数据集 - 海数据

EDU6_C393_1_海胆胚胎纤毛带调控数据集

2026年2月1日 30 191 8

数据集概述本数据集围绕海胆胚胎纤毛带（CB）的调控状态展开，记录了CB四个子域的基因表达特征及边界形成机制。CB是海胆胚胎口外胚层周围的梯形结构，由四类表达独特转录因子的调控域组成，其基因表达受Soxb1因子共同激活。数据集包含实验相关的基因量化代码集和扰动实验网络影响结果，共2个文件。文件详解 README_for_EDU6_C393-1.txt...

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ZEB1_脂肪生成基因调控网络核心成分识别研究数据

2026年1月31日 30 95 86

数据集概述本数据集围绕脂肪生成基因调控网络展开，通过对小鼠前脂肪细胞中734个转录因子（TF）的过表达筛选，识别出23个新的促脂肪生成TF，并将ZEB1确定为脂肪生成的核心成分。数据包含TF筛选结果、RNA测序、质谱分析及临床数据，支持脂肪细胞分化机制的研究。文件详解 README文件（共4个）文件名称：README_for_Table S1 -...

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黑客马拉松_TF_TG_关系_注释_黄金标准语料库

2026年1月31日 30 154 139

数据集概述本数据集为TF-TG关系标注黄金标准语料库，包含130个PMID对应的生物医学文献标注数据，以ZIP压缩包形式存储。数据用于基因调控领域的文本标注研究，提供原始摘要文本与BRAT格式的术语及关系标注文件，支持生物医学文本挖掘相关分析。文件详解压缩包文件文件名称：TFTG_V3.zip 文件格式：ZIP...

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maize_mGRN_玉米转录因子结合位点分析数据集

2026年1月31日 30 23 9

数据集概述本数据集围绕玉米转录调控网络展开，包含基因调控网络文件、转录因子数据及功能分析结果，覆盖根、穗、雄穗、种子、茎、叶等组织特异性网络，可用于研究玉米转录因子结合位点及调控机制，为分子生物学研究提供支持。文件详解网络文件...

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Pbf1_Gene_Based玉米驯化基因功能研究数据

2026年1月31日 30 35 34

数据集概述本数据集围绕玉米驯化过程中Pbf1基因的功能展开，包含近等基因系（NILs）的表型数据（如籽粒重量）及RNAseq表达数据等，用于分析玉米与大刍草Pbf1等位基因对表型差异的影响，探究该基因在驯化中的选择机制及潜在调控通路。文件详解文件名称：pdf all trait data.xlsx 文件格式：XLSX...

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转录因子与DNA甲基化之间的相互作用_博士论文附录数据

2026年1月30日 30 192 145

数据集概述本数据集为Lin Xiaoxuan博士论文《转录因子与DNA甲基化的相互作用》的附录文件集合，包含3个附录文件，均为Excel格式，无目录结构，主要用于补充论文研究内容，支持对转录因子与DNA甲基化相互作用的研究分析。文件详解文件名称：Appendix File 1.xlsx 文件格式：XLSX...

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KGE_HGEN_Based基因调控网络多组学关联数据集

2026年1月30日 30 35 31

数据集概述本数据集为KGE-HGEN基因调控网络数据集，包含9个文件，涵盖基因、转录因子（TF）、微小核糖核酸（miRna）的序列信息及相互作用关系数据，可用于生物信息学领域的基因调控网络分析研究。文件详解序列信息文件文件名称：target_id_seq.xlsx、mirna_id_seq.xlsx、tf_id_seq.xlsx...

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Arid3b_Based_B淋巴细胞发育调控机制研究数据

2026年1月30日 30 34 3

数据集概述本数据集围绕Arid3b在B淋巴细胞发育中的关键作用展开，包含流式细胞术（FACs）、逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）及Prism分析等实验数据。通过对比Arid3b敲除小鼠与对照组的细胞群体变化，探究其对淋巴细胞谱系分化的调控机制，数据支持Arid3b对B细胞发育的必要性及与Arid3a的功能差异研究。文件详解文件名称：FACs...

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CRC_Based_结直肠癌差异表达基因与调控网络分析数据

2026年1月30日 30 133 68

数据集概述本数据集为结直肠癌（CRC）研究相关数据，包含通过整合系统生物学方法分析得到的差异表达基因、转录因子及调控网络组件信息，涉及631个疾病进展相关基因、关键转录因子及网络基序，可用于解析CRC关键调控机制。文件详解文件名称：CRCData.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...

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Supp_Data_10_小鼠性腺支持细胞分化基因调控景观数据

2026年1月29日 30 167 113

数据集概述本数据集为论文《The gene regulatory landscape driving mouse gonadal supporting cell differentiation》的补充数据，包含10个Excel文件，内容涉及小鼠性腺支持细胞分化过程中的基因调控相关数据，如差异表达基因、动态染色质可及性区域、PCHi-...

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Pisum_sativum_Based豌豆基因组转录因子数据集

2026年1月28日 30 16 7

数据集概述本数据集包含豌豆（Pisum sativum）基因组中的转录因子（TF）信息，分为两个表格：Table 1记录1807个转录因子的家族预测及与蒺藜苜蓿、拟南芥的BlastP比对结果；Table 2整理豌豆、蒺藜苜蓿和拟南芥转录因子的基因标识、家族预测及描述。数据来自PlantTFDB和对应基因组注释，共1个文件。文件详解...

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NF_κB_GFP_p65_振荡动力学与基因表达模式研究原始数据

2026年1月27日 30 186 172

数据集概述本数据集为NF-κB振荡与基因表达模式研究的原始数据，聚焦转录因子NF-κB的振荡特性及其对基因表达的调控模式，包含基因表达相关的原始芯片数据，可用于分析NF-κB振荡动力学与下游基因表达的关联性。文件详解文件名称：ZambranoRawMicroarrayData.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内为NF-...

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Dynamic_NF_κB_E2F_细胞周期与炎症信号调控研究数据

2026年1月27日 30 33 3

数据集概述本数据集围绕NF-κB与E2F的动态相互作用展开，记录了不同细胞系（HeLa、SK-N-AS等）在炎症信号刺激下的细胞周期与基因表达调控相关数据，涵盖细胞追踪、信号通路响应等实验结果，可用于研究细胞命运决策中炎症信号与增殖进程的优先级和时序调控机制。文件详解细胞实验分析文件（.xls/.xlsx格式，共8个）代表性文件：090909...

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decoupleR_Based_组学数据生物活性推断方法评估数据集

2026年1月27日 30 38 15

数据集概述本数据集为使用decoupleR工具评估生物活性推断方法性能的支撑数据，包含转录组和磷酸化蛋白质组两类扰动实验数据，涉及转录因子、激酶的敲低与过表达实验，以及对应的调控网络资源和基准测试数据。文件详解 annotations.xlsx（XLSX格式）：提供实验相关的注释信息，辅助理解样本或数据的背景关联。...

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Drosophila_TE_Based转座子_宿主因子互作调控数据

2026年1月27日 30 57 27

数据集概述本数据集聚焦黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）中转座子（TEs）的表达调控机制，主要记录不同温度范围（13–29°C）下TE家族的表达动态，分析其温度依赖性调控特征及与宿主反式作用因子的互作关系，为研究TE的转录调控提供基础数据。文件详解文件名称：TE_paper_for_dryad.zip...

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Ascochyta_Based鹰嘴豆抗枯萎病基因组区域关联研究数据

2026年1月27日 30 45 41

数据集概述本数据集基于鹰嘴豆两个重组自交系群体（AB3279和AB482）的基因分型与表型数据，通过GBS技术鉴定与Ascochyta枯萎病抗性相关的基因组区域及QTL。共识别21个抗性相关区域，包含1118个显著关联SNP，涉及319个抗病相关基因，为鹰嘴豆抗病育种提供分子标记支持。文件详解基因型数据文件（CSV格式）...

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Pregnancy_Glut2_妊娠小鼠胰岛β细胞质量变化研究数据

2026年1月27日 30 197 107

数据集概述本数据集来自妊娠小鼠胰岛β细胞质量变化研究，聚焦Ins+Glut2LO细胞对妊娠期间β细胞质量扩张的贡献。通过对不同妊娠天数及产后小鼠胰腺的免疫组化和显微镜观察，分析β细胞质量、增殖及Ins+Glut2LO细胞比例变化，为妊娠期糖尿病发病机制研究提供实验依据。文件详解文件名称：GTT.pzf 文件格式：.pzf...

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Crocus_sativus_Based_藏红花柱头与花组织转录组数据

2026年1月23日 30 77 54

数据集概述本数据集为藏红花（Crocus...

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Haberlea_Based耐脱水植物黑暗适应基因表达研究数据2018

2026年1月26日 30 99 82

数据集概述本数据集记录耐脱水植物Haberlea rhodopensis在30天黑暗处理及复光后的基因表达与代谢变化，探究其适应长期黑暗的分子机制。植物在黑暗中保持绿色存活，转录组分析显示黑暗调控转录因子、自噬相关基因及SnRK1信号通路等表达，代谢组分析揭示氨基酸、脂质等物质变化，支持其黑暗适应策略研究。文件详解文件名称：Haberlea...