找到605个数据集

标签: 序列比对

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  • 海洋线虫宏条形码参考数据集系统发育树补充材料31

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集是海洋线虫宏条形码研究的补充材料,包含通过Clustal-W比对"长"数据集构建的邻接系统发育树,用于评估基于树的分类学分配方法中参考数据集的应用效果。 文件详解 文件名称: oo_85428.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 基于Clustal-...
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  • Agoo亚属修订状态的GenBank登录号表格数据

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集为表格形式,收录了Cenchreini族昆虫(包括Agoo亚属等类群)的GenBank登录号信息,涵盖物种名称、样本来源机构、采集日期及采集地点等核心字段,为相关分类学研究提供基因序列关联数据支持。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html) 字段映射: Species:物种名称...
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  • 白蚁社会复杂性对自然选择效能影响数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集围绕白蚁社会复杂性与自然选择效能的关系展开,通过分析Blattodea和Isoptera类群的dN/dS分布,验证真社会性与自然选择效能的关联。包含原始数据、分析脚本及文档,支持研究复现。 文件详解 系统发育文件:...
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  • 基孔肯雅病毒亚裔分离株分子与生物学特征数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集包含论文《基孔肯雅病毒亚裔分离株的分子与生物学特征》开发过程中使用的全部6个相关文件,涵盖序列比对、Western Blot图像、最小数据集及基因突变位点图像等内容,为该研究提供了关键的支撑数据。 文件详解 该数据集由6个文件组成,具体说明如下: - 序列比对文件: - FIG 1 ALN.mdsx:...
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  • Halamphora_witkowskii比对与系统发育树数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集围绕Halamphora witkowskii的序列比对与系统发育树展开,包含序列信息、系统发育树可视化及基因比对数据,为研究该物种的分子系统发育关系提供基础数据支持。 文件详解 List of sequences with corresponding accession numbers.xlsx:...
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  • 绿色植物演化时间尺度不确定性分析数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集围绕绿色植物演化时间尺度的不确定性分析展开,涉及基于99个叶绿体基因组的81个蛋白编码基因数据、分子钟模型测试、化石校准策略及贝叶斯分子定年方法,为绿色植物演化时间研究提供多源数据支持。 文件详解 Supplementary_Information.pdf:PDF格式,包含研究方法、结果补充说明及校准策略详情...
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  • 叉蕨属暗鳞叉蕨组系统发育与形态学研究数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 该数据集围绕叉蕨属暗鳞叉蕨组及其近缘种展开,包含基于5个叶绿体基因片段的系统发育分析结果与形态学观察数据,明确了该组的物种界定及亲缘关系,并描述了新物种Tectaria fungii。 文件详解 README_Dataset.txt:文本格式,包含数据集版本、发布历史、作者信息及数据来源说明等元数据。...
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  • 加州特有丝蛾属系统地理学研究数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集为加州特有丝蛾属(Calosaturnia)的系统地理学研究成果,包含线粒体COI基因与核基因序列数据、系统发育树重建结果及分化时间估算。研究揭示该属三个物种存在显著隔离与二次重连现象,发现加州中部海岸存在未被认知的独立生物地理区域,为该区域特有生物多样性研究及保护提供数据支持。 文件详解 该数据集包含九个文件,具体说明如下: -...
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  • 个体内位点多态性_2ISPs_存在下的系统发育构建数据集_以核糖体顺反子为重点

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集围绕个体内位点多态性(2ISPs)存在下的系统发育构建方法展开,重点关注核糖体顺反子区域。通过模拟数据、真实世界数据和案例研究,测试将2ISPs作为“信息性”而非“模糊”特征的处理方式,在最小进化、最大简约和最大似然三种系统发育推断标准中的支持度改进效果。 文件详解 说明文档(.txt格式):...
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  • Discodorididae科隐存物种COI基因片段个体分析补充材料2023

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集为Discodorididae科隐存物种研究的补充材料,包含基于COI基因片段的个体分析相关内容,以图片文件形式呈现,为物种分类与分子鉴定提供可视化数据支持。 文件详解 文件名称: oo_820845.jpg 文件格式: JPG(.jpg) 文件说明:...
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  • 豆科Coursetia_caribaea种内不同材料DNA序列变异数据集

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集聚焦豆科Coursetia caribaea种内不同分类变种的DNA序列变异,包含核糖体ITS序列和叶绿体trnD-trnT序列数据,通过系统发育分析揭示其地理分布支系的物种地位,为该属分类修订提供分子证据。 文件详解 文件名称:Supplemental Map.tif 文件格式:TIFF(.tif)...
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  • 海洋线虫DNA条形码参考数据集评估补充材料27

    2025年12月5日   

    数据集概述 该数据集为海洋线虫DNA条形码研究的补充材料,包含通过PRANK比对"过滤"数据集得到的最大似然树图片,用于评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用效果。 文件详解 文件名称: oo_85424.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明:...
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  • 印度炭角菌科新种Xylaria_sridharii系统发育分析物种与标本信息表

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集为印度炭角菌科新种Xylaria sridharii相关研究的配套表格,记录了系统发育分析中使用的物种、标本及GenBank序列登录号等信息,包含多个属种的分类单元、分离株编号、ITS和TUB2基因序列数据及参考文献,为真菌分类与系统发育研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML...
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  • Discodorididae新物种Histone_H3基因片段个体分析补充材料

    2025年12月5日   

    数据集概述 该数据集为Discodorididae科新物种研究的补充材料,包含基于Histone H3基因片段的个体分析相关内容,以图片文件形式呈现,支持对新物种分子特征的研究。 文件详解 文件名称:oo_820847.jpg 文件格式:JPG(.jpg) 内容说明:该图片文件可能包含Histone...
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  • 古人类蛋白质组学参考数据集

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集是使用PaleoProPhyler工具生成的古人类蛋白质组学参考数据集,包含来自古代和现代人类的蛋白质序列。涵盖一百七十六个公开基因组及八个古人类基因组(三个尼安德特人、一个丹尼索瓦人),针对骨骼或牙齿中已报道的蛋白质进行翻译,共得到约一万零五十八条序列。 文件详解 该数据集为压缩文件,包含以下内容: -...
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  • 硅藻进化的生态机遇与限制支持数据集2016

    2025年12月5日   

    数据集概述 该数据集是硅藻进化研究的支持数据,包含542个分类单元(540种硅藻及2种波利多门藻)的序列比对、特征数据、系统发育树及相关分析脚本,为研究硅藻进化的生态机遇与限制提供基础数据支持。 文件详解 序列与拓扑文件 Nakov-etal-542-taxon-alignment-...
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  • 巴基斯坦白桩菇新物种ITS与LSU系统发育分析标本及GenBank登录号数据集

    2025年12月5日   

    数据集概述 该数据集为巴基斯坦针叶林发现的新物种Leucopaxillus pakistanicus的ITS与LSU系统发育分析提供支持,包含相关物种标本的分类单元、采集地、凭证编号、基因序列登录号及文献引用信息,新测序序列以粗体标注。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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  • 海洋线虫DNA条形码研究补充材料23

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集是海洋线虫DNA条形码研究的补充材料,核心内容为基于"filtered"数据集的Clustal-O比对构建的最大似然树,以图片形式呈现,用于支持树基分类学分配方法的参考数据集评估研究。 文件详解 文件名称: oo_85420.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 基于"filtered"数据集的Clustal-...
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  • Talaromyces属Subinflati组物种CaM基因系统发育补充材料

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集为《Talaromyces属的新组和新种》研究的补充材料8,核心内容是Talaromyces属Subinflati组物种的钙调蛋白(CaM)基因系统发育分析数据,以PDF格式呈现,为该真菌分类学研究提供分子系统发育证据支持。 文件详解 文件名称: oo_429708.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明:...
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  • riffle_beetle属Hexanchorus分子系统发育研究中的引物信息表

    2025年12月5日   

    数据集概述 本数据集为一篇关于 riffle beetle属Hexanchorus分子系统发育研究论文中的表1,内容是该研究中用于PCR扩增的引物信息,包括引物名称和对应的5'序列。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 包含论文《Molecular phylogeny of the riffle...
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