数据集概述
本数据集围绕真核细胞核中外源性DNA的序列依赖性活性与区室化展开研究。通过将细菌基因组整合到酿酒酵母中，探究DNA序列与染色质组分自发性加载及活性的关系，识别出转录与沉默两种染色质原型，其形成依赖序列组成且不混合，呈现 bipartite 核区室化特征，数据集含17个不同类型文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：FISH_README.md、references_README.md
- 文件格式：.md
- 字段映射介绍：FISH_README.md说明FISH图像数据信息，包括样本细胞、染色标记及图像类型；references_README.md可能涉及研究相关参考文献信息
- 基因组序列文件
- 文件名称：XVIfMmycot2.fa、XVIfMmycot2'.fa、S288c_Pfalciparum.fa、XVIfMmycot1.fa、S288c.fa、W303_Mmmyco.fa等（共10个）
- 文件格式：.fa
- 字段映射介绍：包含不同生物（如酿酒酵母S288c、细菌等）的基因组序列信息
- 基因注释文件
- 文件名称：S288c.gtf、S288c_Mpneumo.gtf
- 文件格式：.gtf
- 字段映射介绍：提供基因结构注释信息，包括基因位置、转录本等相关注释内容
- 压缩文件
- 文件名称：FISH_Raw_data_Figure3E.zip、FISH_Raw_data_FigureS6C.zip
- 文件格式：.zip
- 字段映射介绍：存储FISH原始图像数据，对应研究中的Figure3E和FigureS6C相关实验图像
- 基因特征文件
- 文件名称：W303_Mmmyco.gff3
- 文件格式：.gff3
- 字段映射介绍：包含基因特征注释信息，如基因、mRNA、外显子等特征的位置及属性
适用场景
- 基因组学研究：分析外源性DNA序列与染色质组分活性的关联及染色质原型形成机制
- 核区室化研究：探究真核细胞核内 bipartite 核区室化的结构与功能特征
- 生物信息学分析：利用基因组序列文件进行序列组成预测及相关生物信息学建模
- 细胞生物学实验验证：基于FISH图像数据验证外源性DNA在细胞核内的区室化分布情况
