找到7个数据集

分类: 公开数据 标签: 多物种溯祖模型

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  • BEAST计算性能与统计准确性及方法比较数据集

    2025年12月6日 30 138 73

    数据集概述 本数据集围绕多物种溯祖模型下*BEAST方法的计算性能与统计准确性展开,通过模拟研究分析其与其他系统发育方法(如超级矩阵拼接法)的差异,探究基因座数量、分支长度等参数对结果的影响,为贝叶斯物种树估计的实践应用提供数据支持。 文件详解 New Supplementary...
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  • 金虎尾目物种树异质性影响因素研究数据集

    2025年12月6日 30 157 105

    数据集概述 本数据集聚焦被子植物金虎尾目(Malpighiales)物种树构建问题,包含423个单拷贝基因座数据及相关分析结果,探究基因树估计误差、不完全谱系分选和基因流对该类群系统发育分辨率的影响,为理解快速辐射类群的进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:Supplementary_Materials.pdf 文件格式:PDF...
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  • 多物种溯祖模型下物种界定模型违反影响数据集

    2025年12月6日 30 78 41

    数据集概述 本数据集围绕多物种溯祖模型(MSC)下物种界定的模型假设违反影响展开,通过模拟和实证分析评估模型拟合度与推断稳健性,包含模拟代码、测试脚本、参数文件及补充表格,为系统发育研究中模型检验提供方法支持。 文件详解 文档文件(共3个): TableS1.pdf:PDF格式,可能包含研究相关的补充表格1...
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  • 基于全基因组SNP数据的海鲶贝叶斯分歧时间估计数据集

    2025年12月5日 30 140 79

    数据集概述 本数据集包含基于全基因组SNP数据的海鲶(Ariidae)贝叶斯分歧时间估计相关文件,用于验证巴拿马地峡闭合时间的生物地理学证据,涉及多物种溯祖模型的开发与应用,包含模拟验证、军蚁与海鲶基因组数据分析结果及相关文档。 文件详解 补充材料文档:...
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  • Heliconius蝴蝶erato_sara类群物种分化与基因渐渗全似然基因组分析数据集

    2025年12月5日 30 51 24

    数据集概述 该数据集包含Heliconius蝴蝶erato-sara类群6个物种的多位点序列数据,用于基于多物种溯祖模型的bpp和3s分析,支撑物种分化与基因渐渗的全似然基因组研究。 文件详解 分析数据集(.tar.gz格式): bpp-block100.tar.gz:bpp分析用数据集,包含100个基因座区块的序列数据 bpp-...
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  • 概率物种树距离数据集

    2025年12月4日 30 33 17

    数据集概述 该数据集围绕概率物种树距离方法展开,基于多物种溯祖模型(MSC),将基因树距离理论扩展至物种树模型比较,包含相关补充材料,为系统发育树模型的概率化比较研究提供支持。 文件详解 文件名称:SupplementaryFigure01_11Dec2018.pdf 文件格式:PDF...
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  • 两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断数据集

    2025年12月4日 30 196 180

    数据集概述 该数据集包含用于两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断的模拟与分析脚本,支持基因树生成、DNA序列模拟及五种基于溯祖模型的物种树估计方法的数据分析。 文件详解 文件名称:two-step_msc.zip 文件格式:ZIP压缩包 内容说明:压缩包内包含两类脚本,一是模拟脚本(生成带不完全谱系分选的基因树、基于Jukes-...
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