数据集概述
本数据集围绕蛋白质界面残基相互作用预测展开，基于进化信息分析氨基酸序列协变性，验证其在已知结构蛋白质复合物中的接触预测效果，并对未知结构复合物进行预测建模。包含8个文件，涵盖蛋白质结构文件与序列比对压缩包，用于支撑蛋白质复合物结构预测研究。
文件详解
- .pdb格式文件（共4个）
- 文件名称：YIA_MNO.pdb、MDTP_MDTN.pdb、METI_METQ.pdb、PFLA_PFLB.pdb
- 文件格式：PDB
- 字段映射介绍：存储蛋白质三维结构信息，包含原子坐标、残基类型、链标识等，用于展示预测的蛋白质复合物模型
- .zip格式文件（共4个）
- 文件名称：ecoli_paired_alignments.zip、PDB_benchmark_alignments_NDX.zip、PDB_benchmark_alignments.zip、ribosome_50S_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含蛋白质序列比对数据，支撑基于进化信息的残基协变性分析
数据来源
论文“Robust and accurate prediction of residue-residue interactions across protein interfaces using evolutionary information”
适用场景
- 蛋白质界面残基相互作用预测: 利用进化信息分析氨基酸协变性，预测蛋白质复合物中的残基接触位点
- 蛋白质复合物结构建模: 基于残基相互作用预测结果，构建未知结构蛋白质复合物的三维模型
- 生物信息学算法验证: 验证伪似然法在蛋白质界面接触预测中的准确性与鲁棒性
- 分子生物学机制研究: 分析蛋白质复合物的组装机制及功能相关性
