数据集概述
本数据集为超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序研究相关数据，包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据，涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容，共8个文件，支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。
文件详解
- 压缩文件（archive_files）
- 文件名称：interspecies_reduced.zip、orthologs.zip、Supplemental Figures.zip、full.zip、interspecies_full.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含精简种间数据、直系同源基因数据、补充图表、完整数据、完整种间数据等压缩内容
- 文档文件（document_files）
- 文件名称：Supplementary Tables.docx、Supp Methods.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含补充表格文档和补充方法文档
- 数据文件（data_files）
- 文件名称：Supplemental-data-GPhoCS-output.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含GPhoCS分析输出的补充数据
数据来源
论文“Target capture and massively parallel sequencing of ultraconserved elements for comparative studies at shallow evolutionary time scales”
适用场景
- 浅进化时间尺度遗传分析: 利用UCE基因座数据研究物种在近期进化过程中的遗传变异与分化
- 非模式生物比较遗传学研究: 评估超保守元件标记在非模式生物跨类群研究中的适用性
- 物种树构建与界定: 通过UCE数据进行物种系统发育关系重建及物种界定分析
- 溯祖模型与种群历史研究: 结合GPhoCS输出数据探究物种的种群动态和分化时间
- 生态位适应性遗传机制研究: 比较林下与冠层鸟类的遗传分化模式及有效种群大小差异
