-
LMAS_Source_微生物群落组装软件基准测试补充材料
2026年1月30日 30 128 89
数据集概述 本数据集为LMAS（自动化工作流程）的补充材料，包含用于基准测试传统及宏基因组原核生物从头组装软件的模拟数据与参考基因组信息。以ZymoBIOMICS微生物群落标准的8个细菌基因组和4个质粒（三重形式）为参考，通过inSilicoSeq生成带或不带错误的均匀分布模拟原始序列数据，共31个文件。 文件详解 表格文件（Tables）...
-
基于真核细胞核外源性DNA序列依赖性活性与区室化研究的数据
2026年1月30日 30 187 102
数据集概述 本数据集围绕真核细胞核中外源性DNA的序列依赖性活性与区室化展开研究。通过将细菌基因组整合到酿酒酵母中，探究DNA序列与染色质组分自发性加载及活性的关系，识别出转录与沉默两种染色质原型，其形成依赖序列组成且不混合，呈现 bipartite 核区室化特征，数据集含17个不同类型文件。 文件详解 文档类文件...
-
ST131_E_coli_Genome_Analysis_Data
2026年1月27日 30 177 141
数据集概述 本数据集为ST131大肠杆菌种群进化分析相关数据，通过整合核心基因、附属基因及调控基因组区域的变异信息，提供细菌种群进化的高分辨率视图。聚焦全球多宿主样本的ST131大肠杆菌谱系，揭示耐药分支的循环亚型及调控区核心基因组替代与附属基因元件的关联。 文件详解 文件名称：ST131GBK.zip 文件格式：ZIP...
-
Dryad_Based_弯曲杆菌宿主特异性因子全基因组关联研究数据
2026年1月27日 30 118 32
数据集概述 本数据集为弯曲杆菌宿主特异性因子的全基因组关联研究数据，包含192株来自不同宿主的弯曲杆菌分离株分析结果，重点识别与牛和鸡宿主适应性相关的基因区域，特别是维生素B5生物合成相关基因，以及宿主饮食适应性的生长差异数据。 文件详解 文件名称：Dryad.zip 文件格式：ZIP...
-
单核增菌属_纤毛菌科_中念珠状链杆菌的系统发育与比较基因组学研究数据
2026年1月26日 30 192 108
数据集概述 本数据集包含Leptotrichiaceae科细菌的系统发育与比较基因组学研究相关数据，涉及20个物种的47个基因组分析，重点研究该科细菌的系统发育关系、基因组结构特征，以及致病菌种Streptobacillus moniliformis的MLVA指纹分型工具开发。数据集通过基因组分析揭示了S....
-
orderedPainting_Based_细菌基因组重组热区高效推断数据
2026年1月21日 30 28 2
数据集概述 本数据集为细菌基因组重组热区推断研究相关数据，基于有序染色算法开发的计算高效方法，识别细菌基因组中DNA频繁转移的“热区”。数据支持分析大肠杆菌和空肠弯曲菌基因组的重组事件，为空肠弯曲菌200个基因组分析结果，可用于原核生物群体基因组重组研究。 文件详解 文件名称：jejuni200_data.zip 文件格式：ZIP...
-
CIRCLES_WP3_S1_Based_植物食物链微生物群细菌基因组原始数据
2026年1月19日 30 117 31
数据集概述 本数据集包含H2020创新行动CIRCLES项目生成的细菌基因组原始读取数据和组装信息，这些细菌基因组代表了植物食物链微生物群中富集的类群。数据集仅包含一个文件，无目录结构，文件类型单一为.xlsx格式。 文件详解 文件名称：CIRCLES_WP3_S1.xlsx 文件格式：XLSX...
-
Comparative_Genomics_Based_七株环境细菌分离株基因组比较分析数据集
2026年1月17日 30 120 13
数据集概述 本数据集包含七株环境来源细菌分离株的比较基因组学分析结果，涉及芳香族化合物、异生物质降解能力及重金属抗性的注释与分析数据。共12个文件，涵盖基因组注释压缩包、BacMet2分析压缩包及基因计数、抗性蛋白统计表格，为环境微生物功能研究提供基础数据。 文件详解 基因组注释文件（RASTtk Annotation）...
-
ProgressiveMauve_Based水稻黄单胞菌PXO35菌株组装变体比对数据
2026年1月14日 30 3 0
数据集概述 本数据集为包含水稻黄单胞菌PXO35菌株8个组装变体的ProgressiveMauve比对结果。这些变体来自不同组装程序和测序技术，主要比对文件为"PXO35_assembly_comparison"，可通过Mauve程序交互查看，数据集仅含1个压缩文件。 文件详解...
-
blaPEC_Genetic_Based_Pectobacterium基因携带区域注释数据
2026年1月13日 30 11 5
数据集概述 本数据集包含Pectobacterium中有时携带blaPEC的区域注释信息。通过提取完整基因组中btsS和glpT之间的DNA序列，使用Prokka（v1.14.5）进行标准参数注释，基因组以原始GenBank组装登录号命名。数据集还包含相关论文系统发育树使用的HTML颜色代码，共295个文件。 文件详解...
-
戈氏拟杆菌_Stenotrophomonas_goyi_补充文件_细菌基因组与基因注释补充数据
2026年1月12日 30 7 4
数据集概述 本数据集包含原手稿“Stenotrophomonas goyi sp. nov., a novel bacterium associated with the alga Chlamydomonas reinhardtii”的两份补充表格，分别为Stenotrophomonas...
-
Baargin_Based_菲律宾三甲医院6株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因组注释与耐药分析数据
2026年1月11日 30 169 0
数据集概述 本数据集包含菲律宾某三甲医院分离的6株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）基因组的注释及耐药基因分析结果，通过Baargin流程完成，含Prokka注释文件和AMRFinderPlus耐药基因分析文件，用于研究MRSA的抗菌药物耐药及噬菌体耐药机制。 文件详解 Prokka Annotation Files.zip 文件格式：ZIP...
-
Zenodo_Coral_Endolith_MAGs_红海造礁珊瑚内生菌基因组数据20211028
2026年1月6日 30 55 15
数据集概述 本数据集包含来自红海两种常见造礁珊瑚（爱德华氏角蜂巢珊瑚和黄滨珊瑚）骨骼中的75个内生菌细菌宏基因组组装基因组（MAGs），旨在为研究珊瑚内生微生物组的功能潜力、能量供应机制及珊瑚白化过程中的作用提供基础数据。 文件详解 元数据文件 文件名称：Zenodo_Coral_Endolith_MAGs_metadata_20211028.xlsx...
-
发酵食品微生物分离株功能注释与生物合成基因簇预测数据集
2025年12月21日 30 168 16
数据集概述 本数据集包含从BacDive数据库获取的约250株发酵食品来源细菌分离株基因组的分析结果，涵盖KEGG功能注释、生物合成基因簇（BGCs）预测及小ORF（smORFs）与切割肽两类肽段预测数据，为研究发酵食品微生物功能提供支持。 文件详解...
-
Enterobacter_roggenkampii_B1_01基因组特征数据集
2025年12月12日 30 130 101
数据集概述 本数据集为MRA文章《Enterobacter roggenkampii菌株B1-01的基因组草图序列》的支撑信息，B1-01是从竹根分离的潜在促生细菌，包含其基因组特征相关的7个文件，支持细菌功能与分类研究。 文件详解 文件名称：Isolation medium for Enterobacter...
-
基于外向配对末端读段的细菌基因组原噬菌体识别与定位R脚本
2025年12月9日 30 127 123
数据集概述 该数据集包含一套R脚本及相关文件，展示如何使用mVIRs软件包的OPR finder功能识别外向配对末端读段（OPRs），并以此在鼠伤寒沙门氏菌LT2中定位p22原噬菌体。数据文件结构简洁，包含脚本源文件、输出文档及输入数据压缩包，为复现相关研究提供完整工具链。 文件详解 OPR_markdown.Rmd：R...
-
金黄色葡萄球菌基因组分型_耐药基因_毒力因子及质粒复制子数据集
2025年12月8日 0 135 82
数据集概述 本数据集包含从NCBI Genbank获取的九万八千九百五十株金黄色葡萄球菌基因组的分析结果，涵盖多位点序列分型（MLST）、克隆复合物（CC）、cgMLST图谱、耐药基因、毒力因子、质粒复制子及CRISPR-Cas系统等信息，为相关基因组流行病学研究提供支持。 文件详解 核心数据文件：...
-
细菌基因组编码的特殊代谢物生物合成多样性纲要数据集
2025年12月6日 30 131 0
数据集概述 本数据集围绕细菌基因组编码的特殊代谢物生物合成多样性展开研究，通过分析约17万个细菌基因组和4.7万个宏基因组组装基因组，揭示不同细菌类群的生物合成潜力，重点识别具有高多样性代谢物合成能力的类群，为抗生素和癌症治疗药物研发提供数据支持。 文件详解 该数据集包含10个文件，具体说明如下： - 表格数据文件: -...
-
口腔微生物液滴测序中间数据集
2025年12月4日 30 124 106
数据集概述 该数据集为口腔生物膜的液滴测序中间数据，包含纳米颗粒液滴测序（NP-DS）和细菌细胞液滴测序（Cell-DS）两种技术的分析结果，支持口腔微生物群落结构与功能的研究。 文件详解 P26-28_MV.zip：压缩文件，包含口腔生物膜纳米颗粒液滴测序（NP-DS）结果，内部子目录包括： Contigs：SPAdes组装器生成的最终序列...
-
泰国东北部社区获得性侵袭性银葡萄球菌ST2250克隆进化与_livestock_associated葡萄球菌基因获取关联数据集
2025年11月27日 30 77 73
数据集概述 该数据集包含泰国东北部社区获得性侵袭性银葡萄球菌ST2250克隆进化研究的泛基因组序列数据，重点关联其与livestock-associated葡萄球菌基因获取的关系，为微生物进化与基因转移研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：gene_in_pan_genome.csv 文件格式：CSV 字段映射：包含Gene（基因名）、Non-...
