谱系特异性出生死亡率贝叶斯推断的多类型生死模型数据集

数据集概述

该数据集围绕多类型生死模型（MTBD）展开，用于贝叶斯推断谱系特异性的出生死亡率。模型无需预设驱动速率差异的特征，可应用于物种系统发育的分化灭绝率及病原体传播树的传播恢复率研究，提供模型实现代码、数据文件及补充文档。

文件详解

• 数据压缩包：
• data_files.zip：ZIP格式压缩包，包含模型验证及实证分析所用的数据集
• 代码压缩包：
• code_files.zip：ZIP格式压缩包，包含BEAST~2软件中MTBD模型的实现代码
• 补充文档：
• Supplement.pdf：PDF格式文档，提供模型细节、模拟实验及实证分析的补充说明

适用场景

• 进化生物学研究：分析物种系统发育树中的谱系特异性分化与灭绝速率
• 病原动力学研究：推断病原体传播树中的谱系特异性传播与恢复速率
• 贝叶斯建模应用：探索无需预设特征的异质性种群动态推断方法
• 生物信息学工具开发：基于BEAST~2平台扩展多类型生死模型的应用场景