt:生物地理学分析结果
- Ancestral_Reconstruction.txt:祖先状态重建结果
- Pagel_Correlation.csv:相关性分析数据(CSV格式)
- Binary_Character.csv:二元性状数据(CSV格式)
- 可视化与文档文件:
- Ancestral Reconstruction (Behavior).pdf:行为特征祖先重建可视化
- Ancestral Reconstruction (Color).pdf:颜色特征祖先重建可视化
- Song et al. Table S2.docx:补充表格文档
- 其他文件:
- Schistocerca_TimeTree.tre:时间树文件
- Schistocerca_Divergence_Time.nex:分歧时间分析文件
数据来源
Scientific Reports投稿手稿补充数据
适用场景
- 昆虫系统发育研究:用于沙漠蝗及相关类群的系统发育关系分析
- 表型进化研究:探究密度依赖性表型可塑性的进化机制
- 生物地理学分析:支持物种分布与分化的地理历史研究
- 祖先状态重建:分析行为、颜色等性状的演化历史
- 进化相关性分析:验证性状间的进化关联