找到53个数据集

标签: 基因调控网络

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  • 补充数据_人类肾脏疾病多组学分析

    2026年2月15日 30 174 81

    数据集概述 本数据集为人类肾脏疾病多组学分析的补充数据,包含8个压缩文件,覆盖多组学供体解复用、代码、批量RNA测序、CnR基因组轨道、调控子、峰值位置、小鼠数据集、拟时间和差异表达等内容,支持肾脏疾病相关的炎症和促纤维化管状细胞表型研究。 文件详解 多组学供体解复用文件 文件名称:Multiome donor demultiplexing.zip...
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  • 单细胞基因表达与基因调控网络研究数据

    2026年2月15日 30 173 52

    数据集概述 本数据集包含单细胞基因表达数据与基因调控网络相关内容,以压缩文件的形式存储,共包含两个文件,无明确的训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的划分,可用于生物信息学领域的基因表达分析与调控网络研究。 文件详解 压缩文件包 文件名称:AnomalGRN-main.zip 文件格式:ZIP...
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  • 线虫行为学实验_MT2248品系线虫数据

    2026年2月9日 30 82 44

    数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT2248品系(携带egl-47(n1081)V突变)的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频原始数据及处理后的行为特征数据,可用于研究egl-47基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。 文件详解 行为特征文件:egl-47...
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  • Citrus_甜橙果实脱水复水转录组调控研究数据

    2026年2月9日 30 135 131

    数据集概述 本数据集记录甜橙果实(Citrus sinensis L. Osbeck)在脱水和复水条件下的差异转录组调控情况,重点关注导致果皮损伤的分子响应。通过定制cDNA芯片分析,比较严重水分胁迫与采后湿度变化引发的复水胁迫下的基因表达谱,揭示非冷害果皮凹陷(NCPP)相关的分子机制。 文件详解 Romero et al_Metadata.xls...
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  • CEFCON_Based_单细胞转录组细胞命运调控因子研究数据

    2026年2月8日 30 76 21

    数据集概述 本数据集为论文“Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with...
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  • Dryad_表型可塑性历史加速新环境适应研究数据

    2026年2月1日 30 170 76

    数据集概述 本数据集来自论文“A history of phenotypic plasticity accelerates adaptation to a new...
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  • ZEB1_脂肪生成基因调控网络核心成分识别研究数据

    2026年1月31日 30 107 63

    数据集概述 本数据集围绕脂肪生成基因调控网络展开,通过对小鼠前脂肪细胞中734个转录因子(TF)的过表达筛选,识别出23个新的促脂肪生成TF,并将ZEB1确定为脂肪生成的核心成分。数据包含TF筛选结果、RNA测序、质谱分析及临床数据,支持脂肪细胞分化机制的研究。 文件详解 README文件(共4个) 文件名称:README_for_Table S1 -...
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  • 转录因子与DNA甲基化之间的相互作用_博士论文附录数据

    2026年1月30日 30 164 67

    数据集概述 本数据集为Lin Xiaoxuan博士论文《转录因子与DNA甲基化的相互作用》的附录文件集合,包含3个附录文件,均为Excel格式,无目录结构,主要用于补充论文研究内容,支持对转录因子与DNA甲基化相互作用的研究分析。 文件详解 文件名称:Appendix File 1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • KGE_HGEN_Based基因调控网络多组学关联数据集

    2026年1月30日 30 100 20

    数据集概述 本数据集为KGE-HGEN基因调控网络数据集,包含9个文件,涵盖基因、转录因子(TF)、微小核糖核酸(miRna)的序列信息及相互作用关系数据,可用于生物信息学领域的基因调控网络分析研究。 文件详解 序列信息文件 文件名称:target_id_seq.xlsx、mirna_id_seq.xlsx、tf_id_seq.xlsx...
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  • CRC_Based_结直肠癌差异表达基因与调控网络分析数据

    2026年1月30日 30 181 78

    数据集概述 本数据集为结直肠癌(CRC)研究相关数据,包含通过整合系统生物学方法分析得到的差异表达基因、转录因子及调控网络组件信息,涉及631个疾病进展相关基因、关键转录因子及网络基序,可用于解析CRC关键调控机制。 文件详解 文件名称:CRCData.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • maize_iCRE_map_玉米顺式调控元件整合图谱数据集

    2026年1月29日 30 93 86

    数据集概述 本数据集为玉米顺式调控元件整合图谱相关数据,包含保守非编码序列、可及染色质区域、未甲基化区域及整合顺式调控元件(iCREs)的基因组坐标,覆盖玉米基因组v4和v5版本;同时包含基因调控网络边列表文件及基因本体富集分析结果,支持玉米基因调控机制研究。 文件详解 玉米基因组坐标数据集(Dataset S1相关文件)...
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  • 秀丽隐杆线虫行为数据库_基因敲除株行为实验数据_2010年2月24日

    2026年1月26日 30 110 32

    数据集概述 本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了ZZ15株(lev-8(x15)X基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂平板中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及行为特征数据,用于研究该基因突变体的行为表型。 文件详解 行为特征数据文件 文件名称:acr-13 or lev-8 (x15)X...
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  • D_melanogaster_Based_果蝇精液蛋白表达调控研究数据

    2026年1月26日 30 12 9

    数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇(D. melanogaster)精液蛋白编码基因的表达调控展开研究,聚焦基因调控网络(GRNs)中的微小RNA(miRNA)调控枢纽。通过生物信息学预测与实验验证,探究精液蛋白基因转录后调控机制及其对雄性适应性射精成分调整的作用,为生殖相关基因调控研究提供支持。 文件详解...
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  • Corynebacterium_glutamicum_表达谱汇编数据集

    2026年1月26日 30 94 56

    数据集概述 本数据集是谷氨酸棒杆菌的基因表达谱汇编,包含927个手动整理的基于微阵列的转录谱,覆盖野生型和工程菌株在不同环境条件或基因修饰下的3047个注释基因表达变化。数据已整合为304个微阵列集,分为六类用于差异基因表达分析,是研究该工业氨基酸生产模式微生物转录调控的资源。 文件详解 文件名称:Filtered differential...
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  • Drosophila_Odd_paired_分节频率加倍调控网络研究数据

    2026年1月21日 30 195 117

    数据集概述 本数据集聚焦果蝇分节过程中Odd-paired(Opa/Zic)转录因子调控配对规则基因网络实现频率加倍的机制研究,包含双荧光原位杂交图像数据及说明文档,助力解析果蝇前后轴模式形成的关键调控网络动态变化。 文件详解 README文档 文件名称:README_for_Drosophila_PRG_double_FISH_data.rtf...
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  • Xylem_Based美洲黑杨木质素生物合成关键调控因子系统遗传学分析数据

    2026年1月21日 30 134 26

    数据集概述 本数据集是美洲黑杨木质素生物合成系统遗传学分析的结果数据,通过整合基因组、转录组和表型数据,识别出调控木质素合成的关键转录因子MYB125。数据包含WGCNA分析模块基因列表及绿松石模块基因特征基因连接性信息,支持木质素生物合成通路及次生细胞壁形成机制的研究。 文件详解...
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  • miRNA_mRNA_Based_脂肪酸处理β细胞表达谱及调控网络分析数据

    2026年1月21日 30 26 25

    数据集概述 本数据集为硬脂酸与棕榈酸处理胰腺β细胞后miRNA和mRNA的表达谱及调控网络分析结果,包含差异表达的miRNA、mRNA及其共表达网络信息,涉及656个已知miRNA、1729个新miRNA及63个差异mRNA,为研究硬脂酸诱导β细胞功能障碍的分子机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:Supplementary_Table_1.docx...
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  • SMITE_Based_卵巢子宫内膜异位症上游调控因子HOXC8鉴定研究数据

    2026年1月20日 30 81 10

    数据集概述 本数据集为卵巢子宫内膜异位症上游调控因子研究的补充表格,基于SMITE方法结合转录组数据与基因调控网络数据,鉴定出12个潜在上游调控因子,其中HOXC8在病变间质细胞中高表达并通过激活TGF-ß信号通路诱导细胞增殖、迁移等病理特征。数据集包含5个补充表格文件,支持相关机制验证与分析。 文件详解...
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  • RM2710_snf_11_ok156_V_线虫基因行为实验数据集_2009

    2026年1月20日 30 64 3

    数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RM2710品系(snf-11(ok156)V基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了该品系成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂环境中的行为特征,包含视频追踪原始数据及处理后的行为特征数据,可用于研究snf-11基因对蠕虫行为的影响。 文件详解 行为数据压缩包...
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  • Rhabdomys_pumilio_基于非洲条纹鼠的条纹图案发育机制研究数据

    2026年1月20日 30 95 51

    数据集概述 本数据集围绕啮齿动物条纹图案的发育机制展开,核心研究非洲条纹鼠(Rhabdomys pumilio)周期性背侧条纹的形成原因,涉及黑色素细胞成熟差异、转录因子ALX3对Mitf的调控作用,以及花栗鼠相似条纹模式的独立进化机制,为毛发颜色空间变异及表型 novelty 进化提供数据支持。 文件详解...
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