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标签: 生物物理模拟

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  • 蛋白质红外光谱预测机器学习协议代码

    2025年12月19日 30 142 80

    数据集概述 该数据集包含用于预测蛋白质红外光谱的机器学习协议相关的模拟数据和代码，支持研究人员通过在线服务使用该协议，代码采用Python和Bash语言编写，涵盖从蛋白质结构处理到红外光谱计算的全流程。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: Code.zip - 文件格式: ZIP (.zip) -...
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  • OmpF通道残基电离预测的恒pH分子动力学模拟输入输出数据集

    2025年12月18日 30 53 9

    数据集概述 本数据集包含用于复现OmpF通道残基电离预测恒pH分子动力学（CpH-MD）模拟的输入文件及部分输出文件，作为预印本研究的补充资源，支持模拟可重复性与进一步分析。 文件详解 文件名称：Arxiu.zip 文件格式：ZIP压缩包 压缩包内包含（位于CpH-MD-DPPC目录）： 参数文件（.mdp格式）：恒pH分子动力学模拟参数配置...
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  • 基于NMR_NOE对距离测量的全原子核酸力场精准优化数据集

    2025年12月11日 30 143 53

    数据集概述 本数据集提供两种优化后的全原子核酸力场文件，基于核磁共振NOE对距离测量结果进行精准优化，以GROMACS格式存储，支持分子动力学模拟研究。 文件详解 文件名称：OL3_vdW7.ff.zip，文件格式：ZIP压缩包，包含GROMACS格式的OL3-vdW7核酸力场文件...
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  • 角膜上皮细胞迁移软活性物质模型研究支持数据集_软件及分析流程

    2025年12月7日 30 164 137

    数据集概述 本数据集为角膜上皮细胞迁移软活性物质模型研究的支持资料，包含实验原始数据、模拟软件及分析流程，覆盖角膜细胞迁移模式观测、模拟及理论验证等内容，为解析角膜上皮组织再生的细胞运动机制提供数据支撑。 文件详解 该数据集包含多个压缩文件及文档，具体说明如下： - 目录与文件： -...
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  • ECC_CHARMM36_POPC双层膜模拟数据集_100脂质_940mM_NaCl_310K_GROMACS5_1_4

    2025年12月6日 30 152 62

    数据集概述 本数据集为ECC-CHARMM36力场下POPC双层膜的分子动力学模拟数据，包含100脂质/叶、940mM NaCl溶液、310K温度条件，由GROMACS 5.1.4生成，是6组模拟中的第6组，用于研究CHARMM力场缩放对离子结合的影响。 文件详解 该数据集包含12个GROMACS格式文件，具体说明如下： - 结构与拓扑文件： -...
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