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标签: 进化信息

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  • 基于进化信息数据的蛋白质界面残基相互作用预测

    2026年2月1日 30 45 15

    数据集概述 本数据集围绕蛋白质界面残基相互作用预测展开，基于进化信息分析氨基酸序列协变性，验证其在已知结构蛋白质复合物中的接触预测效果，并对未知结构复合物进行预测建模。包含8个文件，涵盖蛋白质结构文件与序列比对压缩包，用于支撑蛋白质复合物结构预测研究。 文件详解 .pdb格式文件（共4个）...
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  • Rosetta_CASP11_未知蛋白质结构预测模型数据

    2026年1月30日 30 195 30

    数据集概述 本数据集包含利用进化信息结合Rosetta程序预测的蛋白质结构模型，涵盖CASP11测试中两个蛋白质家族的高精度从头预测结果，以及原核生物中58个无已知三维结构的大型蛋白质家族的结构模型，涉及超40万个蛋白质，为未知结构蛋白质的功能研究提供基础。 文件详解 文件名称：files_from_web.zip 文件格式：ZIP...
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  • pLMs_Evolutionary_Information_蛋白质语言模型进化信息数据集

    2026年1月13日 30 70 37

    数据集概述 本数据集用于测试进化信息与蛋白质语言模型嵌入结合对二级结构预测的影响，以PDB结构为真值，经PDBredo DB和CATH交叉验证，包含296,596条蛋白质链序列，分TEST100、VAL100、TRAIN6727三个子集，提供序列、二级结构注释、无序区域标注、MSA、PSSM及元文件等资源。 文件详解 验证集注释文件...
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  • 酵母核糖体DNA序列异质性与系统发育分析数据集

    2025年12月22日 30 103 70

    数据集概述 本数据集围绕核糖体DNA（rDNA）序列异质性展开，包含酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其近缘野生种（Saccharomyces paradoxus）的rDNA变异数据，用于评估rDNA位点特征对种内系统发育推断的影响，验证其作为进化信息来源的价值。 文件详解 系统发育树文件（.nex格式）：...
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