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bird_mitochondrial_Based_鸟类线粒体DNA体重校正分子速率研究数据
数据集概述 本数据集为鸟类线粒体DNA体重校正分子速率研究的工作实例,包含475种鸟类线粒体基因组数据,通过分析体重与替代速率的关系构建校正模型,用于提升鸟类分子定年研究的准确性。数据集含9个文件,涵盖示例数据、代码及结果文件。 文件详解 文档文件...
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OGRDB_Mouse_IGH_Germline_Reference_Set_LEWES_EiJ
数据集概述 本数据集为小鼠LEWES/EiJ品系的IGH基因胚系参考集,包含4个文件,涉及许可说明、带间隙/无间隙的FASTA序列文件及JSON格式数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),用于生物信息学领域的基因研究。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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Solenopsis_invicta_Based_火蚁社会超基因多重大倒位与基因表达断点重排研究数据
数据集概述 本数据集围绕红火蚁(Solenopsis invicta)社会超基因的进化展开,包含超基因倒位区域的克隆、基因内容分析及表达调控机制研究相关数据。涉及多个大型倒位事件(>9 Mb和>800 Kb)的鉴定、时间顺序分析,以及倒位对邻近基因启动子的影响研究,为理解超基因的形成机制与选择优势提供支撑,共含14个文件。 文件详解...
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PaschalOConnorData_EmmaTeelingSupervisor_爱尔兰蝙蝠食性研究数据
数据集概述 本数据集围绕爱尔兰蝙蝠的食性展开,包含两种格式的文件,分别为Excel表格和FASTA序列文件,总计2个文件。数据未进行训练测试、数据标签或原始处理的拆分,可用于爱尔兰蝙蝠食性相关的生物研究分析。 文件详解 PaschalOConnorData_EmmaTeelingSupervisor.xlsx 文件格式:XLSX...
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Baldelli_Pseudomonas_aeruginosa_sirB2基因控制厌氧适应性及毒力相关原始数据
数据集概述 本数据集为Baldelli等发表的铜绿假单胞菌sirB2基因研究的原始数据,包含支撑论文结果的实验数据文件,涉及该基因在厌氧条件下的适应性调控、毒力变化及小菌落变异体形成相关的原始实验记录,共7个文件。 文件详解 实验原始数据文件(.xlsx格式,6个)...
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家庭铜绿假单胞菌空间结构维持绿脓菌素抑制多样性数据集
数据集概述 本数据集围绕家庭环境中铜绿假单胞菌的绿脓菌素抑制多样性展开,包含空间结构分离菌株的抑制实验、碳源利用及遗传距离数据,用于探究空间分布对微生物抑制模式的影响机制。 文件详解 README.pdf:PDF格式,可能包含数据集背景、实验方法、文件说明等补充信息 SAS_code.pdf:PDF格式,可能包含用于数据分析的SAS代码文件...
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Maker_Based_Eukaryotic_Genome_真核生物基因组注释完整数据
数据集概述 该数据集包含使用Maker工具进行真核生物基因组注释的输入与输出数据,涵盖统计摘要、序列文件、注释结果、可视化报告及训练模型等20个文件,为基因组注释结果的评估与分析提供全面支持。 文件详解 该数据集包含20个文件,具体说明如下: - 统计摘要文件: -...
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叉尾豆娘属雌性颜色多态性分子系统发育数据集
数据集概述 本数据集围绕叉尾豆娘属(Ischnura)的分子系统发育展开,包含41个现存物种的分子数据与化石信息,通过多物种 coalescent 方法构建时间校准的系统发育树,分析雌性颜色多态性的宏进化历史,为研究该类群性限制多态性的动态演化提供基础。 文件详解 系统发育分析文件:...
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阿尔卑斯地区水生蓝细菌和真核微藻参考数据库覆盖度分析数据集
数据集概述 本数据集包含2019年阿尔卑斯地区37个湖泊和22条河流的浮游生物及生物膜样本高通量测序数据,涵盖蓝细菌16S rRNA和真核微藻18S rRNA的FASTA序列及blastn比对结果,用于分析参考数据库的分类覆盖度。 文件详解 描述文档: Dataset_Description_EAW.pdf:PDF格式,数据集说明文档...
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北美两种蛙类转录组资源数据集
数据集概述 本数据集提供北美两种蛙类( Lithobates clamitans 和 Pseudacris regilla )的转录组资源,含mRNA测序组装结果、抗菌肽注释及系统发育保守位点信息,支持比较基因组学、基因表达分析及分子标记开发。 文件详解 文档类文件:...
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阿塔卡马沙漠土壤生物多样性数据集
数据集概述 本数据集包含阿塔卡马沙漠线虫18S区域的fasta序列及相关分析文件,属于CRC1211“干旱极限下的地球演化”项目,支持复现“阿塔卡马沙漠土壤生物多样性的层级模式”研究,涵盖生态数据、遗传序列及多样性分析结果。 文件详解 核心数据文件:...
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分枝杆菌细胞色素P450酶的序列相似性网络与基因组邻域网络数据集
数据集概述 本数据集围绕分枝杆菌细胞色素P450酶展开,包含FASTA序列文件、网络分析结果图片及Cytoscape会话文件,支持通过序列相似性网络(SSN)和基因组邻域网络(GNN)研究该酶的功能,为未表征酶的功能预测提供数据基础。 文件详解 FASTA序列文件(共3个): CYPs from genus Mycobacterium 1 Oct...
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黑麦抗病性选育研究补充材料数据集
数据集概述 该数据集为黑麦(Secale cereale L.)抗病性选育研究的补充材料,围绕白粉病和叶锈病抗性,通过表型鉴定、目标测序及关联遗传学方法展开,包含多种格式的补充数据文件,为研究提供支撑。 文件详解 数据文件(.xlsx格式,共8个): Supplementary table S1.xlsx、Supplementary table...
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十字花科全基因组复制与形态多样性数据集
数据集概述 本数据集围绕十字花科(Brassicaceae)植物的嵌套全基因组复制(WGD)与形态多样性展开研究,包含物种清单、形态变异分析及基于质体基因组的属级系统发育数据,为探究基因组复制与物种分化、形态创新的关联提供支持。 文件详解 文件名称:...
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人类RNA结构预测突变谱数据集
数据集概述 该数据集提供了支撑humanRNAmap.wi.mit.edu平台结构预测流程的突变谱数据,为平均三次重复实验的结果,以标准bedGraph格式存储。数据集包含压缩文件和基因注释文件,为研究人类RNA结构与突变特征的关联提供数据基础。 文件详解 mutational_profiles.zip:压缩文件,可能包含核心突变谱数据文件...
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柳莺迁徙表型相关重复富集区域转座因子标记数据集
数据集概述 本数据集围绕柳莺迁徙表型相关的重复富集区域,收集了转座因子(TE)景观分析、核苷酸比对、遗传数据统计等多类型文件,用于支撑相关研究,为理解转座因子在迁徙表型中的作用提供数据基础。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件,具体说明如下: - HTML文件(共9个): -...
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Holozoa远缘分支p53家族同源物表征补充材料
数据集概述 本数据集为《Holozoa远缘分支p53家族同源物表征》文章的补充材料,包含13个文件,涉及p53家族同源物的结构预测、序列比对、进化分析等结果,支持研究p53家族的古老起源。 文件详解 PDF文件(10个): 如Supplementary material 08 p-values of all domain hits in non-...
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短柄草多倍体同源亚基因组与幽灵亚基因组溯源数据集
数据集概述 本数据集围绕短柄草属多倍体植物的亚基因组溯源展开,包含通过转录组系统发育、亚基因组检测算法及染色体条形码分析得到的结果,涉及现存二倍体物种及未知幽灵祖先基因组的鉴定,为解析多倍体形成机制提供数据支持。 文件详解 文档类文件: README_DRYAD_files.pdf: PDF格式,可能包含数据集文件说明、使用方法等文档内容...
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牛粪便_土壤及施肥土壤样本的111个宏基因组组装基因组数据集
数据集概述 本数据集包含111个宏基因组组装基因组(MAGs)的序列及相关信息,样本来源为抗生素预防下奶牛新鲜粪便、两个有机农场牧场土壤及施肥土壤构建的微宇宙。数据支持微生物组分类、功能及生态关联研究。 文件详解 文件名称: MAGs_FASTA_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容: 包含所有宏基因组组装基因组的FASTA序列文件...
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Progenio病原菌比较蛋白质基因组学分析补充数据集
数据集概述 该数据集为病原菌比较蛋白质基因组学分析的补充数据,围绕两种毒力差异的北京家族结核分枝杆菌菌株展开,支持Progenio分析流程的验证与应用,包含表格、序列、图像等多类型文件。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 表格文件(.xlsx,15个): -...



