数据集概述
本数据集为论文《Gephyromantis(Phylacomantis)亚属的分子系统学研究及新亚种描述》的配套数据,包含研究中使用的DNA序列信息、样本凭证、GenBank登录号、地理来源等数据,以及用于系统发育分析的文件,共4个文件,支持两栖动物分类学与系统发育研究。
文件详解
- 文件名称:Phylacomantis_DNA_sequences_Genbank_19March2024.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含DNA序列相关信息,可能涵盖样本ID、物种、分离株、凭证标本、采集地、各基因(16S、KIAA1239、SACS、RAG1、POMC)的GenBank登录号及序列
- 文件名称:Phylacomantis_DNA_sequences_Genbank_19March2024.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含seqid、organism、isolate、specimen_voucher、locality、accession_16S、sequence_16S、accession_KIAA1239、sequence_KIAA1239、accession_SACS、sequence_SACS、accession_RAG1、sequence_Rag1、accession_POMC、sequence_POMC字段
- 文件名称:Gephyromantis_16S_NCBI_combined_Tree_FASTA_CUT_trimmed_MolD.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:用于系统发育分析的FASTA格式文件,包含修剪后的16S基因序列数据
- 文件名称:Gephyromantis_16S_NCBI_combined_Tree_FASTA_CUT_trimmed.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:用于系统发育分析的FASTA格式文件,包含修剪后的16S基因序列数据
数据来源
论文“Scherz, M.D.等(2024): Molecular systematics of the subgenus Gephyromantis (Phylacomantis) with description of a new subspecies. – Zootaxa 5446: 205-220.”
适用场景
- 两栖动物分子系统学研究: 用于分析Gephyromantis(Phylacomantis)亚属的系统发育关系
- 生物分类学验证: 支持新亚种的分类学地位验证及物种界定
- DNA序列数据库补充: 提供标准化的DNA序列及样本信息,可补充至公共基因数据库
- 生物地理学分析: 结合样本地理来源数据,研究该亚属的地理分布模式
- 系统发育方法应用: 用于测试或验证分子系统发育分析方法的有效性