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BRG1_knockdown_ALCL细胞系转录组差异表达分析数据
数据集概述 本数据集记录了ALCL细胞系中BRG1基因经shRNA敲低后的转录组变化分析结果。通过转染shRNA降低BRG1的转录本和蛋白水平，对72小时后的细胞进行RNA测序，比较乱序shRNA与shRNA5处理组的差异基因表达，发现转录组显著改变，包含下调和上调基因，并通过通路富集分析探究BRG1影响的生理过程。数据集包含1个文件。 文件详解...
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Liu_dataset_20191016_单细β_肌动蛋白数量数据
数据集概述 本数据集为Excel文件，包含十列数据，分别对应A549、Hep G2、MCF 10A、HeLa、PC3、SACC-83、CAL 27、CAL 27-LN2、口腔肿瘤患者I、口腔肿瘤患者II十种细胞类型的单细β-肌动蛋白绝对数量，记录了不同细胞类型的细胞数量及对应β-肌动蛋白数据。 文件详解 文件名称：Liu-dataset...
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Tripidium_Based_新型生物能源草特性与改良研究数据集
数据集概述 本数据集围绕Tripidium属新型生物能源草的特性与改良展开，涵盖田间试验、转录组分析及组织培养转化体系研究三部分内容。包含生物量产量、细胞学、基因表达、组织培养参数等多维度数据，为Tripidium属植物作为温带生物能源作物的开发提供支撑，共含二十八份文件。 文件详解 文档类文件...
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Acropora_palmata_热胁迫_鹿角珊瑚幼虫转录响应数据
数据集概述 本数据集聚焦受威胁的鹿角珊瑚（Acropora palmata）幼虫对高温的转录响应差异，通过微阵列实验分析波多黎各种群幼虫在升温条件下的基因表达变化，涵盖发育基因加速表达、能量代谢途径激活及发育信号通路差异等内容，为理解珊瑚幼虫热胁迫适应机制提供分子层面数据。 文件详解 文件名称：SuppTableS3_Final.xlsx...
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decoupleR_Based_组学数据生物活性推断方法评估数据集
数据集概述 本数据集为使用decoupleR工具评估生物活性推断方法性能的支撑数据，包含转录组和磷酸化蛋白质组两类扰动实验数据，涉及转录因子、激酶的敲低与过表达实验，以及对应的调控网络资源和基准测试数据。 文件详解 annotations.xlsx（XLSX格式）：提供实验相关的注释信息，辅助理解样本或数据的背景关联。...
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AAV8_Equine_IL10_马白细胞介素10基因治疗实验数据
数据集概述 本数据集记录了AAV8-Equine-IL10基因治疗对大鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的抑制效果研究数据。内容涵盖临床炎症评分、房水细胞计数、组织病理学分析及基因表达等实验结果，验证了该基因治疗的安全性与有效性，支持其在马及人类复发性葡萄膜炎治疗中的应用研究。 文件详解 说明文档 文件名称：README_file.txt...
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MCE_Based_墨西哥湾与伯利兹洞穴滨珊瑚转录组可塑性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦洞穴滨珊瑚（Montastraea cavernosa）在墨西哥湾及伯利兹中光层珊瑚生态系统（MCEs）的转录组可塑性，包含自然种群观测与移植实验的基因表达、环境参数及共生体叶绿素数据，用于分析珊瑚对不同深度与环境胁迫的适应机制，共11个文件。 文件详解 代码文件（.r格式，共8个） Studivan-and-...
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PRRSV_Based_公猪生殖系统感染与血睾屏障发育损伤研究数据
数据集概述 本数据集为猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染公猪生殖系统及血睾屏障（BTB）发育损伤的实验研究数据，包含血清病毒载量、细胞因子水平、抗氧化指标、组织病理指标及基因表达验证等实验结果，共57个Excel文件，用于揭示PRRSV对公猪生殖系统的致病机制。 文件详解...
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Dryad_Source_Dscam1基因昆虫免疫行为繁殖研究数据
数据集概述 本数据集为研究Down综合征细胞粘附分子1（Dscam1）在昆虫免疫、行为和繁殖中作用的原始数据，来自Dryad平台。研究涉及赤拟谷盗（Tribolium castaneum）和黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）两种模式昆虫，包含基因表达、生存、运动及繁殖相关实验结果，用于分析Dscam1对昆虫适应性相关表型的影响。...
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EPD_Based_人类髓系白血病细胞周期蛋白质组与转录组动态数据
数据集概述 本数据集记录了人类髓系白血病细胞在最小干扰条件下的细胞周期进程中，蛋白质与mRNA表达水平的动态变化。研究通过离心淘洗结合质谱蛋白质组学和RNA-Seq技术，避免人工同步处理，识别了髓系特异性基因表达、不同细胞周期阶段的蛋白质丰度变化、异构体表达及磷酸化修饰，解析了约六千个基因的蛋白与mRNA水平关系。 文件详解 压缩文件...
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Hoxb_Based_神经发育中Hoxb基因转录响应视黄酸信号数据
数据集概述 本数据集围绕脊椎动物神经发育中Hoxb基因对视黄酸（RA）信号的转录响应展开，聚焦神经管头尾轴区域限制性差异。包含6个补充数据集文件，通过小鼠神经干/祖细胞（NSPCs）体外培养实验，揭示不同区域NSPCs对RA信号的响应差异及表观遗传调控机制。 文件详解 文件名称：Supplementary dataset 1.xlsx...
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GSEA_Based自身免疫与自身炎症疾病基因表达富集分析结果数据
数据集概述 本数据集为自身免疫与自身炎症疾病基因表达的基因集富集分析（GSEA）结果。数据按原始数据的GEO登录号分文件夹组织，同一GEO数据系列中涉及多种疾病时，会针对每种疾病单独执行GSEA，以各数据系列中的健康受试者数据为参考。 文件详解 文件名称：Inflammation_GSEA_results.zip 文件格式：ZIP...
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田鼠_Microtus_agrestis_的野生种群免疫学特征数据
数据集概述 本数据集围绕野外田鼠（Microtus agrestis）种群免疫特征的个体差异展开，通过纵向重复捕获数据，结合生活史、感染指标及基因表达水平分析，聚焦IFN-γ、Gata3、IL-10三个免疫基因的表达差异，探索野生动物免疫特征的个体一致性差异，为野生动物寄生与传染病风险研究提供基础数据。 文件详解...
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昼夜节律多物种研究_人类大脑与外周器官昼夜节律时钟相位差异数据存档
数据集概述 本数据集围绕人类大脑与外周器官昼夜节律时钟的相位差异展开，整合了五项公开研究的超一千份样本数据，分析大脑与血液时钟基因表达的相位延迟差异，并扩展至其他哺乳动物器官及视交叉上核（SCN）的对比研究，揭示昼夜节律系统的跨物种与跨组织特征。 文件详解 文件名称：circadian_multispecies.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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OW953_elegans_秀丽隐杆线虫行为实验完整数据集2014
数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫（C.elegans）OW953菌株的行为实验数据，属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为观测结果，包含实验基本信息、视频参数及行为特征数据，可用于分析线虫的运动行为模式。 文件详解 行为数据压缩包...
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Tigriopus_Based加州哲水蚤异域进化转录组分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕海洋桡足类加州哲水蚤（Tigriopus californicus）的异域进化展开，包含转录组全基因组分化与多态性的分析数据。通过对不同分化阶段的种群进行比较，探究非适应性过程（如遗传漂变）与适应性进化对基因组分化模式的影响，揭示进化在基因层面的可预测性。数据集含16个文件，涵盖说明文档与压缩包两类。 文件详解...
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Drosophila_TE_Based转座子_宿主因子互作调控数据
数据集概述 本数据集聚焦黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）中转座子（TEs）的表达调控机制，主要记录不同温度范围（13–29°C）下TE家族的表达动态，分析其温度依赖性调控特征及与宿主反式作用因子的互作关系，为研究TE的转录调控提供基础数据。 文件详解 文件名称：TE_paper_for_dryad.zip...
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expr_repository_干旱胁迫燕麦金属硫蛋白表达分析数据
数据集概述 本数据集包含干旱胁迫处理下燕麦幼苗的基因表达分析结果，聚焦燕麦金属硫蛋白基因在胁迫响应中的表达变化，采用qPCR技术检测，以EIF和HNR基因为内参，支持植物逆境生理学研究。 文件详解 文件名称：expr_repository.xlsx 文件格式：XLSX...
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Parasitism_HIPVs_寄生蜂宿主定位_植物挥发物介导数据
数据集概述 本数据集围绕寄生蜂通过植物挥发物定位宿主的研究，包含实验室与田间实验数据。研究对比两种植食性昆虫（菜粉蝶、大菜粉蝶）被寄生后诱导的植物转录组、代谢组响应，以及超寄生蜂的行为反应。数据可用于分析寄生行为对植物挥发物的调控机制，共含5个文件。 文件详解 qPCR raw data.xlsx 文件格式：XLSX...
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HLA_Based_特应性皮炎HLA基因多态性与表达水平关联研究数据
数据集概述 本数据集包含特应性皮炎遗传关联研究的核心基因型数据，基于GAD（主要队列）和PEER（验证队列）两个队列，提供HLA II类基因2字段分辨率的分型结果，支撑HLA-DP α/β链多态性及DPB1基因3'UTR区域SNP与特应性皮炎关联的分析。 文件详解 文件名称：GAD_Class_II_HLA_genotypes_2field.xlsx...
