数据集概述
本数据集包含天然化合物产生菌紫色链霉菌S21的全基因组测序数据,通过Illumina Hiseq4000和PacBio RS II两种平台测序获得,为该菌株的基因组结构与功能研究提供基础数据支持。
文件详解
- 目录结构: 数据集包含1个根目录,目录名称为"Data for Complete Genome Sequence of a natural compounds producer, Streptomyces violaceus S21/"
- 文件列表:
- Streptomyces.violaceus.filtered_subreads Pacbio RSII.fa: FASTA格式文件,为PacBio RS II平台测序得到的过滤后子读段数据
- Streptomyces.violaceus.filtered_subreads Hiseq.fq: FASTQ格式文件,为Illumina Hiseq平台测序得到的过滤后子读段数据
数据来源
北京基因组研究所(深圳)
适用场景
- 微生物基因组学研究: 解析紫色链霉菌S21的基因组结构、基因组成与功能注释
- 天然产物生物合成研究: 挖掘该菌株中天然化合物合成相关的基因簇与代谢通路
- 比较基因组学分析: 与其他链霉菌属菌株进行基因组比较,探究进化关系与功能差异
- 生物技术应用: 为利用该菌株进行天然化合物的生物合成与代谢工程改造提供数据基础