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甲型流感病毒K_mer基高效基因组监测数据库
数据集概述 本数据集为甲型流感病毒基因组监测设计的K-mer基数据库，包含50个亚型的独特子序列，涵盖18种血凝素（HA）和11种神经氨酸酶（NA）亚型。基于NCBI 2022年5月数据构建，通过泛基因组工具生成亚型特异性及共享序列，支持高效亚型分类。 文件详解...
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亨廷顿蛋白互作因子在线数据库搜索数据集20180808
数据集概述 该数据集记录了在2018年8月8日进行的亨廷顿蛋白互作因子在线数据库搜索项目结果，提取并整理了9个数据库中亨廷顿蛋白的互作伙伴信息，包含原始数据、汇总数据及排名结果，为研究亨廷顿蛋白的结构与功能提供数据支持。 文件详解 文件名称: Huntingtin interactors search in online databases –...
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Pseudosulfitobacter_pseudonitzschiae与Cellulophaga_lytica滑行菌落互作研究数据集
数据集概述 本数据集包含支持题为“Pseudosulfitobacter pseudonitzschiae hitchhikes on gliding colonies of Cellulophaga lytica”（目前处于评审阶段）的手稿分析及图表生成所用的数据与R脚本，涉及两种细菌间的多层次非对称互作研究。 文件详解 文件名称:...
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野生棘冠海星季节性组织特异性基因表达补充数据集
数据集概述 本数据集为"野生棘冠海星季节性组织特异性基因表达揭示生殖与应激相关转录系统"研究的补充数据，包含基因表达原始与标准化数据、统计分析结果、可视化脚本、功能注释文件等46个文件，支持研究结果复现与深入分析。 文件详解 该数据集包含46个文件，覆盖数据、分析脚本、图表与注释等类型，具体说明如下： - 核心数据文件： - File 1. Raw...
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非破坏性昆虫DNA提取协议评估补充材料4
数据集概述 该数据集为研究论文的补充材料4，聚焦非破坏性昆虫DNA提取协议的评估。核心内容是一个生物信息学流程文档，支持昆虫宏条形码研究中DNA提取方法的优化分析，为相关实验设计与数据处理提供参考。 文件详解 文件名称：oo_702501.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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小鼠胚胎干细胞分化过程中RNA聚合酶II簇的显微评估数据集
数据集概述 本数据集包含小鼠胚胎干细胞（mESCs）分化过程中RNA聚合酶II簇的显微图像数据及MatLab分析脚本。研究通过两种诱导方式（撤去抑制因子-LIF、添加RHB）进行分化实验，记录不同时间点的细胞状态，为分析分化过程中RNA聚合酶II簇的动态变化提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型文件，具体说明如下： -...
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miRNA在重度先天性中性粒细胞减少症相关基因功能恢复中的作用补充数据集
数据集概述 本数据集为miRNA在重度先天性中性粒细胞减少症相关基因功能恢复中作用的研究补充数据，包含调控网络可视化、差异表达分析、模型参数估计、模拟突变数据及实验设计建议等内容，以PDF文件呈现相关图表与表格。 文件详解 文件名称：Supplementary Table S5.pdf 文件格式：PDF 内容：JAGN1基因与关联CNV MIR...
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Parthenoxylon转录组组装结果补充材料3
数据集概述 本数据集为《Characterisation of the Cinnamomum parthenoxylon (Jack) Meisn (Lauraceae) transcriptome using Illumina paired-end sequencing and EST-SSR markers development for...
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DGRP黑腹果蝇基因型向参考基因组v6_0转换及质控图表数据集
数据集概述 本数据集包含DGRP黑腹果蝇基因型从旧版本向参考基因组v6.0转换的结果，涵盖VCF和PLINK格式基因型文件、转换运行代码、日志文件、统计摘要及质控图表，用于展示SNP位置变化情况。 文件详解 基因型数据文件： dgrp2_dm6_dbSNP.vcf.gz：压缩VCF格式基因型文件...
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TCGA_Tumor_Purity_Based_肿瘤纯度估算完整数据集
数据集概述 该数据集提供了通过InfiniumPurify方法估算的所有TCGA肿瘤类型的肿瘤纯度数据，为肿瘤样本纯度分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：TCGA_tumor_purity.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 内容说明：压缩包内包含所有TCGA肿瘤类型的肿瘤纯度估算数据，具体字段及结构需解压后查看原始文件内容 适用场景...
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库蚊属致倦库蚊tim基因序列中性密码子分析补充材料
数据集概述 本数据集为研究论文的补充材料，包含库蚊属致倦库蚊两种形态tim基因序列的中性密码子分析结果，通过统计量（dN - dS）及拒绝严格中性假设（dN = dS）的概率，呈现基因序列差异特征。 文件详解 文件名称: oo_105869.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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基因组注释Maker工作流数据集
数据集概述 本数据集包含基因组注释Maker工作流的输入与输出文件，涵盖注释结果、统计摘要、可视化图表等多类型文件，为基因组注释研究提供完整数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件，具体说明如下： - 核心注释结果文件： - Maker_final_annotation.gff3：GFF3格式，基因组最终注释结果 -...
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AGENT数据流程指南及表型数据模板
数据集概述 该数据集为AGENT项目的数据流程指南，包含数据集成规范及配套表型数据模板。AGENT项目旨在整合基因库、研究机构等多源数据，涵盖护照数据、表型数据和基因组数据，指南适用于该项目及其他类似数据集成场景。 文件详解 文档文件：...
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三趾鸥与鸬鹚粪便DNA宏条形码饮食分析数据集2023
数据集概述 本数据集包含2023年繁殖季节期间从苏格兰西部收集的三趾鸥和鸬鹚个体粪便样本的DNA宏条形码分析数据，涵盖12S和COI基因标记的原始及过滤后生物信息学结果，以及样本详情和元数据。 文件详解 文件名称: 0_metadata.pdf 文件格式: PDF 内容: 数据集元数据，包含详细描述及使用说明 文件名称: Appendix 2. Raw...
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HDXRank深度学习框架蛋白质复合物预测排序数据集
数据集概述 本数据集包含用于训练HDXRank模型的氢氘交换质谱（HDX-MS）数据，该模型可基于实验HDX数据对蛋白质复合物预测结果进行排序。数据源自公共数据库，为蛋白质复合物预测的深度学习研究提供支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: example.zip - 文件格式: ZIP (.zip) - 内容说明:...
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Cinnamomum_parthenoxylon_Based_天料木转录组组装单基因长度数据完整图像
数据集概述 该数据集为Cinnamomum parthenoxylon转录组研究的补充材料5，核心内容是展示其从头转录组组装得到的单基因长度分布的图片，支持种群遗传学研究中的EST-SSR标记开发。 文件详解 文件名称: oo_1000532.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容: 对应图S3，展示Cinnamomum...
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AlphaFold2局限性克服的蛋白质序列深度突变扫描与稳定性选择数据集
数据集概述 本数据集围绕克服AlphaFold2对天然同源序列依赖的局限性展开，包含通过深度突变扫描和稳定性选择生成的人工同源蛋白质序列数据，用于提升稀疏序列家族蛋白质的结构预测准确性。 文件详解 该数据集包含5个压缩文件，具体说明如下： - Sibs-Seq.zip：ZIP格式压缩文件，内容未提供详细预览 -...
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细菌UL23_01_03的DFAST分析数据集
数据集概述 本数据集为细菌UL23-01-03的DFAST分析结果，包含基因组序列、注释信息、质量检查报告及功能分析数据，覆盖RNA、蛋白质、基因特征等多维度生物学信息，为该细菌的分子生物学研究提供全面数据支持。 文件详解 序列与注释文件： rna.fna.txt：TXT格式，包含tRNA等RNA序列信息...
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BioFuse基因表达可编程定时开关论文测序数据集
数据集概述 本数据集为论文《BioFuse: a programmable timer switch of gene expression》的配套测序数据，包含1个压缩文件，无目录结构，未划分训练/测试集、数据/标签或原始/处理数据，提供了该研究相关的基因表达测序原始数据。 文件详解 文件名称: BioFuse_Sequencing_data.zip...
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多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响数据集
数据集概述 该数据集包含论文《多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响》中使用的BPP控制文件，围绕物种树推断、MSC-I模型参数估计、MSC-M模型参数估计三类场景设计，提供模拟数据生成及分析所需的控制文件，支持不同错误率与定相策略下的基因组数据分析研究。 文件详解 压缩文件包： A00.I.zip：包含MSC-...
