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gonorynchiform_Based_鼠鱚目鱼类系统发育与分化时间研究数据
数据集概述 本数据集包含鼠鱚目鱼类系统发育关系与分化时间研究的相关数据，基于九个核基因的DNA序列及已发表的形态学特征矩阵，通过贝叶斯系统发育分析等方法，探究鼠鱚目鱼类的系统发育与分化时间，涉及不同基因树的一致性、类群单系性及分化时间估计等内容。 文件详解 README文件 文件名称：README_for_gonorynchALL.txt...
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Desmognathus_Based蝾螈发育生活史与气候生态位演化关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕Desmognathus属蝾螈适应性辐射展开，包含系统发育树、DNA序列、气候生态位数据及补充表格等7个文件，用于探究发育生活史（幼体阶段长度）与气候生态位演化速率的关联，揭示生活史特征对蝾螈气候生态位分化的影响机制。 文件详解 Desmog_62taxa11loci_speciestree.nex 文件格式：NEX...
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Mytilus_edulis_MGD2抗菌肽基因基于现有遗传变异的适应证据数据
数据集概述 本数据集围绕海洋贻贝Mytilus edulis的抗菌肽MGD2基因L31R多态性展开，通过分析DNA序列多态性、等位基因频率及连锁不平衡等，探究该位点受选择的机制，验证选择是否作用于现有遗传变异，为理解贻贝适应环境的遗传基础提供数据支持。 文件详解 文件名称：MGD2_poly.gtx 文件格式：GTX...
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Damma_Glacier_Based_冰川前缘土壤演替梯度微生物垂直分布数据
数据集概述 本数据集记录瑞士Damma冰川前缘不同演替阶段（ barren、sparsely-vegetated、transient、vegetated）和不同深度（surface、5 cm、20 cm）土壤中细菌和真菌群落的垂直分布特征，通过454焦磷酸测序技术分析微生物群落结构差异，包含3个压缩文件。 文件详解...
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Nilsson_2017_MycoKeys_真菌DNA序列质量修剪研究补充材料
数据集概述 本数据集是论文《公共真菌DNA序列远端的基于读取质量的修剪远未达到令人满意的水平》的补充材料1，包含真菌基因组/重叠群的目标信息。数据以Excel表格形式呈现，用于支持真菌DNA序列质量修剪相关研究，为生物信息学分析提供目标序列的详细背景。 文件详解 文件名称：oo_150049.xlsx 文件格式：XLSX...
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DNA_Metabarcoding_Based共栖蝙蝠姊妹种生态位分化研究数据
数据集概述 本数据集基于DNA宏条形码技术，分析同域分布的姊妹蝙蝠物种（Rhinolophus euryale和R. mehelyi）的觅食生态位分化机制，以探究其共存策略。数据包含蝙蝠个体信息、食性矩阵及猎物物种分子序列，为理解食虫蝙蝠物种间资源利用差异提供支撑，共含3个文件。 文件详解 文件名称：bat_individuals_data.xlsx...
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Garrick_etal_2018b_Based_谱系融合系统发育地理学模拟数据
数据集概述 本数据集包含用于探究谱系融合的模拟DNA序列单倍型数据，通过近似贝叶斯计算框架，分析检测谱系融合所需的基因座数量与个体样本量，支持对种群历史和一致性水平的推断研究。 文件详解 README_for_Garrick_etal_2018b_Simulated_Data.txt 文件格式：TXT...
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GBIF_Bionomia_Phyllomedusa新种标本采集者鉴定者关联数据
数据集概述 本数据集关联了秘鲁北部亚马逊森林中发现的叶蛙属（Phyllomedusa）新种标本的采集者与鉴定者信息，基于DNA序列揭示的形态隐秘种研究，包含8个压缩文件和1个数据包装描述文件，总计9个文件，用于支持两栖动物分类学与生物多样性研究。 文件详解 压缩文件（.zip格式，共8个）...
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DNA_metabarcoding_Based_欧洲蝙蝠食性与农业生态互作研究数据
数据集概述 本数据集基于DNA元条形码技术，分析欧洲常见弯翼蝙蝠（Miniopterus schreibersii）的食性与农业生产的关系。通过检测蝙蝠粪便中的节肢动物DNA序列，探究其对农业害虫的捕食情况及农业环境对其食性生态位的影响，包含3个压缩文件。 文件详解 文件名称：README_for_zeale_sequences.zip...
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Centrarchidae_Source_鲈科鱼类系统发育与多样化时间尺度研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美淡水鱼类鲈科（Centrarchidae）的系统发育与多样化时间尺度研究，包含16个核基因的DNA序列数据、形态学数据集及化石校准信息，覆盖几乎所有已知及未描述物种，用于解析鲈科鱼类的演化关系与分化时间。 文件详解 基因序列文件（.nex格式，34个）...
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Galápagos_Serpentes_Dipsadidae_蛇类辐射演化研究数据
数据集概述 本数据集围绕加拉帕戈斯蛇类辐射演化研究展开，包含系统发育分析相关的序列比对、字符集定义及时间校准树文件，支持揭示该类群的起源与隐藏多样性，涉及Pseudalsophis属等物种的分类与演化研究，共7个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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DeepSTARR_manuscript_Based_基因组区域DNA序列与活性数据
数据集概述 本数据集包含训练和评估DeepSTARR模型所用的基因组区域DNA序列数据、序列活性数据，以及已训练的DeepSTARR模型文件。数据集共8个文件，涵盖训练集、验证集、测试集的序列与活性信息，支持基因组学相关模型的训练与性能评估。 文件详解 序列数据文件...
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Loligo_vulgaris_Based西伊比利亚半岛海域幼体胃含物DNA序列数据
数据集概述 本数据集包含从西伊比利亚半岛海域采集的31只Loligo vulgaris幼体的胃含物DNA序列。这些幼体体长范围为1.61至6.01毫米，日龄介于2至28天。通过解剖幼体消化系统提取DNA，并扩增线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因的300bp片段，最终在Illumina MiSeq平台完成测序，数据集仅包含一个文件。 文件详解...
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Candida_albicans_CDR1_白色念珠菌多药耐药ABC转运蛋白序列数据
数据集概述 本数据集包含白色念珠菌（Candida albicans）多药耐药ABC转运蛋白CDR1的序列数据，涉及DNA和氨基酸序列两类文件，可用于生物信息学相关的基因结构、进化分析等研究。 文件详解 文件名称：combined_CaCDR1_aa_FINAL(2).fasta 文件格式：FASTA...
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Mediterranean_Based_地中海植物群上新世_更新世生态位演化系统数据
数据集概述 本数据集围绕地中海盆地两种莎草姐妹种（Carex属）展开，聚焦其上新世至更新世的生态位演化过程，以及该过程对物种系统地理格局的塑造作用。通过整合化石记录、多源DNA数据和生态位模型分析结果，为理解植物对气候变迁的适应机制提供支持，数据集含1个文件。 文件详解 文件名称：AppendixS3.xlsx 文件格式：XLSX...
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Phylacomantis_Based_Gephyromantis分子系统学研究数据
数据集概述 本数据集为论文《Gephyromantis（Phylacomantis）亚属的分子系统学研究及新亚种描述》的配套数据，包含研究中使用的DNA序列信息、样本凭证、GenBank登录号、地理来源等数据，以及用于系统发育分析的文件，共4个文件，支持两栖动物分类学与系统发育研究。 文件详解...
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Schneider_2020_Ochnaceae科核基因靶向富集系统基因组学研究数据
数据集概述 本数据集包含Ochnaceae科植物的DNA序列比对文件，涵盖单个基因比对和所有基因串联比对结果，以及用于核基因靶向富集的探针序列诱饵集。数据支撑相关论文中的系统发育分析，涉及超过250个分类群，共6个文件。 文件详解 串联比对文件...
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来自难民区内外的_Dryad_数据库_北美凯撒蘑菇物种复合体多样性与种群历史研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美凯撒蘑菇物种复合体展开，聚焦其多样性与种群历史特征，探讨更新世气候动态对真菌的影响。包含广泛地理采样及三个核蛋白编码基因的DNA序列，通过系统发育和溯祖方法分析物种界定、避难所多样性、种群大小变化及分布范围迁移等内容，揭示真菌对历史气候变化的响应模式。 文件详解 文件名称：Dryad.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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MycoKeys补充材料1_热带小煤炱目寄生菌系统修订DNA分析补充材料_2024年
数据集概述 本数据集是论文《热带小煤炱目寄生菌Atractilina和Spiropes属物种系统修订》的补充材料1，包含Atractilina parasitica、Malacaria meliolicola及其他座囊菌纲物种DNA序列分析过程中生成的比对文件和系统发育树，支持真菌分类学研究。 文件详解 文件名称：oo_1024025.docx...
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Suwallia_Phylogenomics_石蝇属系统发育基因组学研究数据2020
数据集概述 本数据集为石蝇属Suwallia（襀翅目：绿襀科）的系统发育基因组学研究数据，基于全基因组超保守元件（UCE）位点的DNA序列数据构建该属首个分子系统发育树，评估其单系性，揭示分类学问题及生物地理历史，包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：suwalliaphylogenomics2020-main.zip 文件格式：ZIP...
