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Guppy_MHC_孔雀鱼免疫遗传与寄生虫感染实验及分析代码
数据集概述 本数据集包含孔雀鱼(Poecilia reticulata)的主要组织相容性复合体(MHC)基因型、微卫星基因型数据,以及孔雀鱼与其体外寄生虫Gyrodactylus turnbulli的受控感染实验数据,同时提供相关分析代码,用于研究宿主遗传组成与寄生虫感染易感性的关系。 文件详解...
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pLARmEB_Based_多基因座全基因组关联研究方法数据
数据集概述 本数据集支持pLARmEB方法(基于多基因背景控制的最小角回归结合经验贝叶斯)的应用,该方法用于多基因座全基因组关联研究(GWAS),可识别与复杂性状相关的数量性状核苷酸(QTNs),通过模型变换白化多基因矩阵协方差与环境噪声,平衡QTN检测能力、效应估计准确性与计算效率。 文件详解 文件名称:data.zip 文件格式:ZIP...
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SP_SPR_Based_果蝇性肽介导交配后反应分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇性肽(SP)介导的雌性交配后反应分化展开,包含3个野生种群的表型数据、SP及性肽受体(SPR)分子序列文件,用于研究雌性对SP的交配后响应差异及潜在遗传机制,支持果蝇性选择进化相关分析。 文件详解 README_for_Sequences SP and SPR.txt 文件格式:TXT...
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SCARB1_Based_鸟类类胡萝卜素着色关键基因研究数据
数据集概述 本数据集围绕鸟类类胡萝卜素着色机制展开研究,通过比较白色隐性突变型与黄、红色品种金丝雀的基因组及生化分析,揭示高密度脂蛋白受体SCARB1基因在类胡萝卜素摄取与转运中的关键作用。数据包含金丝雀SNP基因型信息,为理解鸟类羽毛颜色形成的遗传基础提供支持。 文件详解 文件名称:SNP White Canary Genotypes.xlsx...
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Dryad_草莓杂交种性别决定染色体与性二态性遗传定位研究数据
数据集概述 本数据集围绕天然杂交草莓(Fragaria × ananassa subsp. cuneifolia)的性别决定染色体与性二态性展开研究,通过遗传连锁图谱分析杂交种的性别表达机制,对比亲本物种与杂交种的性二态性差异,探索性别功能相关数量性状位点(QTL)的位置与数量变化。数据集包含2个压缩文件,用于支持相关遗传学研究。 文件详解...
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DGRP_Based果蝇低温存活曲线遗传变异及候选基因关联数据
数据集概述 本数据集记录了果蝇遗传参考面板(DGRP)中36个品系在7个低温(-1至-7°C)下1小时冷休克的存活情况,构建了各基因型的高分辨率存活响应曲线,识别出四种不同曲线形状,并提出累积耐寒性(CCT)新指标,关联候选基因及功能验证结果。 文件详解 文件名称:Teets Dryad Data.xlsx 文件格式:XLSX...
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GPCRdb_Based_趋化因子G蛋白偶联受体突变标注数据集
数据集概述 本数据集为标准化整理的趋化因子G蛋白偶联受体(GPCR)突变数据,包含2004个定量突变数据点,覆盖10种趋化因子GPCR,数据标注遵循GPCRdb标准,基于Scholten等人2012年发表于BJP的研究构建。 文件详解 文件名称:GPCR_mutations_chemokine.xlsx 文件格式:XLSX...
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Genomic_Based_家犬驯化双起源基因组与考古证据数据
数据集概述 本数据集包含家犬驯化双起源研究的基因组与考古相关数据,涉及59只古代犬的基因序列及1只爱尔兰新石器时代晚期犬的全基因组数据。数据支撑了家犬可能在欧亚大陆东部和西部独立驯化的结论,可用于分析家犬驯化的地理与时间起源争议。 文件详解 文件名称:mtDNA_info.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:可能包含线粒体DNA相关信息...
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饮食适应_犬类_史前农业_基于农业传播的犬类饮食适应进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕犬类饮食适应与史前农业传播的关联展开,聚焦AMY2B基因拷贝数变化这一关键特征,分析犬类从狼演化过程中适应高淀粉饮食的机制,探讨其与人类农业发展的关系,涵盖全球不同区域犬类的基因拷贝数多样性数据。 文件详解 文件名称:Supplementary_table_1.xlsx 文件格式:XLSX...
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Dt1_locus_大豆_定型生长习性_软扫选育_选择标记_数据
数据集概述 本数据集聚焦大豆Dt1基因座的软选择信号,旨在解析决定大豆有限生长习性的驯化性状遗传机制。通过分析Dt1基因及周边约800kb区域的核苷酸变异,识别出4个不同大小的局部非对称硬选择信号,构成适应性软选择,揭示选择强度、时间及等位基因多起源特征,为作物驯化进化研究提供数据支持。 文件详解 README文件...
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MR研究_非洲裔人群脂质性状糖尿病颈动脉内膜中层厚度关联分析数据
数据集概述 本数据集为孟德尔随机化(MR)研究“Genetically predicted lipid traits, diabetes mellitus liability and carotid intima-media thickness in African ancestry...
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PCSK9_Based_钙化主动脉瓣狭窄遗传与体外抑制研究数据集
数据集概述 本数据集为论文“Genetic and In Vitro Inhibition of PCSK9 and Calcific Aortic Valve Stenosis”的原始数据,核心研究PCSK9抑制作为钙化主动脉瓣狭窄(CAVS)治疗策略的可能性,包含遗传分析、瓣膜组织表达检测及体外细胞实验的原始数据,共1个文件。 文件详解...
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Teno_Based_大西洋鲑鱼自然种群海龄变异遗传机制研究数据
数据集概述 本数据集包含北欧大西洋鲑鱼自然种群海龄变异的基因组SNP分析数据,通过GWAS和FST离群分析识别与海龄相关的基因组区域,涉及肌肉发育、代谢、免疫反应和配偶选择等相关基因,揭示海龄变异的遗传基础及种群分化机制。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_TenoSeaAgeDryadData.txt 文件格式:TXT...
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Dryad_Colias蝴蝶_UV虹彩求偶信号_遗传机制研究数据
数据集概述 本数据集来自Dryad仓库,围绕Colias eurytheme蝴蝶雄性UV虹彩这一求偶信号的遗传机制展开,包含种群遗传数据、连锁分析代码、基因注释文件等,用于揭示该信号分化的遗传基础及与物种形成的关系,共14个文件。 文件详解 文档类文件(.txt)...
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CRISPR_Frost_Based果蝇低温暴露繁殖保护研究数据
数据集概述 本数据集为CRISPR技术诱导Frost基因敲除的果蝇低温繁殖研究数据,包含果蝇低温暴露后繁殖能力相关的定量数据,验证Frost蛋白对雌蝇繁殖力的保护作用,不涉及直接低温存活影响,是果蝇低温耐受性遗传机制研究的关键数据支撑。 文件详解 文件名称:QuantitativeData Resubmission.xlsx 文件格式:XLSX...
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KITLG_Based巴基斯坦山羊品种毛色模式基因组关联研究数据
数据集概述 本数据集为巴基斯坦两个山羊品种毛色模式的基因组分析研究数据,通过GoatSNP50芯片对35只具花斑(roan)毛色的山羊(A组)与740只无该毛色的山羊(B组)进行基因分型,结合纯合子运行(ROH)和XP-EHH分析,识别出3个潜在关联基因组区域,其中5号染色体上含KITLG基因的区域差异最显著,支持该基因与山羊花斑毛色相关的假设。...
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Polyceraty_Damara绵羊多角性状基因组关联研究数据
数据集概述 本数据集包含Damara绵羊多角性状(Polyceraty)的基因组关联研究数据,涉及43只Damara绵羊的表型记录与606006个SNP标记的基因分型数据。研究定位到绵羊2号染色体上与多角性状关联的区域,涉及9个HOXD基因,为解析该性状的遗传机制提供基础数据。 文件详解...
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QTL_Based_干豌豆倒伏茎秆强度产量农艺性状关联标记数据集
数据集概述 本数据集记录了干豌豆中与倒伏、茎秆强度、产量等重要农艺性状相关的数量性状座位(QTL)信息,包含330个标记及对应的序列数据,为干豌豆的遗传育种研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Dataset for Quantitative Trait Loci Associated with Lodging, Stem Strength,...
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Lepus_HPRT1_SMCX_伊比利亚野兔线粒体基因研究数据
数据集概述 本数据集包含伊比利亚野兔线粒体相关遗传数据,围绕北方野兔线粒体在伊比利亚多次物种入侵中存活现象展开,涉及杂交与等位基因冲浪作用研究。数据集含5个文件,主要记录野兔的基因序列与微卫星数据,为分析物种入侵中的遗传渐渗机制提供基础。 文件详解 文件名称:Melo_Ferreira_et_al_HPRT1_complete.fas 文件格式:FAS...
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Pyrenean_Rocket_外来植物物种快速遗传适应研究数据
数据集概述 本数据集围绕外来植物Pyrenean Rocket(Sisymbrium austriacum subsp. chrysanthum)的快速遗传适应展开,对比其原生种群、当前扩散的非原生种群及历史引入基因库的基因SNP频率变化,揭示其在定殖阶段开花时间基因的显著分化,为外来物种扩散前的遗传适应机制研究提供数据支持。 文件详解...



