数据集概述
本数据集包含在Vema-TRANSIT科学考察期间采集的Macrostylidae科(甲壳动物:等足目)标本的DNA序列信息和采样元数据。考察于2014/2015年北半球冬季由德国科考船Sonne号沿北大西洋Vema断裂带执行。数据涵盖18S和16S两个分子标记的序列信息及相关采样记录,共计两个文件。
文件详解
- Riehl_et_al_Vema-TRANSIT-Macrostylidae_16Sv4.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 包含16S分子标记的序列及相关元数据,主要字段有:Name(名称)、GenBank Accession #(GenBank登录号)、Bio-repository data(生物样本库数据)、REGISTRATION #(登记号)、COLBY(采集者)、COLDATE(采集日期)、COLMETHOD(采集方法)、Country(国家)、Ocean(大洋)、DEPTH_START(起始深度)、DEPTH_END(结束深度)、ALTITUDE_START(起始海拔)、ALTITUDE_END(结束海拔)、DEVSTAGE(发育阶段)、Description(描述)、ENV_SAMPLE(环境样本)、GEOGR AREA(地理区域)、IDBY(鉴定者)、ISOL(分离信息)等。
- Riehl_et_al_Vema-TRANSIT-Macrostylidae_18Sv2.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 包含18S分子标记的序列及相关元数据,字段结构与16S文件类似,涵盖样本名称、GenBank登录号、采集信息、地理坐标、深度信息、鉴定详情等关键元数据。
数据来源
Vema-TRANSIT科学考察(德国科考船Sonne号)
适用场景
- 深海生物多样性研究: 利用18S和16S DNA序列分析Macrostylidae科在Vema断裂带的物种多样性和系统发育关系。
- 分子系统发育分析: 基于DNA序列数据构建Macrostylidae科的系统发育树,探讨其进化历史。
- 深海生态与生物地理学: 结合采样深度、地理位置等元数据,研究Macrostylidae科的分布模式及其与环境因子的关联。
- 海洋基因库建设: 为海洋生物基因数据库(如GenBank)提供高质量的DNA序列数据和标准化元数据。