数据集概述
本数据集围绕小细胞肺癌(SCLC)对WEE1激酶抑制剂AZD1775的反应机制展开,通过CRISPR/Cas9筛选等实验,探究GCN2激酶及其信号通路对药物疗效的影响,为增强WEE1抑制剂疗效提供数据支持。
文件详解
该数据集按研究图表分类存储,核心文件说明如下:
- 图表1及补充图表1数据(Figure 1 and S1 data):
- CRISPR筛选数据(CRISPR-screen counts目录):
- sgRNA_human_10_ref.csv:sgRNA参考序列文件
- 按细胞系(如NCI-H69、NCI-H82)和处理条件分类的counts.csv文件:记录sgRNA测序计数
- 流式细胞术数据(Figure 1 F and S1I - FACS目录):
- 140个.fcs格式文件:包含细胞周期分析的原始流式数据
- H82 GCN2 Comp - Statistics.xlsx:统计分析结果
- 蛋白免疫印迹数据(如Figure 1 G - WES目录):
- 以日期和实验描述命名的.cbz文件:蛋白印迹实验原始数据
- Metadata.xlsx:实验元数据记录
- 细胞活力检测数据(Figure 1 I - Alamar Blue目录):
- .pzfx格式文件:细胞活力曲线数据
- 图表2及补充图表2数据(Figure 2 and S2 data):
- 药物协同效应分析(Figure 2F目录):
- Alamar_Raphin_AZD.xlsx:细胞活力检测数据
- Synergy_Finder_script.Rmd:协同效应分析脚本
- 蛋白免疫印迹数据(如Figure 2B、2E目录):
- .cbz格式文件:蛋白表达检测原始数据
- Metadata_WES44.xlsx:实验元数据
- 药物作用机制研究(如Figure S2J目录):
- .tif格式文件:ATP竞争实验结果图
适用场景
- 肿瘤药理学研究:分析WEE1激酶抑制剂的耐药机制
- 信号通路研究:探究GCN2信号通路在DNA损伤应答中的作用
- 药物研发:开发增强WEE1抑制剂疗效的联合治疗策略
- 小细胞肺癌精准医疗:筛选预测WEE1抑制剂疗效的生物标志物
- 癌症细胞生物学:研究细胞周期检查点调控机制