数据集概述
该数据集包含为研究“质体外膜蛋白的进化历史——结构-序列比较”而生成的比对文件与系统发育树文件，涉及OEP40、OEP21A_B等多个质体外膜蛋白家族，支持结构与序列层面的进化分析。
文件详解
- 系统发育树文件（.treefile格式，共5个）：
- OEP40_ginsi.fas.treefile：OEP40蛋白序列的系统发育树文件
- OEP21A_B_ginsi.fas.treefile：OEP21A_B蛋白序列的系统发育树文件
- Jassy_ginsi.fas.treefile：Jassy相关序列的系统发育树文件
- OEP24A_B_ginsi.fas.treefile：OEP24A_B蛋白序列的系统发育树文件
- 其他.treefile文件：对应不同蛋白家族的系统发育树结果
- 序列比对文件（.fas格式，共5个）：
- OEP40_ginsi.fas：OEP40蛋白的多序列比对文件
- OEP21A_B_ginsi.fas：OEP21A_B蛋白的多序列比对文件
- OEP24A_B_ginsi.fas：OEP24A_B蛋白的多序列比对文件
- Jassy_ginsi.fas：Jassy相关序列的多序列比对文件
- OEP37_ginsi.fas：OEP37蛋白的多序列比对文件
- 压缩文件（.zip格式，共2个）：
- alignments_JASSY_structure_phylogeny.zip：包含JASSY结构系统发育相关比对数据的压缩包
- alignments_JASSY2_structure_phylogenies.zip：包含JASSY2结构系统发育相关比对数据的压缩包
适用场景
- 分子进化研究：分析质体外膜蛋白家族的系统发育关系与进化历史
- 生物信息学分析：基于序列比对与系统发育树开展蛋白结构-序列关联研究
- 植物生物学研究：探究质体外膜蛋白在植物进化中的功能分化机制
- 计算生物学教学：作为系统发育分析实践的示例数据，学习序列比对与树构建流程
