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UCE_Based_超保守元件目标捕获与测序比较研究数据
2026年1月30日 30 51 12
数据集概述 本数据集为超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序研究相关数据，包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据，涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容，共8个文件，支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。 文件详解 压缩文件（archive_files）...
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Marcussen_et_al_小麦祖先基因组杂交研究数据_压缩包
2026年1月27日 30 132 86
数据集概述 本数据集聚焦于面包小麦祖先基因组的古杂交事件研究，通过分析小麦及五倍体近缘种的基因组组装数据，探究其系统发育历史、进化关系与分化时间，揭示小麦基因组多轮杂交（同倍体与多倍体）的形成机制，为理解小麦基因组的多层次系统发育镶嵌结构提供基础。 文件详解...
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Crotalus_ruber_Pleistocene_红钻响尾蛇种群隔离与二次接触研究数据
2026年1月25日 30 119 66
数据集概述 本数据集围绕下加利福尼亚半岛红钻响尾蛇（Crotalus ruber）的系统发育地理历史展开，通过限制性位点相关DNA序列数据和模型选择方法，验证更新世气候波动导致种群隔离后二次接触的假说，包含种群结构分析、生态位模型等相关研究数据。 文件详解 Harrington_et_al_JBio_R_code.R 文件格式：R...
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ABC_Modelling_加州栎树冰后期分布变化与遗传变异研究数据
2026年1月26日 30 102 25
数据集概述 本数据集针对加州植物区系的峡谷活栎（Quercus chrysolepis），通过生态位模型、种群统计和溯祖模型及ABC模型选择，研究冰后期物种分布变化及干旱的影响，包含微卫星基因型、分布记录和自定义脚本三类文件，共3个文件。 文件详解 文件名称：Microsatellite_genotypes.xlsx 文件格式：XLSX...
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Holocene_基于全新世气候变化的非洲东南部纸莎草遗传多样性研究数据
2026年1月21日 30 43 34
数据集概述 本数据集包含非洲东南部湿地纸莎草（Cyperus papyrus）种群的遗传多样性研究数据，通过微卫星位点分析探究全新世气候变化对种群遗传多样性空间格局及结构的影响，揭示其种群动态与基因流动特征，为湿地植物保护提供科学依据。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Eugongylus_Dryad_澳大利亚石龙子锚定杂交富集法系统发育分析数据
2026年1月20日 30 41 10
数据集概述 本数据集包含澳大利亚Eugongylus组石龙子（Squamata: Scincidae）的系统发育分析数据，涉及锚定杂交富集（AHE）和转录组挖掘两种方法获取的基因位点序列，用于评估不同分类尺度下（属间、种间、种内系统地理）的系统发育信息含量，支持石龙子类群的亲缘关系研究及谱系分化参数推断。 文件详解 README说明文档...
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Crotalus_ruber_Pleistocene_红钻响尾蛇种群隔离与二次接触研究数据
2026年1月17日 0 166 102
数据集概述 本数据集围绕下加利福尼亚半岛红钻响尾蛇（Crotalus ruber）的系统发育地理历史展开，通过限制性位点相关DNA序列数据和模型选择方法，验证更新世气候波动导致种群隔离后二次接触的假说，包含种群结构分析、生态位模型等相关研究数据。 文件详解 Harrington_et_al_JBio_R_code.R 文件格式：R...
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wild_South_American_camelids_Based_遗传多样性与种群历史比较研究数据
2026年1月3日 30 166 119
数据集概述 本数据集围绕南美两种野生骆驼科动物（骆马和原驼）的遗传多样性与种群历史展开，通过线粒体和微卫星遗传标记，分析两者种群内遗传多样性差异、秘鲁分布区的种群结构，以及基于溯祖模型推断的种群瓶颈事件时间与规模，为物种保护管理提供遗传资源依据。 文件详解 文件名称：FINAL_VICUNA_and_GUANACO_msa.xlsx 文件格式：XLSX...
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基因流动下的物种定义研究数据集
2025年12月20日 30 182 94
数据集概述 本数据集围绕“基因流动存在时如何定义物种”这一核心问题展开研究，通过多物种溯祖模型分析基因流动对种内与种间遗传差异的影响，揭示了特定条件下种内遗传相似性低于种间的现象，强调少量基因流动对物种遗传历史的显著作用。 文件详解 文件名称: 2020JiaoDefineSpeciesGeneFlow-SI.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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基因树不一致性_单纯形图与溯祖模型下的统计检验数据集
2025年12月19日 30 190 117
数据集概述 本数据集围绕基因树不一致性问题，介绍了基于四重一致因子的单纯形图可视化工具，用于探索基因树集合的不一致模式，并与溯祖模型（MSC）的预期不一致性对比，同时提供统计检验方法评估数据与模型的契合度。 文件详解 文件名称: SimplexAppendix_Rev.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响数据集
2025年12月14日 30 205 3
数据集概述 该数据集包含论文《多物种溯祖模型下基因组数据贝叶斯分析的测序与基因分型错误影响》中使用的BPP控制文件，围绕物种树推断、MSC-I模型参数估计、MSC-M模型参数估计三类场景设计，提供模拟数据生成及分析所需的控制文件，支持不同错误率与定相策略下的基因组数据分析研究。 文件详解 压缩文件包： A00.I.zip：包含MSC-...
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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集
2025年12月11日 30 89 62
数据集概述 该数据集基于模拟研究，探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据，分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差，为系统发育研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...
