BRG1_knockdown_ALCL细胞系转录组差异表达分析数据

数据集概述

本数据集记录了ALCL细胞系中BRG1基因经shRNA敲低后的转录组变化分析结果。通过转染shRNA降低BRG1的转录本和蛋白水平,对72小时后的细胞进行RNA测序,比较乱序shRNA与shRNA5处理组的差异基因表达,发现转录组显著改变,包含下调和上调基因,并通过通路富集分析探究BRG1影响的生理过程。数据集包含1个文件。

文件详解

  • 文件名称:Supplementary Table 1.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:文件为补充表格,推测包含差异基因表达分析结果,可能涵盖基因ID、表达量变化(log2 fold change)、调整后p值(adj. p ≤ 0.05)、基因功能注释等信息;也可能包含通路富集分析结果,如Reactome分析中与细胞周期、表观遗传调控相关的基因列表及富集统计量。

适用场景

  • 癌症基因功能研究:分析BRG1在ALCL细胞系中的转录调控作用及对细胞生理过程的影响。
  • 差异基因表达分析:探究shRNA敲低BRG1后ALCL细胞系中显著差异表达的基因及其功能分类。
  • 通路富集分析应用:研究BRG1调控的信号通路(如细胞周期、表观遗传调控)在癌症发生发展中的机制。
  • 生物标志物筛选:从差异表达基因中筛选ALCL诊断或治疗相关的潜在生物标志物。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 24.26 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。