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BioFuse基因表达可编程定时开关论文测序数据集
数据集概述 本数据集为论文《BioFuse: a programmable timer switch of gene expression》的配套测序数据，包含1个压缩文件，无目录结构，未划分训练/测试集、数据/标签或原始/处理数据，提供了该研究相关的基因表达测序原始数据。 文件详解 文件名称: BioFuse_Sequencing_data.zip...
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多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响数据集
数据集概述 该数据集包含论文《多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响》中使用的BPP控制文件，围绕物种树推断、MSC-I模型参数估计、MSC-M模型参数估计三类场景设计，提供模拟数据生成及分析所需的控制文件，支持不同错误率与定相策略下的基因组数据分析研究。 文件详解 压缩文件包： A00.I.zip：包含MSC-...
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美国西北太平洋沿岸花旗松核心种子真菌组跨种源数据集
数据集概述 本数据集围绕美国西北太平洋沿岸花旗松（Pseudotsuga menziesii var. menziesii）的种子真菌组展开，通过培养和非培养技术分析九个种源的种子真菌构成，识别出四个核心真菌类群，为研究种子核心微生物组及其对幼苗生长的功能影响提供数据支持。 文件详解 数据文件：...
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无参考算法发现植物转录组调控补充表数据集
数据集概述 本数据集为论文《A reference-free algorithm discovers regulation in the plant transcriptome》的补充材料，包含高粱、玉米、拟南芥等植物数据集的显著锚点及关联基因列表，用于生成论文图表的锚点-靶标组合计数数据，以及隐蔽剪接锚点示例数据，支持植物转录组调控机制研究。...
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外生菌根真菌SRP_RNA检测补充材料数据集2016
数据集概述 该数据集为2016年发表的外生菌根真菌信号识别颗粒（SRP）RNA检测研究的补充材料，包含cmsearch分析输出及引物细节，支持核核糖体ITS1区域的SRP RNA研究。 文件详解 文件名称: oo_88585.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 包含两部分核心内容：A)...
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柿属植物种群遗传学分析补充材料1
数据集概述 本数据集是基于EST-SSR标记的柿属植物（Diospyros mun）种群遗传学分析的补充材料，包含通过Nr数据库进行物种搜索的单基因序列分布情况的可视化结果。 文件详解 文件名称: oo_1068814.png 文件格式: PNG（.png） 文件内容: 展示单基因序列（unigenes）在Nr数据库中进行物种搜索的分布情况的图片文件...
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RNAtive识别RNA_3D模型中天然结构基准数据集
数据集概述 本数据集包含用于RNAtive工具基准评估的完整数据、分析脚本及图表，支持复现RNAtive与其他RNA 3D结构质量评估方法的对比分析，为RNA结构研究提供验证数据。 文件详解 文件名称：benchmark-rnative.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：包含论文"RNAtive to recognize native-like...
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Lychnophorinae进化中广泛古代杂交的系统基因组学研究数据集
数据集概述 该数据集包含研究论文《Phylogenomics reveal widespread ancient hybridization in the evolution of Lychnophorinae》的相关数据、脚本及图表，涉及系统基因组学分析、进化树构建与比较等内容，为复现研究结果提供支持。 文件详解...
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人参属植物叶绿体DNA条形码与全基因组NCBI登录号补充材料
数据集概述 本数据集为研究人参属植物叶绿体DNA条形码物种鉴别及应用的补充材料，包含研究所用DNA条形码序列和全叶绿体基因组的NCBI登录号，支持对人参属植物物种鉴定方法的验证与复现。 文件详解 文件名称: oo_631059.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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贝叶斯系统发育在线推断算法研究补充材料
数据集概述 本数据集为关于贝叶斯系统发育在线推断算法的研究补充材料，聚焦于解决传染病爆发监测中序列数据持续输入时的系统发育分析效率问题，提出了基于序贯蒙特卡洛（SMC）的在线算法及改进方案。 文件详解 文件名称: supplement.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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基于锁核酸的微小核糖核酸表达谱芯片补充数据集2006
数据集概述 本数据集为2006年发表的基于锁核酸（LNA）的微小核糖核酸（microRNA）表达谱芯片（miChip）研究的补充数据，包含支撑研究的实验数据表格、图表及相关说明文件，为理解该敏感芯片技术的性能与应用提供补充支持。 文件详解 数据表格文件（共5个，.xls格式）：...
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多模态无细胞RNA语言模型液体活检应用配套数据集
数据集概述 本数据集是论文《A multi-modal cell-free RNA language model for liquid biopsy applications》的配套数据，包含模型架构、参数、带噪无细胞RNA数据及相关矩阵和元数据文件，支持液体活检领域的多模态模型研究与应用。 文件详解...
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树协调空间探索与可视化数据集
数据集概述 本数据集围绕树协调（Tree Reconciliation）展开，包含相关研究的补充材料。树协调是用于研究宿主与寄生虫等生物协同进化的数学工具，数据集聚焦于树协调空间的度量方法、理论直径及可视化应用。 文件详解 文件名称：supplementary-material-2018-04-18.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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基于PRIMAD模型和BioCompute_Object的高通量测序案例研究RO_Crate数据集
数据集概述 该数据集是基于PRIMAD模型和BioCompute Object（BCO）的高通量测序案例研究RO-Crate，包含研究方法、数据文件及可视化图表等结构化内容，用于评估BCO框架的可重复性，为生物信息学分析的可靠性研究提供支持。 文件详解 ro-crate-metadata.json：JSON格式，RO-...
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AutoRNA_RNA三级结构预测变分自动编码器数据集
数据集概述 该数据集是论文《AutoRNA: RNA tertiary structure prediction using variational autoencoder》的配套数据，包含用于RNA三级结构预测的变分自动编码器模型相关的过滤后数据，以压缩包形式提供。 文件详解 文件名称: filtered_data.zip 文件格式:...
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多基因系统发育分析序列GenBank登录号数据集
数据集概述 该数据集提供用于多基因系统发育分析的序列GenBank登录号相关信息，包含一个图片文件，为相关研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: oo_79515.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明: 未提供文件内容预览，推测可能包含GenBank登录号列表或相关可视化信息 适用场景 分子系统发育研究:...
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转座子靶向非编码RNA转录的特异性TFIIB数据集
数据集概述 该数据集围绕转座子靶向非编码RNA的转录机制展开，核心聚焦于特异性TFIIB的调控作用。包含14个文件，以.bw格式文件为主，辅以.bed、.pdf、.fai、.fasta等格式文件，为研究非编码RNA转录与转座子靶向的分子机制提供多类型数据支持。 文件详解 主要数据文件（.bw格式，共9个）：...
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人类RNA结构预测突变谱数据集
数据集概述 该数据集提供了支撑humanRNAmap.wi.mit.edu平台结构预测流程的突变谱数据，为平均三次重复实验的结果，以标准bedGraph格式存储。数据集包含压缩文件和基因注释文件，为研究人类RNA结构与突变特征的关联提供数据基础。 文件详解 mutational_profiles.zip：压缩文件，可能包含核心突变谱数据文件...
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bioimage_io_bioimage_upload_Based_生物图像数据上传规范完整数据
数据集概述 该数据集是bioimage.io平台上的一个上传项目，包含图片、文档和配置文件等6个文件，涉及连接组学相关内容，未提供训练测试或数据标签等划分，文件类型以PNG格式为主。 文件详解 文件名称: Screen-Shot-2018-05-22-at-13.44.27.thumbnail.png，文件格式: .png，类型: 栅格文件 文件名称:...
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仓鼠基因间序列数据集
数据集概述 本数据集包含为Bgee 15.0版本构建的仓鼠（Mesocricetus auratus）基因间序列数据，基于十六个文库生成。涵盖基因间序列文件、分类统计数据及分布可视化文档，为基因表达分析提供基础数据支持。 文件详解 基因间序列文件: ref_intergenic.fa.gz: GZ压缩的FASTA文件，可能包含参考基因间序列数据...
