找到67个数据集

标签: 基因组测序

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  • 苏塞克斯大学果蝇基因型重现性测试数据

    2026年2月15日 30 51 23

    数据集概述 本数据集包含在Sussex LHM黑腹果蝇种群样本中,使用三对半克隆个体进行基因型可重复性测试的代码、日志及结果摘要。通过GATK HaplotypeCaller和Genomestrip完成基因组序列变异的发现与基因分型,利用GATK GenotypeConcordance进行每对半克隆个体间基因型调用的数值比较,共包含2个压缩文件。...
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  • Solidago_Based植物标本基因组测序与物种信号分析数据

    2026年2月9日 30 121 7

    数据集概述 本数据集为Solidago属(菊科)植物标本基因组测序研究成果,通过对1970-2010年采集的95份标本进行基因分型测序,结合UNEAK流程处理获得单核苷酸多态性(SNP)数据,用于评估标本基因组在物种界定与系统发育中的应用价值,共包含20个文件。 文件详解 数据处理配置文件(XML格式)...
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  • BGE_Based生物多样性基因组测序项目样本交付数据

    2026年1月30日 30 55 11

    数据集概述 本数据集为生物多样性基因组欧洲(BGE)项目WP5-T5.6任务下交付给测序合作方的基因组测序样本完整列表,包含样本物种学名、生物样本登录URL、分类信息、采集国家、测序中心及ENA公开元数据链接等核心信息,支持生物多样性基因组研究的样本溯源与管理。 文件详解...
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  • 果蝇实验性杂交育种_染色体倒位与X染色体不相容位点关联数据

    2026年1月30日 30 16 3

    数据集概述 本数据集为果蝇实验渐渗研究数据,围绕D. flavomontana与D. montana两个物种的种间基因流展开,通过回交实验结合基因组测序,分析染色体倒位和X染色体不相容位点对合子后生殖隔离的影响,识别限制或增加基因渐渗的染色体区域,共包含六个相关文件。 文件详解 README_file.txt 文件格式:TXT...
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  • DEE_Based_癫痫脑病基因组测序诊断研究补充数据2021

    2026年1月29日 30 157 27

    数据集概述 本数据集为癫痫脑病(DEE)分子诊断研究的补充资料,包含3份文件,涉及30例经一线检测未确诊的DEE患者家系的全基因组测序(WGS)分析结果,对比WGS与外显子组测序(ES)、多基因 panel(MGP)的诊断效能差异。 文件详解 文件名称:Supplementary_Table_e-1_15012021.docx 文件格式:DOCX...
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  • 金黄色葡萄球菌与秀丽隐杆线虫宿主基因型对病原体进化影响的实验数据

    2026年1月28日 30 36 2

    数据集概述 本数据集记录了金黄色葡萄球菌在野生秀丽隐杆线虫种群中经10轮选择后的进化实验结果,探究宿主基因型和遗传多样性对病原体进化的影响,包含病原体毒力变化、感染性差异及基因组测序数据,涉及4个实验相关文件。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:实验相关说明文档,包含研究背景、实验设计、数据采集方法等信息...
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  • 示例数据集_哥伦巴1000基因组计划人类染色体19单倍型测试数据集

    2026年1月27日 30 13 5

    数据集概述 本数据集为测试用基因组数据,包含来自1000 Genomes Project的人类个体HG00096和HG00097的19号染色体两个单倍型参考序列文件,以及从SRR17981962测序数据中采样得到的10万条双端测序读数文件,所有数据打包为一个压缩文件。 文件详解 压缩包文件 文件名称:test_data.zip 文件格式:ZIP...
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  • Moorea_producens_JHB_海洋蓝细菌代谢组扩展研究数据

    2026年1月26日 30 86 44

    数据集概述 本数据集为海洋蓝细菌Moorea producens JHB菌株的代谢组扩展研究数据。该菌株通过传统技术已发现hectochlorin和jamaicamides类天然产物,本研究结合分子网络、基因组测序及培养基刺激等多方法,揭示更多代谢物并解析生物合成机制,补充其代谢组覆盖度。 文件详解 文件名称:JHB Data.zip 文件格式:ZIP...
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  • Haloarchaea_Based_七株盐古菌基因组测序与比较分析数据

    2026年1月26日 30 146 124

    数据集概述 本数据集包含七株盐古菌(Haloferax和Haloarcula属)的基因组测序数据,测序覆盖度约20倍,组装后平均50个contigs。数据揭示了两属间COG功能组富集差异、DNA代谢相关基因的属特异性扩张及基因水平转移现象,为古菌生物学研究提供支持。 文件详解 文件名称:RAST_Annotations.zip 文件格式:ZIP...
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  • Core_Goodeniaceae_NGS_基因组测序系统发育研究数据

    2026年1月26日 30 147 124

    数据集概述 本数据集包含利用下一代测序技术解析Core Goodeniaceae植物类群系统发育关系的相关数据,涉及24个代表类群的基因组浅层测序(genome skimming)结果,整合了质体编码区(CDS)、核核糖体重复序列(NRR)及核基因G3PDH等序列数据,用于解决该类群系统发育框架的关键节点问题,为分类学修订和花形态研究提供支撑。...
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  • Cytospora_Based_杏仁桃树溃疡病病原菌基因组测序与分析数据

    2026年1月22日 30 138 127

    数据集概述 本数据集包含与杏仁和桃树溃疡病相关的Cytospora sorbicola和Cytospora plurivora菌株的基因组测序及分析数据,涵盖基因组组装序列、蛋白质序列及推定效应因子表格,共9个文件,用于植物病原菌的基因组学研究。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Whole_genome_Based_保护生物学全基因组测序方法分析数据

    2026年1月22日 30 165 36

    数据集概述 本数据集围绕保护生物学领域的全基因组测序方法展开,涵盖高深度单倍型解析/未解析测序、群体混合池测序、低深度群体测序四种技术,分析其在非模式物种中的应用优势、局限及优化建议,为保护遗传学研究提供方法参考。 文件详解 文件名称:data_Genbank_june2017.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • Betula_Based阿拉斯加基奈半岛桦树全基因组测序研究数据2019

    2026年1月21日 30 27 6

    数据集概述 本数据集为阿拉斯加基奈半岛桦树(Betula)的全基因组测序数据,旨在探究1899年被描述后身份仍存疑的Kenai桦树(Betula kenaica)的物种信息。包含2019年8月采集的2份桦树标本(BK01为Betula kenaica、BP01为Betula pendula subsp....
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  • 蓝鱼_Scomber_scombrus_基于大西洋的蓝鱼种群结构研究数据

    2026年1月21日 30 94 30

    数据集概述 本数据集来自大西洋鲭鱼(Scomber scombrus)种群结构研究,包含高质量基因组测序及注释结果(741 Mb),并利用RAD-seq技术进行SNP标记发现与基因分型。研究基于数千个SNP标记分析,结果显示大西洋鲭鱼分为西北大西洋、东北大西洋、地中海三个遗传单元,未发现产卵群体存在遗传分化的证据。数据集包含9个相关文件。 文件详解...
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  • Bartsia_Orobanchaceae_南美物种系统发育基因组研究数据

    2026年1月21日 30 160 95

    数据集概述 本数据集来自论文研究,采用微流控PCR靶标富集与高通量测序技术,解析南美Bartsia属(列当科)物种的系统发育多样性。包含测序数据处理脚本、叶绿体及核基因组分子矩阵等,用于构建系统发育树及相关进化分析。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_Data from Uribe-Convers et al - A...
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  • NGS_Based_目标多重测序技术数据_线粒体与核DNA群体基因组学分析

    2026年1月21日 30 172 62

    数据集概述 本数据集包含目标多重下一代测序技术的相关数据,用于非模式生物的群体基因组分析,支持同时对多重样本的线粒体和核基因座进行重测序。数据覆盖跨物种DNA捕获、线粒体基因组及核基因座的富集测序方法,涉及鲸类和绿海龟等物种的基因组数据,包含27个相关文件。 文件详解 文档文件(.txt)...
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  • 基于年轻倒位的Boechera_stricta多连锁QTL选择杂交区研究数据

    2026年1月20日 30 10 5

    数据集概述 本数据集围绕Boechera stricta中控制重要生态性状的年轻染色体倒位展开,通过遗传图谱、染色体涂染和基因组测序等技术,揭示该倒位在杂交物种形成区的高频率分布及正选择信号,并验证其捕获了多个连锁的物候QTL,为年轻倒位在物种形成早期捕获适应性QTL的机制提供直接证据。 文件详解 文件名称:README_for_Young...
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  • BearUCE_Based_北极熊棕熊黑熊基因组分子系统发育与SNP变异数据

    2026年1月20日 30 45 12

    数据集概述 本数据集基于基因组测序数据,分析北极熊、棕熊和黑熊的分子系统发育关系及SNP变异,平均测序覆盖度25X,鉴定出1380万个SNP,通过UCE序列分析构建系统发育树,还包含336只熊的162个SNP位点基因型数据,共2个文件。 文件详解 BearUCE_with_PartitionsRob.nex 文件格式:NEX...
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  • Bauzà_Ribot_Based_地下甲壳类进化分化与板块构造关联研究数据

    2026年1月20日 30 196 177

    数据集概述 本数据集围绕板块构造与进化分化的关联研究展开,针对Bauzà-Ribot等人关于大西洋岛屿地下甲壳类进化分化的研究结论,通过重新分析其线粒体数据,指出原分析存在的校准、速率建模及替代饱和问题,并推断出更年轻的分化时间节点,质疑板块构造驱动分化的结论。 文件详解 文件名称:README_for_amphipods30_12_rlc3.doc...
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  • Neurogenetic_Based_巴西人群神经遗传风险变异研究数据2025

    2026年1月20日 30 155 97

    数据集概述 本数据集来自2025年Nunes等人的研究,包含对2723名巴西人基因组测序的结果,涉及近900万此前未报道的遗传变异,重点分析了经SIFT、PolyPhen-2、AlphaMissense工具预测为致病性的新型错义变异,发现8个神经遗传疾病相关基因中的13个此类变异,覆盖阿尔茨海默病、帕金森病等多种疾病。 文件详解...
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