-
中美洲热带雨林近期局域超级多样化数据集
数据集概述 本数据集包含中美洲热带雨林近期局域超级多样化研究相关的系统发育树文件、多样化分析脚本及输入数据，支持复现研究中的谱系时间树（LTT）图和地史物种形成-灭绝分析（GeoSSE）等结果，为相关演化研究提供数据基础。 文件详解 该数据集包含7个独立文件，具体说明如下： - 系统发育树文件（.tre格式，共4个）： -...
-
松材线虫与松墨天牛相关蛇形真菌系统发育树补充材料2018
数据集概述 该数据集为2018年发表的中国松材线虫与松墨天牛相关蛇形真菌研究的补充材料，包含基于ITS1–5.8S–ITS2 rDNA及部分tub2序列构建的系统发育树PDF文件，辅助展示研究物种的系统发育关系。 文件详解 文件名称: oo_226789.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
-
真蟋蟀第五科分类表数据集
数据集概述 本数据集为真蟋蟀（直翅目：螽亚目：蟋蟀总科）第五科Oecanthidae的分类表，基于最大似然法（ML）、最大简约法（MP）和贝叶斯推断（BI）系统发育树结果，提出该科的新分类体系。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 文件内容:...
-
更新世海平面波动对东南亚生物多样性热点地区进化动力学影响数据集
数据集概述 本数据集围绕更新世海平面波动对东南亚生物多样性热点地区进化动力学的影响展开，包含6个淡水鱼类属的系统发育分析结果、多样化模型参数及古地理重建相关的表格与图表，为研究该区域物种形成与扩散机制提供数据支持。 文件详解 数据表格文件（.xlsx格式，共6个）：...
-
Soroseris_hookeriana复合体贝叶斯推断系统发育树补充材料2018
数据集概述 本数据集为植物学研究补充材料，包含基于核基因内转录间隔区、psbA-trnH和matK联合序列构建的贝叶斯推断50%多数规则一致树，用于展示青藏高原Soroseris hookeriana复合体的辐射演化关系。 文件详解 文件名称: oo_252441.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明:...
-
松球蚧科线粒体基因组系统发育分析补充材料4
数据集概述 本数据集为补充材料4，包含基于贝叶斯推断（BI）方法构建的胸喙亚目（Sternorrhyncha）系统发育树图像文件，用于支持松球蚧科（Matsucoccidae）线粒体基因组及其系统发育位置的研究，为半翅目昆虫分类与进化分析提供可视化数据支持。 文件详解 文件名称: oo_759530.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容:...
-
病原体有效种群规模增长与衰退建模数据集
数据集概述 本数据集围绕病原体有效种群规模的增长与衰退建模展开，提出非参数自回归模型用于贝叶斯系统动力学推断框架，可更真实地模拟流行病历史，正确重构病原体谱系中的流行病增长与衰退趋势，并通过回归方法关联病原体有效种群规模增长率与影响其复制适应性的时变变量。 文件详解 文件名称：suppFigs.pdf 文件格式：PDF...
-
基于全地幔密度模型的地幔粘度贝叶斯推断数据集2020
数据集概述 本数据集为2020年发表的地幔粘度贝叶斯推断研究的补充数据，包含复现论文图表所需的完整集合解及相关说明文档，支持验证和扩展地幔结构相关研究。 文件详解 文件名称: Rudolph_etal_2020_README.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 研究说明文档，提供数据集的背景、使用方法等关键信息 文件名称:...
-
Coxobolellus属物种系统发育关系补充材料5
数据集概述 本数据集为Coxobolellus属物种系统发育关系的补充材料，基于16S rRNA基因片段（458 bp）的比对数据，通过最大似然分析（ML）和贝叶斯推断（BI）方法构建系统发育树，支撑相关分类学研究。 文件详解 文件名称: oo_767379.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含基于16S rRNA基因序列（458...
-
东海沉水木材贻贝科Idas属新物种系统发育分析补充材料2025
数据集概述 该数据集是论文《东海沉水木材中贻贝科Idas属两个新物种的描述、系统发育位置及共生体》的补充材料，包含基于cox1和16S基因构建的深海贻贝亚科（Bathymodiolinae）贝叶斯推断（BI）系统发育树，为物种分类及进化关系研究提供可视化数据支持。 文件详解 文件名称: oo_1304790.png 文件格式: PNG（.png）...
-
系统发育学中概率图形模型表示数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育学中的概率图形模型表示展开，通过引入树板等新组件，扩展标准图形模型框架以适配系统发育树结构，提供模型表示案例与配套数据，助力系统发育模型的教学、交流及通用软件开发。 文件详解 数据文件: baculumData01.nex: NEX格式文件，可能为系统发育分析的原始数据文件 mammalia_dosReis.tree:...
-
早期羊膜动物系统发育与副爬行纲及巨蜥科亲缘关系数据集
数据集概述 本数据集围绕早期羊膜动物的系统发育研究展开，包含支持新系统发育假说的形态学数据、分析脚本及说明文档。该假说对传统认知提出挑战，涉及巨蜥科在哺乳类干群中的位置、副爬行纲与双孔亚纲的嵌套关系等关键问题，为理解羊膜动物早期演化提供数据支持。 文件详解 该数据集包含7个文件，具体说明如下： - 数据矩阵文件： -...
-
鳞翅目夜蛾总科选定物种线粒体基因组比较数据集
数据集概述 该数据集包含19种夜蛾总科物种的完整线粒体基因组序列及其注释数据，涉及遗传组成分析与分子特征研究。结合NCBI数据库数据，探究该类群的系统发育关系，为夜蛾总科的分类学与系统发育研究提供分子依据。 文件详解 基因组序列文件: GENBANK FLAT FILES 19 SPECIES.zip:...
-
谱系特异性出生死亡率贝叶斯推断的多类型生死模型数据集
数据集概述 该数据集围绕多类型生死模型（MTBD）展开，用于贝叶斯推断谱系特异性的出生死亡率。模型无需预设驱动速率差异的特征，可应用于物种系统发育的分化灭绝率及病原体传播树的传播恢复率研究，提供模型实现代码、数据文件及补充文档。 文件详解 数据压缩包： data_files.zip：ZIP格式压缩包，包含模型验证及实证分析所用的数据集 代码压缩包：...
-
贝叶斯系统发育推断的自适应树提议补充材料
数据集概述 本数据集为贝叶斯系统发育推断的自适应树提议研究的补充材料，包含PDF文档，涵盖树后验分布近似方法、遍历性自适应树提议构建、路径自适应树提议实例，以及扩展结果与系统发育信息含量分析。 文件详解 文件名称：SupMatAdaptiveTreeProposals.pdf 文件格式：PDF 文件内容： 树后验分布近似方法说明...
-
缅甸Herpetoreas_xenura分类学重新评估附录3数据集
数据集概述 本数据集为《缅甸Herpetoreas xenura分类学重新评估及新种描述》研究的附录3内容，记录了用于贝叶斯推断和最大似然法系统发育分析的最佳分区方案与核苷酸替代模型选择结果。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: 包含三个主要列： Partitions:...
-
日本菊花螺线粒体基因组系统发育分析补充材料6
数据集概述 本数据集为日本菊花螺（Siphonaria japonica）线粒体基因组研究的补充材料，核心内容是基于线粒体13个蛋白编码基因（PCGs）核苷酸序列，通过贝叶斯推断（BI）分析构建的系统发育树图像文件。 文件详解 文件名称: oo_1346639.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
-
金线兰属物种贝叶斯推断系统发育关系补充材料
数据集概述 本数据集为金线兰属物种系统发育关系研究的补充材料，包含基于ITS、rbcL、matK和trnL-F序列串联分析的贝叶斯推断（BI）结果图片，用于直观展示物种间的亲缘关系。 文件详解 文件名称: oo_926191.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明:...
-
Nitzschia属SSU_rDNA贝叶斯推断系统发育树补充材料13
数据集概述 本数据集为新物种Nitzschia nandorii相关研究的补充材料，包含基于SSU rDNA分子标记构建的Nitzschia属贝叶斯推断系统发育树图像文件，用于支持该新物种的系统发育分析。 文件详解 文件名称: oo_1020080.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 展示基于SSU...
-
Dysoxylum属系统发育研究附录2核苷酸替代模型数据集
数据集概述 该数据集为研究Dysoxylum属系统发育的学术论文附录2，记录了在贝叶斯推断（BI）分析中，对不同分子标记（ITS、ETS、trnL-F、rps15-ycf1）在使用和不使用Gblocks处理时所采用的核苷酸替代模型，为系统发育分析方法提供参考。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
