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标签: SILVA数据库

过滤结果

  • OTU_Table1_微生物组测序分类数据

    2026年2月2日 30 8 4

    数据集概述 本数据集为未稀释的OTU（操作分类单元）表，包含稀释系列样本和对照样本数据。通过通用原核引物Pro341F和Pro805R扩增16S rRNA基因的V3-V4区域，并使用SILVA数据库进行分类学注释。数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称：OTUTable1.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • 活跃的稀有生物圈证据_淡水原生生物群落活性研究数据

    2026年1月31日 30 70 25

    数据集概述 本数据集聚焦淡水原生生物群落中的活性稀有生物圈，通过焦磷酸测序分析RNA和DNA水平的多样性，揭示稀有原生生物的丰富度、组成及活性特征，为理解湖泊生态系统功能提供数据支持，包含4个核心文件。 文件详解 synthese_OTU_RNA_DNA.csv 文件格式：CSV...
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  • BioRxiv_Preprint_真菌模拟群落基因组与分类数据_v2

    2026年1月26日 30 70 7

    数据集概述 本数据集为BioRxiv预印本相关研究数据，包含5种真菌的全基因组组装序列（.fasta格式），以及模拟群落和共生体样本的物种分类结果（.xlsx格式）。分类基于自定义数据库、NCBI RefSeq和SILVA数据库，覆盖5种引物对的扩增子测序数据，支持真菌物种分类与基因组研究。 文件详解 真菌基因组组装文件（.fasta格式，共5个）...
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  • 海洋线虫DNA元条形码参考数据集补充材料28

    2025年12月23日 30 41 24

    数据集概述 本数据集为海洋线虫DNA元条形码研究的补充材料，包含基于SILVA数据库比对的"过滤"数据集构建的最大似然树，用于评估基于树的分类学分配方法中参考数据集的应用效果。 文件详解 文件名称: oo_85425.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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  • µgreen_db光合微生物23S_rRNA基因参考数据库

    2025年12月23日 30 208 57

    数据集概述 该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库（µgreen-db），用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索，包含约两千余条23S rRNA序列，覆盖四百余种属的光合微生物，可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。 文件详解 数据库压缩包文件：...
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  • 海洋线虫宏条形码研究补充材料14

    2025年12月20日 30 104 51

    数据集概述 本数据集为海洋线虫宏条形码研究的补充材料，包含基于SILVA比对的完整数据集构建的最大似然树图像文件，用于支持树基分类学分配方法的参考数据集评估研究。 文件详解 文件名称: oo_85407.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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  • 海洋线虫DNA元条形码研究参考数据集补充材料35

    2025年12月20日 30 22 18

    数据集概述 本数据集是海洋线虫DNA元条形码研究的补充材料，包含基于SILVA比对的“长”数据集构建的邻接树（Neighbor joining tree），以图片格式呈现，为评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用提供支持。 文件详解 文件名称: oo_85432.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容:...
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  • JEDI_Paper_Based_微生物研究ASV表与流程完整数据集

    2025年12月20日 30 108 34

    数据集概述 本数据集为JEDI论文配套数据，包含多组应用示例的ASV表、改进版nf-core/ampliseq流程文件及SSU rRNA基因特定可变区的 curated参考数据库，覆盖V3V5和V4V9区域，支持微生物群落分析研究。 文件详解 该数据集包含三类核心文件，具体说明如下： - ASV表文件: - AE1-ROSCOFF_ALGAE相关: -...
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  • 海洋线虫宏条形码参考数据集评估补充材料42

    2025年12月16日 30 160 121

    数据集概述 该数据集是一篇关于海洋线虫宏条形码研究论文的补充材料，包含通过基于SILVA的比对方法对"长"数据集进行最大似然法构建的系统发育树图像，为评估树基分类学分配方法中参考数据集的应用提供辅助视觉支持。 文件详解 文件名称: oo_85439.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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  • PIANO_NAZIONALE_FoodMicrobionet_5_1_1_mindata_食品微生物组研究完整数据

    2025年12月14日 30 100 56

    数据集概述 本数据集为FoodMicrobionet v5.1.1版本的mindata文件压缩包，包含可通过NCBI登录号访问单个研究信息的R列表对象，每个对象集成研究信息、样本数据及分类学相关标识，支持微生物组数据分析。 文件详解 文件名称: mindata_FMBN.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容结构:...
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  • 海洋线虫DNA_metabarcoding系统发育树补充材料7

    2025年12月11日 30 171 84

    数据集概述 本数据集为海洋线虫DNA metabarcoding研究的补充材料，包含基于SILVA数据库比对构建的邻接（Neighbor joining）系统发育树图片文件，用于支持树基分类学分配方法的参考数据集评估研究。 文件详解 文件名称: oo_85400.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容:...
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  • 河流生物膜微生物多样性测序技术比较分析数据集

    2025年12月9日 30 114 71

    数据集概述 本数据集为论文《Unlocking River Biofilm Microbial Diversity: Comparative Analysis of Sequencing Technologies》的原始数据，包含EA PacBio样本元数据、合并的长读长与短读长16S...
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