数据集概述
本数据集为加州特有丝蛾属（Calosaturnia）的系统地理学研究成果，包含线粒体COI基因与核基因序列数据、系统发育树重建结果及分化时间估算。研究揭示该属三个物种存在显著隔离与二次重连现象，发现加州中部海岸存在未被认知的独立生物地理区域，为该区域特有生物多样性研究及保护提供数据支持。
文件详解
该数据集包含九个文件，具体说明如下：
- 说明文件:
- README.txt: 数据集说明文档，介绍研究背景及各文件内容。
- 代码文件:
- Calosaturnia_revbayes_molclock.ipynb: Jupyter Notebook文件，可能包含使用RevBayes进行分子钟分析的代码。
- 系统发育树文件（PDF格式）:
- Calosaturnia_concatenated_IQtree.pdf: 基于线粒体与核基因联合序列的最大似然树（IQ-TREE生成）
- Calosaturnia_CAD_EF_WG_full_tree.pdf: 核基因（CAD、EF、WG）序列构建的系统发育树
- Calosaturnia_COI5P3P_full_tree_RevBayes.pdf: 线粒体COI基因序列的RevBayes系统发育树
- Calosaturnia_COI5P3P_full_tree_IQTree.pdf: 线粒体COI基因序列的IQ-TREE系统发育树
- 序列比对文件（FAS格式）:
- Calosaturnia_COI5P3P_alignment.fas: 线粒体COI基因序列比对文件
- Calosaturnia_CAD_EF_WG_alignment.fas: 核基因（CAD、EF、WG）序列比对文件
- 补充表格:
- Supplemental_table_1.xlsx: Excel文件，包含样本采集信息及各基因标记的GenBank登录号
适用场景
- 生物地理学研究: 分析加州中部海岸特有生物区系的形成机制与演化历史
- 系统分类学研究: 验证丝蛾属物种分类边界及隐存多样性
- 保护生物学应用: 识别加州中部海岸受威胁的特有物种及其栖息地
- 分子进化分析: 研究昆虫线粒体与核基因的协同演化模式
- 教学案例开发: 系统地理学与生物信息学分析方法的实践教学材料
