BearUCE_Based_北极熊棕熊黑熊基因组分子系统发育与SNP变异数据

数据集概述

本数据集基于基因组测序数据,分析北极熊、棕熊和黑熊的分子系统发育关系及SNP变异,平均测序覆盖度25X,鉴定出1380万个SNP,通过UCE序列分析构建系统发育树,还包含336只熊的162个SNP位点基因型数据,共2个文件。

文件详解

  • BearUCE_with_PartitionsRob.nex
  • 文件格式:NEX
  • 字段映射介绍:包含核基因组中超保守元件(UCE)的共识序列数据,用于分子系统发育分析
  • 162 SNP genotpes.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含来自阿拉斯加和蒙大拿的336只熊(北极熊、棕熊、黑熊)的162个SNP位点基因型数据

适用场景

  • 分子系统发育研究: 分析北极熊、棕熊和黑熊的亲缘关系及进化分支
  • 种群遗传学分析: 研究三种熊的遗传分化及地理种群结构
  • SNP变异研究: 探索熊科动物基因组中SNP的分布特征及物种间差异
  • 进化生物学研究: 为熊科动物的进化历史及适应性进化研究提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 8.06 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
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